Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CHU7

Protein Details
Accession A0A550CHU7    Localization Confidence High Confidence Score 23.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
971-998RDRKESESAFRKRFKKKFKELYLPPDWPBasic
1119-1146TEEQPAPKRRRTAAKKKGKGQKETQAKTHydrophilic
1164-1196APAKATRKTAKKAGKGAKKKGKRKSGASDDEEDBasic
1215-1242APPPPAASLRPRPKPRPVRRSATNTPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
979-987AFRKRFKKK
1125-1140PKRRRTAAKKKGKGQK
1164-1188APAKATRKTAKKAGKGAKKKGKRKS
1223-1234LRPRPKPRPVRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR001044  XPG/Rad2_eukaryotes  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09904  H3TH_XPG  
cd09868  PIN_XPG_RAD2  
Amino Acid Sequences MGVKSLWQLLAPVGRPVQLDNMEGKTMAIDSSIWIYQFQATMRDKEGRVLVNAHVLGFLRRITKLLFYGIKPVFVFDGGAPAMKRNTLNERRQRKTGAADSHARIAEKLLAAQLRREAVQQAQGTSKKGKGKAPAPDDDDTVYLEDIDPTMQKTPARKPEPQPSQASADKKAKFRDHDIYRLPEVNLEANIAKATSSVLPDPRLATEDELRTFIEEMRPEDLDVTSPAFRELPTEVQYEIVGDLRLKSRQTSYVRLQNMLQTSRTPLDFSKQQIMNLQRRNALTQQLLVTTDTIGQAHISIPVRIASERNKQYMLVKNTSAEGGWVLGIRDTTGTTREKPIEIDQDRPQRPAAAPNAEDSDDDEDMEEVQIDNAPGPSAAMDPDLRSYQGENALAAIGRRHKPAARPKQALFAFDAEENEEMNLIDENVDDDLLAIAIQESLERPAEAAAQFMDTSREHMPTTKVPSTPARPESMLTETPNRLETALSIAIGASARKSTYVGASSKTPSRPTLSTAAFSSTPSFGMFGQPTLLLGADEPQEDVQEAEMQFEEPQAADSYRPTSDVAVDAQVARPLSPTRSVGVSPVAPLDDAVEQDLSGRAASQADSNIEPSDERPTEIPHHCPTPPPATAPPPADLVSSDEDDDMEEVPVPGASIPSIDPHAYLPSPSPLQSPTVTRQPALPSPSPIPSPSPIPSPSPILAPSQPPPRYATPPSPSPERNFEAPTTLLPSPSPIPEDQFAIEVDAVENGRATKHTQLVEQQYLDGPEGMAEEMPQEDWDAAHEMDATAEEGEFARFLSQVKGRDLASVRSEIDDEITSLRQQKTAAMRAAEDVTQQMVSQIMIMLRLFGIPYMTAPMEAEAQCAALVSLGLVDGVITDDSDVFLFGASRVFKNMFNQSKTVECFLAADLQRELGLDRGVLVRLAYLLGSDYVEGLPGVGPVVAMELLREFPGEDGLHKFKDWWGRVQMGRDRKESESAFRKRFKKKFKELYLPPDWPNGAVRDAYYHPAVDESEEPFKWGLPDLDALREFFYGELGWSQTKVDELLLPIISKMGKRGQAQAMNKQSNLNSFLDVSIGTGTHAPRKRQAYASKRLQQVVSDFRRKRNGAAEEQDDADFTEEQPAPKRRRTAAKKKGKGQKETQAKTQEHGDNDDTSAKAGGDGAPAKATRKTAKKAGKGAKKKGKRKSGASDDEEDSEDDYVGDAGDSVEVANGAPPPPAASLRPRPKPRPVRRSATNTPAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.25
4 0.29
5 0.25
6 0.26
7 0.26
8 0.28
9 0.26
10 0.26
11 0.24
12 0.18
13 0.16
14 0.14
15 0.1
16 0.07
17 0.08
18 0.11
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.17
25 0.16
26 0.22
27 0.24
28 0.27
29 0.32
30 0.37
31 0.36
32 0.38
33 0.43
34 0.37
35 0.36
36 0.35
37 0.32
38 0.33
39 0.32
40 0.28
41 0.24
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.28
53 0.3
54 0.28
55 0.37
56 0.36
57 0.38
58 0.34
59 0.33
60 0.27
61 0.23
62 0.23
63 0.14
64 0.18
65 0.14
66 0.17
67 0.16
68 0.18
69 0.19
70 0.2
71 0.22
72 0.22
73 0.33
74 0.4
75 0.5
76 0.58
77 0.67
78 0.7
79 0.75
80 0.75
81 0.69
82 0.69
83 0.67
84 0.65
85 0.61
86 0.63
87 0.59
88 0.6
89 0.56
90 0.48
91 0.39
92 0.33
93 0.3
94 0.23
95 0.22
96 0.2
97 0.22
98 0.22
99 0.25
100 0.26
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.23
105 0.22
106 0.29
107 0.29
108 0.28
109 0.33
110 0.35
111 0.37
112 0.39
113 0.42
114 0.42
115 0.45
116 0.48
117 0.49
118 0.54
119 0.6
120 0.62
