Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C8G4

Protein Details
Accession A0A550C8G4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-39DLDCAPPPRKRLRTVTPARFLPHydrophilic
422-441APQPALTKKRKRRSSASDMDHydrophilic
579-601REGAKTPSRGRPKSRAASRPGPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-434KKRKRR
573-599GAKQASREGAKTPSRGRPKSRAASRPG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MNPPLFTPSATPPTLRTDLDCAPPPRKRLRTVTPARFLPPDEIQREKAASLSRLFDSWASLEERYSRTLDEDDIIDLREMSFIKDRGILASSPVKQFGVHQPSVDDDEESETPDEQPEEEEEEHGPDESDDELDAFAPKLAAEQAAHQPSLGQPLTEEEITEFMEAEKMRRLIQGEEVDATSDACDDDEGMPPPRTIIELESDDELDDWGMGSEASIIYRVPKEESESDFDALPSPPPARPYPFQLYTPPRSQTSSSLPPPPTPCSEQRSYTQESPAYAPPSSPLPPSSPPTSSSPLAPSSPVKARARFSRTQSSPIKPSRRSSSPAPDDEQTPSSSKLHTPQSTPIPRLDLSKMLSSKRKPRKWTSTVGTPTGVTRNPFDFENTPPEDHSPTRTPAPERAPSAPQMSVKARGKQRATDVSAPQPALTKKRKRRSSASDMDVDEPTDAPPSASADKSEGVGPNTPSHNATGSARPREAGRASPLPVAGRASQPPGPDKASQPPGASKISQPPGESKAPQPPNASKAPQSPSTSKVPQPSGANKARRLPGANKASRPIAYVEIPVPPAHLRHEGAKQASREGAKTPSRGRPKSRAASRPGPASQTRPPSPCQPDTGSRARSSSRARSHRERVLHLYAVLGGTGTNQCARPTSCGCPREAGLGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.33
4 0.32
5 0.35
6 0.4
7 0.46
8 0.43
9 0.48
10 0.53
11 0.57
12 0.62
13 0.65
14 0.67
15 0.68
16 0.73
17 0.75
18 0.8
19 0.83
20 0.8
21 0.77
22 0.73
23 0.66
24 0.59
25 0.53
26 0.5
27 0.48
28 0.45
29 0.47
30 0.45
31 0.46
32 0.46
33 0.4
34 0.36
35 0.33
36 0.31
37 0.29
38 0.3
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.24
43 0.21
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.18
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.2
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.18
69 0.17
70 0.19
71 0.22
72 0.22
73 0.22
74 0.24
75 0.21
76 0.2
77 0.26
78 0.29
79 0.27
80 0.29
81 0.27
82 0.25
83 0.28
84 0.34
85 0.35
86 0.32
87 0.31
88 0.3
89 0.33
90 0.37
91 0.33
92 0.23
93 0.16
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.16
106 0.15
107 0.17
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.14
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.18
132 0.21
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.19
137 0.26
138 0.22
139 0.15
140 0.12
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.1
150 0.07
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.18
158 0.2
159 0.18
160 0.25
161 0.26
162 0.23
163 0.23
164 0.22
165 0.21
166 0.19
167 0.17
168 0.1
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.09
176 0.11
177 0.14
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.08
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.15
211 0.19
212 0.22
213 0.25
214 0.26
215 0.26
216 0.24
217 0.24
218 0.21
219 0.18
220 0.15
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.15
225 0.17
226 0.2
227 0.22
228 0.28
229 0.33
230 0.35
231 0.35
232 0.4
233 0.45
234 0.45
235 0.48
236 0.44
237 0.38
238 0.38
239 0.38
240 0.34
241 0.34
242 0.36
243 0.35
244 0.39
245 0.39
246 0.4
247 0.41
248 0.4
249 0.37
250 0.34
251 0.36
252 0.35
253 0.38
254 0.37
255 0.38
256 0.4
257 0.42
258 0.39
259 0.38
260 0.33
261 0.3
262 0.31
263 0.29
264 0.26
265 0.21
266 0.18
267 0.16
268 0.18
269 0.18
270 0.16
271 0.14
272 0.15
273 0.18
274 0.22
275 0.24
276 0.22
277 0.23
278 0.27
279 0.29
280 0.27
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.21
