Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DG21

Protein Details
Accession C5DG21    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-144DFMRTKRYTHPNNKTLRKTRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5.5, cyto_mito 4.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
KEGG lth:KLTH0D01782g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MEFNSPQPEHAQLSTVVHPKGTSRLLAALHQQVVGAMAPRSGGPGLGGCSIDSALDEHLIPSPPLSPKMSSVDEGSAAPAAPVAPQVPAESTTALWVKPDWESSRSPESYRSATSGFLSQYRCFDFMRTKRYTHPNNKTLRKTRNYTCSPNYTSGGSDFEKVYRTRRSVKNAENPRTARGHAPAFQEDFTRHGMPSRPATPTNRNTHRKVNSVTSPLGSSAVLGAPQYVPNMSWEKLPDYSPPLSTLPANNKCLKVEWKGSSMDLSADPLRHLLHPAELQLAQILRLPCDLYLDSKRRLFVEKVHRLKQDLPFRRTDAQKACRIDVNKASRLFAAYERIGWLEDENFERFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.3
4 0.28
5 0.27
6 0.27
7 0.31
8 0.3
9 0.24
10 0.2
11 0.24
12 0.25
13 0.27
14 0.31
15 0.3
16 0.29
17 0.27
18 0.25
19 0.21
20 0.21
21 0.18
22 0.15
23 0.09
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.11
33 0.13
34 0.13
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.14
50 0.16
51 0.19
52 0.21
53 0.2
54 0.22
55 0.28
56 0.3
57 0.27
58 0.27
59 0.25
60 0.23
61 0.22
62 0.19
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.17
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.26
91 0.33
92 0.33
93 0.33
94 0.33
95 0.34
96 0.33
97 0.32
98 0.3
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.21
103 0.18
104 0.19
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.2
111 0.22
112 0.27
113 0.3
114 0.38
115 0.39
116 0.39
117 0.44
118 0.54
119 0.61
120 0.63
121 0.66
122 0.66
123 0.72
124 0.79
125 0.8
126 0.8
127 0.79
128 0.75
129 0.72
130 0.7
131 0.71
132 0.68
133 0.66
134 0.62
135 0.59
136 0.56
137 0.52
138 0.47
139 0.38
140 0.32
141 0.26
142 0.25
143 0.18
144 0.16
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.16
149 0.2
150 0.21
151 0.24
152 0.31
153 0.37
154 0.44
155 0.49
156 0.56
157 0.61
158 0.65
159 0.68
160 0.67
161 0.62
162 0.57
163 0.51
164 0.44
165 0.37
166 0.3
167 0.27
168 0.23
169 0.25
170 0.24
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.13
179 0.14
180 0.17
181 0.18
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.25
186 0.3
187 0.37
188 0.42
189 0.48
190 0.54
191 0.57
192 0.58
193 0.65
194 0.64
195 0.61
196 0.57
197 0.54
198 0.49
199 0.47
200 0.44
201 0.35
202 0.31
203 0.26
204 0.23
205 0.16
206 0.11
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.09
218 0.13
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.23
234 0.28
235 0.33
236 0.37
237 0.38
238 0.38
239 0.38
240 0.41
241 0.4
242 0.36
243 0.38
244 0.36
245 0.35
246 0.36
247 0.35
248 0.33
249 0.28
250 0.24
251 0.16
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.13
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.12
270 0.15
271 0.15
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.11
276 0.15
277 0.15
278 0.17
279 0.25
280 0.3
281 0.35
282 0.37
283 0.39
284 0.38
285 0.43
286 0.4
287 0.4
288 0.45
289 0.5
290 0.56
291 0.62
292 0.63
293 0.62
294 0.66
295 0.66
296 0.66
297 0.65
298 0.62
299 0.6
300 0.62
301 0.65
302 0.63
303 0.63
304 0.62
305 0.6
306 0.64
307 0.63
308 0.6
309 0.59
310 0.57
311 0.55
312 0.55
313 0.55
314 0.54
315 0.51
316 0.5
317 0.44
318 0.44
319 0.39
320 0.33
321 0.31
322 0.25
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.23
327 0.21
328 0.2
329 0.15
330 0.17
331 0.19