Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DII1

Protein Details
Accession C5DII1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-39STIAEERQKRYTRWKKNSKLYYDYLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022052  Histone-bd_RBBP4_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0E12694g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12265  CAF1C_H4-bd  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MADEATHQETVAPVSTIAEERQKRYTRWKKNSKLYYDYLNTNSTKWPSLTCQLFPDLDLATDEHRILLSSFTSSQVPEDESLYVARLSSMKHIPWSSLNNFDMEEKEFKVDNSLKLPSKSLVEDLRIKFPAGDCNKARYCPSNPDLIGSASSNGSIYVFDRTKHGFARQKLISAGDTDHQIHCQLSTSLEEHKNEAVSLAWNWQRQGLLATSYSHGQVCVWDLEKYDKNSPTLINPLAMSTVDPRGSNEVSWMVRHDSLLAYCSEDNLVGIMDIRNPEKGQSSGSNPHHSNGINTCQFNYHRDMLLCSADSAGRINLWDIRNFTQPLKTLLHNDSISVLQWNPREPTVLATGGQDGGLVKIWDLSQPEGQELIFTHGGHMLGVNDISWDPHDTWMMCSVANDNSIQVWRPSNSLVEPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.14
4 0.16
5 0.24
6 0.27
7 0.3
8 0.4
9 0.44
10 0.47
11 0.57
12 0.65
13 0.67
14 0.74
15 0.81
16 0.82
17 0.87
18 0.93
19 0.9
20 0.87
21 0.79
22 0.77
23 0.71
24 0.66
25 0.59
26 0.54
27 0.47
28 0.41
29 0.42
30 0.36
31 0.34
32 0.3
33 0.29
34 0.29
35 0.37
36 0.39
37 0.36
38 0.36
39 0.37
40 0.36
41 0.33
42 0.29
43 0.21
44 0.17
45 0.16
46 0.14
47 0.12
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.14
65 0.15
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.15
76 0.18
77 0.18
78 0.24
79 0.24
80 0.26
81 0.29
82 0.35
83 0.33
84 0.35
85 0.35
86 0.3
87 0.3
88 0.29
89 0.27
90 0.23
91 0.22
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.23
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.31
101 0.32
102 0.33
103 0.35
104 0.29
105 0.27
106 0.26
107 0.26
108 0.23
109 0.24
110 0.31
111 0.31
112 0.35
113 0.33
114 0.32
115 0.29
116 0.27
117 0.32
118 0.28
119 0.33
120 0.29
121 0.36
122 0.38
123 0.39
124 0.4
125 0.36
126 0.37
127 0.38
128 0.38
129 0.38
130 0.36
131 0.36
132 0.35
133 0.3
134 0.27
135 0.19
136 0.18
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.21
151 0.28
152 0.29
153 0.31
154 0.39
155 0.37
156 0.36
157 0.35
158 0.34
159 0.27
160 0.21
161 0.2
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.11
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.14
211 0.17
212 0.2
213 0.24
214 0.25
215 0.25
216 0.26
217 0.26
218 0.23
219 0.24
220 0.21
221 0.17
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.17
269 0.22
270 0.3
271 0.34
272 0.4
273 0.38
274 0.38
275 0.39
276 0.36
277 0.33
278 0.28
279 0.31
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.29
284 0.3
285 0.3
286 0.32
287 0.27
288 0.25
289 0.25
290 0.27
291 0.24
292 0.25
293 0.22
294 0.17
295 0.15
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.14
304 0.15
305 0.18
306 0.2
307 0.23
308 0.28
309 0.3
310 0.3
311 0.29
312 0.29
313 0.31
314 0.31
315 0.3
316 0.31
317 0.31
318 0.36
319 0.31
320 0.3
321 0.27
322 0.24
323 0.23
324 0.19
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.21
329 0.22
330 0.21
331 0.24
332 0.22
333 0.25
334 0.24
335 0.23
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.17
340 0.16
341 0.13
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.18
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.17
358 0.16
359 0.18
360 0.17
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.18
365 0.16
366 0.16
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.19
379 0.18
380 0.2
381 0.24
382 0.23
383 0.2
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.2
388 0.18
389 0.14
390 0.16
391 0.18
392 0.19
393 0.2
394 0.22
395 0.22
396 0.24
397 0.26
398 0.27