285 0.21
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.26
290 0.27
291 0.28
292 0.31
293 0.37
294 0.43
295 0.44
296 0.46
297 0.49
298 0.47
299 0.52
300 0.55
301 0.51
302 0.52
303 0.55
304 0.57
305 0.51
306 0.54
307 0.53
308 0.51
309 0.51
310 0.48
311 0.5
312 0.48
313 0.47
314 0.45
315 0.4
316 0.37
317 0.35
318 0.31
319 0.22
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.23
327 0.24
328 0.24
329 0.26
330 0.35
331 0.38
332 0.39
333 0.34
334 0.3
335 0.29
336 0.3
337 0.27
338 0.21
339 0.19
340 0.22
341 0.23
342 0.24
343 0.3
344 0.32
345 0.41
346 0.48
347 0.53
348 0.57
349 0.64
350 0.71
351 0.7
352 0.74
353 0.69
354 0.68
355 0.65
356 0.59
357 0.5
358 0.4
359 0.35
360 0.3
361 0.26
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.23
371 0.24
372 0.23
373 0.22
374 0.24
375 0.24
376 0.23
377 0.25
378 0.22
379 0.22
380 0.24
381 0.27
382 0.27
383 0.3
384 0.35
385 0.35
386 0.35
387 0.36
388 0.35
389 0.35
390 0.35
391 0.31
392 0.26
393 0.26
394 0.25
395 0.3
396 0.31
397 0.36
398 0.38
399 0.43
400 0.45
401 0.44
402 0.48
403 0.47
404 0.48
405 0.47
406 0.45
407 0.43
408 0.43
409 0.4
410 0.34
411 0.31
412 0.28
413 0.31
414 0.38
415 0.43
416 0.5
417 0.61
418 0.69
419 0.72
420 0.79
421 0.8
422 0.81
423 0.79
424 0.74
425 0.69
426 0.62
427 0.57
428 0.48
429 0.39
430 0.29
431 0.2
432 0.15
433 0.11
434 0.09
435 0.07
436 0.07
437 0.1
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.14
444 0.16
445 0.15
446 0.14
447 0.18
448 0.18
449 0.2
450 0.22
451 0.22
452 0.2
453 0.2
454 0.19
455 0.17
456 0.18
457 0.23
458 0.28
459 0.31
460 0.3
461 0.3
462 0.29
463 0.33
464 0.32
465 0.28
466 0.27
467 0.27
468 0.29
469 0.3
470 0.3
471 0.26
472 0.25
473 0.24
474 0.19
475 0.18
476 0.18
477 0.2
478 0.21
479 0.23
480 0.25
481 0.26
482 0.28
483 0.27
484 0.29
485 0.33
486 0.37
487 0.38
488 0.37
489 0.37
490 0.37
491 0.38
492 0.36
493 0.31
494 0.33
495 0.36
496 0.37
497 0.34
498 0.35
499 0.37
500 0.4
501 0.39
502 0.35
503 0.39
504 0.42
505 0.45
506 0.47
507 0.46
508 0.47
509 0.51
510 0.5
511 0.43
512 0.46
513 0.46
514 0.46
515 0.48
516 0.46
517 0.44
518 0.49
519 0.5
520 0.47
521 0.49
522 0.46
523 0.45
524 0.48
525 0.5
526 0.52
527 0.55
528 0.58
529 0.55
530 0.59
531 0.59
532 0.56
533 0.56
534 0.51
535 0.53
536 0.57
537 0.59
538 0.55
539 0.54
540 0.54
541 0.49
542 0.46
543 0.38
544 0.32
545 0.27
546 0.26
547 0.23
548 0.22
549 0.22
550 0.2
551 0.2
552 0.17
553 0.17
554 0.19
555 0.22
556 0.21
557 0.25
558 0.31
559 0.35
560 0.4
561 0.44
562 0.41
563 0.4
564 0.44
565 0.4
566 0.36
567 0.33
568 0.36
569 0.36
570 0.41
571 0.44
572 0.49
573 0.58
574 0.64
575 0.69
576 0.7
577 0.75
578 0.79
579 0.82
580 0.81
581 0.79
582 0.8
583 0.77
584 0.75
585 0.68
586 0.64
587 0.58
588 0.56
589 0.55
590 0.55
591 0.57
592 0.52
593 0.54
594 0.57
595 0.61
596 0.59
597 0.57
598 0.54
599 0.54
600 0.58
601 0.63
602 0.58
603 0.52
604 0.52
605 0.49
606 0.5
607 0.51
608 0.54
609 0.56
610 0.6
611 0.66
612 0.72
613 0.79
614 0.8
615 0.78
616 0.75
617 0.73
618 0.7
619 0.64
620 0.54
621 0.46
622 0.38
623 0.32
624 0.25
625 0.16
626 0.1
627 0.1
628 0.11
629 0.12
630 0.13
631 0.15
632 0.16
633 0.21
634 0.23
635 0.27
636 0.31
637 0.38
638 0.44
639 0.46
640 0.48
641 0.48
642 0.47