121 0.63
122 0.62
123 0.58
124 0.55
125 0.47
126 0.41
127 0.32
128 0.26
129 0.19
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.12
138 0.14
139 0.17
140 0.23
141 0.32
142 0.42
143 0.48
144 0.54
145 0.6
146 0.68
147 0.75
148 0.76
149 0.73
150 0.66
151 0.66
152 0.64
153 0.61
154 0.58
155 0.56
156 0.55
157 0.54
158 0.58
159 0.59
160 0.58
161 0.61
162 0.64
163 0.61
164 0.65
165 0.66
166 0.63
167 0.6
168 0.58
169 0.51
170 0.43
171 0.38
172 0.32
173 0.25
174 0.22
175 0.17
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.11
184 0.14
185 0.17
186 0.19
187 0.21
188 0.22
189 0.21
190 0.22
191 0.2
192 0.21
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.25
197 0.24
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.16
210 0.15
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.19
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.15
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.2
236 0.28
237 0.32
238 0.38
239 0.43
240 0.48
241 0.5
242 0.49
243 0.47
244 0.44
245 0.44
246 0.39
247 0.33
248 0.26
249 0.27
250 0.28
251 0.27
252 0.24
253 0.2
254 0.24
255 0.27
256 0.29
257 0.34
258 0.33
259 0.34
260 0.39
261 0.46
262 0.49
263 0.51
264 0.51
265 0.46
266 0.46
267 0.49
268 0.45
269 0.42
270 0.34
271 0.3
272 0.28
273 0.24
274 0.24
275 0.21
276 0.18
277 0.13
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.18
293 0.19
294 0.28
295 0.33
296 0.35
297 0.35
298 0.35
299 0.41
300 0.47
301 0.47
302 0.41
303 0.37
304 0.35
305 0.35
306 0.34
307 0.27
308 0.19
309 0.12
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.11
321 0.14
322 0.16
323 0.21
324 0.23
325 0.23
326 0.25
327 0.29
328 0.35
329 0.34
330 0.37
331 0.4
332 0.48
333 0.49
334 0.48
335 0.44
336 0.37
337 0.36
338 0.38
339 0.36
340 0.31
341 0.3
342 0.31
343 0.33
344 0.3
345 0.29
346 0.24
347 0.22
348 0.16
349 0.15
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.14
385 0.16
386 0.18
387 0.2
388 0.22
389 0.31
390 0.41
391 0.5
392 0.54
393 0.58
394 0.57
395 0.64
396 0.62
397 0.55
398 0.47
399 0.37
400 0.29
401 0.23
402 0.23
403 0.14
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.08
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.15
447 0.18
448 0.2
449 0.27
450 0.28
451 0.27
452 0.29
453 0.34
454 0.37
455 0.41
456 0.39
457 0.34
458 0.31
459 0.31
460 0.31
461 0.31
462 0.27
463 0.23
464 0.25
465 0.23
466 0.23
467 0.24
468 0.21
469 0.16
470 0.14
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.16
491 0.18
492 0.22
493 0.24
494 0.24
495 0.22
496 0.25
497 0.24
498 0.26
499 0.3
500 0.26
501 0.26
502 0.24
503 0.25
504 0.21
505 0.21
506 0.19
507 0.13
508 0.12
509 0.1
510 0.1
511 0.08
512 0.11
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.1
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.11
564 0.12
565 0.11
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.12
571 0.1
572 0.1
573 0.09
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.12
600 0.11
601 0.12
602 0.11
603 0.14
604 0.19
605 0.21
606 0.25
