Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CIJ6

Protein Details
Accession A0A550CIJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-214SDDERGRSRSRSRSRSRSRSGSRVEHydrophilic
242-262SRSPSRSRSGSRFRSRSRSVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-214RGRSRSRSRSRSRSRSGSRVE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRDAKQIHGQNPQFLVETVIRNRIWESSYWKEHCFALTAESLIDKALELRAIGGVYGNQRPTEFICLLLKLLQIQPEKEILVEYLQADEFKYLRSLAAMYIRMTFRAVDVYDLLEPLLKDYRKIRYRDMSGYRLTFIDEFVDSLLTEERVCDIILPRLQKRETLEENGEIGPRKSRLLDALEGRSDDERGRSRSRSRSRSRSRSGSRVEDRSGSPVRGRSLSRSDRTPSDAGSRYVSRSPSRSRSGSRFRSRSRSVSADRMSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.49
3 0.49
4 0.48
5 0.4
6 0.33
7 0.32
8 0.25
9 0.29
10 0.26
11 0.31
12 0.29
13 0.29
14 0.3
15 0.28
16 0.26
17 0.24
18 0.29
19 0.32
20 0.41
21 0.43
22 0.44
23 0.43
24 0.42
25 0.39
26 0.34
27 0.26
28 0.2
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.1
35 0.1
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.11
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.18
54 0.22
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.14
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.12
110 0.1
111 0.12
112 0.15
113 0.25
114 0.3
115 0.33
116 0.37
117 0.39
118 0.43
119 0.49
120 0.51
121 0.46
122 0.42
123 0.4
124 0.35
125 0.29
126 0.26
127 0.18
128 0.13
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.11
146 0.14
147 0.18
148 0.19
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.28
153 0.31
154 0.32
155 0.34
156 0.34
157 0.3
158 0.31
159 0.29
160 0.27
161 0.21
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.19
170 0.23
171 0.24
172 0.26
173 0.27
174 0.26
175 0.26
176 0.23
177 0.2
178 0.17
179 0.18
180 0.2
181 0.24
182 0.29
183 0.33
184 0.4
185 0.5
186 0.59
187 0.64
188 0.68
189 0.74
190 0.8
191 0.85
192 0.86
193 0.86
194 0.84
195 0.82
196 0.79
197 0.78
198 0.75
199 0.7
200 0.64
201 0.57
202 0.51
203 0.49
204 0.45
205 0.38
206 0.34
207 0.32
208 0.33
209 0.34
210 0.34
211 0.34
212 0.4
213 0.47
214 0.47
215 0.49
216 0.5
217 0.49
218 0.53
219 0.48
220 0.41
221 0.4
222 0.4
223 0.36
224 0.37
225 0.36
226 0.34
227 0.36
228 0.39
229 0.36
230 0.4
231 0.46
232 0.49
233 0.54
234 0.57
235 0.6
236 0.65
237 0.7
238 0.74
239 0.77
240 0.79
241 0.79
242 0.82
243 0.81
244 0.78
245 0.75
246 0.73
247 0.68
248 0.69
249 0.65