607 0.21
608 0.24
609 0.23
610 0.25
611 0.26
612 0.25
613 0.24
614 0.22
615 0.23
616 0.24
617 0.27
618 0.27
619 0.25
620 0.21
621 0.21
622 0.18
623 0.16
624 0.15
625 0.13
626 0.12
627 0.11
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.07
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.04
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.09
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.1
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.17
662 0.23
663 0.24
664 0.23
665 0.24
666 0.25
667 0.27
668 0.29
669 0.27
670 0.23
671 0.24
672 0.26
673 0.24
674 0.22
675 0.21
676 0.17
677 0.19
678 0.18
679 0.19
680 0.19
681 0.2
682 0.21
683 0.22
684 0.21
685 0.19
686 0.19
687 0.18
688 0.18
689 0.18
690 0.21
691 0.27
692 0.27
693 0.27
694 0.3
695 0.31
696 0.35
697 0.37
698 0.39
699 0.35
700 0.39
701 0.41
702 0.42
703 0.42
704 0.39
705 0.42
706 0.37
707 0.36
708 0.33
709 0.3
710 0.27
711 0.25
712 0.22
713 0.2
714 0.17
715 0.15
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.13
720 0.15
721 0.11
722 0.13
723 0.13
724 0.15
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.1
729 0.1
730 0.08
731 0.07
732 0.07
733 0.06
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.06
739 0.08
740 0.1
741 0.15
742 0.16
743 0.17
744 0.22
745 0.28
746 0.29
747 0.28
748 0.25
749 0.21
750 0.21
751 0.2
752 0.14
753 0.09
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.05
758 0.04
759 0.04
760 0.04
761 0.05
762 0.05
763 0.04
764 0.04
765 0.04
766 0.05
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.04
782 0.05
783 0.05
784 0.06
785 0.09
786 0.13
787 0.16
788 0.18
789 0.2
790 0.2
791 0.24
792 0.25
793 0.24
794 0.23
795 0.22
796 0.2
797 0.19
798 0.19
799 0.14
800 0.14
801 0.11
802 0.1
803 0.09
804 0.1
805 0.1
806 0.16
807 0.16
808 0.16
809 0.16
810 0.2
811 0.25
812 0.3
813 0.32
814 0.27
815 0.27
816 0.27
817 0.28
818 0.23
819 0.18
820 0.12
821 0.1
822 0.09
823 0.09
824 0.07
825 0.06
826 0.06
827 0.05
828 0.06
829 0.05
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.05
837 0.05
838 0.04
839 0.05
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.08
845 0.11
846 0.11
847 0.11
848 0.09
849 0.09
850 0.09
851 0.08
852 0.08
853 0.04
854 0.04
855 0.03
856 0.03
857 0.03
858 0.03
859 0.02
860 0.02
861 0.02
862 0.03
863 0.03
864 0.03
865 0.03
866 0.04
867 0.04
868 0.04
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.04
873 0.04
874 0.08
875 0.09
876 0.09
877 0.11
878 0.13
879 0.15
880 0.19
881 0.28
882 0.32
883 0.33
884 0.35
885 0.34
886 0.37
887 0.38
888 0.36
889 0.26
890 0.2
891 0.18
892 0.17
893 0.22
894 0.18
895 0.18
896 0.16
897 0.16
898 0.16
899 0.15
900 0.15
901 0.09
902 0.08
903 0.06
904 0.07
905 0.08
906 0.08
907 0.08
908 0.08
909 0.06
910 0.06
911 0.07
912 0.05
913 0.04
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.05
918 0.06
919 0.05
920 0.06
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.04
927 0.04
928 0.03
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.05
934 0.06
935 0.06
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.09
940 0.09
941 0.11
942 0.16
943 0.19
944 0.2
945 0.2
946 0.21
947 0.21
948 0.3
949 0.31
950 0.32
951 0.34
952 0.39
953 0.41
954 0.48
955 0.52
956 0.52
957 0.54
958 0.52
959 0.51
960 0.47
961 0.51
962 0.45
963 0.46
964 0.47
965 0.51
966 0.55
967 0.6
968 0.67
969 0.71
970 0.78
971 0.8
972 0.81
973 0.83
974 0.86
975 0.87
976 0.89
977 0.86
978 0.86
979 0.83
980 0.77
981 0.68
982 0.62
983 0.52
984 0.43
985 0.37
986 0.3
987 0.24
988 0.19
989 0.18
990 0.17
991 0.19
992 0.21
993 0.19
994 0.17
995 0.15
996 0.16
997 0.16
998 0.15
999 0.15
1000 0.15
1001 0.19
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.19
1005 0.19
1006 0.18
1007 0.18
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.17
1011 0.16
1012 0.21
1013 0.21
1014 0.21
1015 0.21
1016 0.2
1017 0.18
1018 0.13
1019 0.13
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.09
1023 0.1
1024 0.1
1025 0.1
1026 0.11
1027 0.1
1028 0.11
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.11
1033 0.13
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.13
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.13
1040 0.16
1041 0.19
1042 0.24
1043 0.26
1044 0.34
1045 0.4
1046 0.47
1047 0.52
1048 0.58
1049 0.62
1050 0.59
1051 0.58
1052 0.54
1053 0.48
1054 0.44
1055 0.43
1056 0.35
1057 0.26
1058 0.23
1059 0.22
1060 0.19
1061 0.17
1062 0.14
1063 0.1
1064 0.09
1065 0.08
1066 0.1
1067 0.11
1068 0.2
1069 0.25
1070 0.28
1071 0.35
1072 0.41
1073 0.46
1074 0.51
1075 0.6
1076 0.61
1077 0.66
1078 0.73
1079 0.74
1080 0.74
1081 0.72
1082 0.65
1083 0.58
1084 0.55
1085 0.55
1086 0.54
1087 0.56
1088 0.55
1089 0.58
1090 0.67
1091 0.65
1092 0.63
1093 0.62
1094 0.6
1095 0.58
1096 0.61
1097 0.58
1098 0.51
1099 0.52
1100 0.47
1101 0.37
1102 0.3
1103 0.24
1104 0.17
1105 0.13
1106 0.18
1107 0.18
1108 0.2
1109 0.28
1110 0.36
1111 0.4
1112 0.47
1113 0.53
1114 0.53
1115 0.63
1116 0.72
1117 0.75
1118 0.77
1119 0.82
1120 0.85
1121 0.88
1122 0.91
1123 0.89
1124 0.87
1125 0.85
1126 0.84
1127 0.84
1128 0.8
1129 0.78
1130 0.78
1131 0.7
1132 0.63
1133 0.63
1134 0.58
1135 0.5
1136 0.5
1137 0.44
1138 0.36
1139 0.37
1140 0.37
1141 0.29
1142 0.24
1143 0.22
1144 0.17
1145 0.14
1146 0.13
1147 0.12
1148 0.14
1149 0.15
1150 0.15
1151 0.18
1152 0.19
1153 0.21
1154 0.24
1155 0.29
1156 0.32
1157 0.4
1158 0.46
1159 0.53
1160 0.61
1161 0.68
1162 0.74
1163 0.79
1164 0.81
1165 0.83
1166 0.87
1167 0.88
1168 0.89
1169 0.9
1170 0.9
1171 0.91
1172 0.89
1173 0.88
1174 0.88
1175 0.87
1176 0.87
1177 0.83
1178 0.78
1179 0.7
1180 0.63
1181 0.55
1182 0.45
1183 0.35
1184 0.26
1185 0.2
1186 0.14
1187 0.12
1188 0.09
1189 0.07
1190 0.07
1191 0.06
1192 0.05
1193 0.05
1194 0.05
1195 0.05
1196 0.05
1197 0.05
1198 0.05
1199 0.07
1200 0.08
1201 0.08
1202 0.09
1203 0.09
1204 0.11
1205 0.13
1206 0.16
1207 0.18
1208 0.26
1209 0.37
1210 0.46
1211 0.57
1212 0.65
1213 0.7
1214 0.79
1215 0.86
1216 0.88
1217 0.89
1218 0.88
1219 0.87
1220 0.87
1221 0.88
1222 0.86