FuNGI

A0A550CXT6

Protein Details

Accession

A0A550CXT6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
319-340	EPPKRPTGTKDKKPRAKPETKG	Basic
514-535	EEETPPKKSVKRKAPARDNSYD	Hydrophilic
675-697	RPSATPRPSTTKARKSRPVTIDT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
309-341	HPLPAKPSPPEPPKRPTGTKDKKPRAKPETKGT
496-529	VEVKKPVDEARRHALKREEEETPPKKSVKRKAPA
544-606	RNSKRRKAGDGAARPSATVKKADPVKVKRSDSPPPPPPRSKNPERDALAGLGRIPKSKGRASP
652-655	KKKA

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042065 E3_ELL-like IPR019464 ELL_N IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0008023 C:transcription elongation factor complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10390 ELL

Amino Acid Sequences

MPLPDNQPISVRPNTSEDKHKHAITLRMSEDLIEALMANPQNLSFEFGPTSKNIYVNDQVFGLTMTKEQSPNELFMHMPLHRDKTFKHYADISARFTVSAGSLDEAAKKLRTATDEANKQRQERKIVMLEEPPTTSMTTAKKTKAPARKAAASSSTALARPSSTQHAPPAAPSRPLSAINPDLRYRVVHCLASHNRTPDELVKRVCGHSADESKKNDVHAIMRHVGEAKEGLWQLSSKGWLEVQPFKWSHWSDTDRQLILQKVTAAFKLHKIPEGDPRWENLAQPKPAPVLPPTPAAASKPSVASSSRHPLPAKPSPPEPPKRPTGTKDKKPRAKPETKGTSAKDDRHLAPTASGHAGGVRSKEPPKSLAALPVEPPRPARVEALATTTRKQPGSGYKAPRTLTPPARTLAASDSRASSDELPSVKESARASTSKGPSAARSGAEQSRVASSSTPTPQPQPRERDRVASSAQASRARADSKERPHPSSNTVRAKAVEVKKPVDEARRHALKREEEETPPKKSVKRKAPARDNSYDSSSDDDRVRNSKRRKAGDGAARPSATVKKADPVKVKRSDSPPPPPPRSKNPERDALAGLGRIPKSKGRASPMPAAAPRLTSANSGSSGSSQGHKRRRASTPQYTSSSEDEDEPRPIKKKAAPSGAVPRPSAGSSASSTPRPSATPRPSTTKARKSRPVTIDTVQEEYQHKFLEYMPVALADRKQRVIVERLLDARSDESADEDGLLSEGEGQNLHAKHLRLRGELLDLEKQFMRLAPAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.44
3	0.51
4	0.49
5	0.52
6	0.56
7	0.54
8	0.53
9	0.53
10	0.57
11	0.53
12	0.56
13	0.49
14	0.45
15	0.44
16	0.39
17	0.33
18	0.25
19	0.18
20	0.11
21	0.09
22	0.07
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.1
28	0.12
29	0.12
30	0.18
31	0.14
32	0.16
33	0.18
34	0.19
35	0.21
36	0.21
37	0.27
38	0.24
39	0.27
40	0.26
41	0.29
42	0.36
43	0.36
44	0.35
45	0.29
46	0.26
47	0.23
48	0.23
49	0.18
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.15
54	0.17
55	0.18
56	0.24
57	0.25
58	0.27
59	0.27
60	0.26
61	0.23
62	0.23
63	0.28
64	0.22
65	0.24
66	0.25
67	0.31
68	0.32
69	0.34
70	0.34
71	0.37
72	0.46
73	0.43
74	0.44
75	0.41
76	0.45
77	0.51
78	0.54
79	0.5
80	0.43
81	0.41
82	0.36
83	0.33
84	0.27
85	0.18
86	0.15
87	0.11
88	0.09
89	0.11
90	0.11
91	0.13
92	0.14
93	0.16
94	0.15
95	0.15
96	0.16
97	0.17
98	0.2
99	0.23
100	0.3
101	0.38
102	0.46
103	0.53
104	0.6
105	0.61
106	0.63
107	0.66
108	0.64
109	0.62
110	0.56
111	0.57
112	0.54
113	0.53
114	0.52
115	0.49
116	0.46
117	0.4
118	0.37
119	0.3
120	0.24
121	0.22
122	0.19
123	0.18
124	0.2
125	0.25
126	0.3
127	0.32
128	0.35
129	0.42
130	0.5
131	0.55
132	0.59
133	0.61
134	0.63
135	0.67
136	0.65
137	0.63
138	0.57
139	0.5
140	0.44
141	0.37
142	0.31
143	0.24
144	0.23
145	0.18
146	0.16
147	0.15
148	0.16
149	0.21
150	0.22
151	0.23
152	0.27
153	0.3
154	0.29
155	0.32
156	0.36
157	0.33
158	0.34
159	0.32
160	0.32
161	0.3
162	0.32
163	0.29
164	0.28
165	0.32
166	0.33
167	0.36
168	0.33
169	0.32
170	0.31
171	0.31
172	0.28
173	0.28
174	0.27
175	0.26
176	0.25
177	0.33
178	0.39
179	0.42
180	0.43
181	0.39
182	0.37
183	0.35
184	0.37
185	0.35
186	0.35
187	0.36
188	0.34
189	0.35
190	0.36
191	0.37
192	0.36
193	0.29
194	0.25
195	0.27
196	0.34
197	0.35
198	0.39
199	0.41
200	0.43
201	0.43
202	0.41
203	0.36
204	0.29
205	0.28
206	0.26
207	0.28
208	0.28
209	0.27
210	0.27
211	0.26
212	0.24
213	0.21
214	0.17
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.12
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.1
225	0.11
226	0.12
227	0.14
228	0.18
229	0.24
230	0.24
231	0.3
232	0.3
233	0.3
234	0.37
235	0.35
236	0.34
237	0.35
238	0.37
239	0.35
240	0.41
241	0.45
242	0.38
243	0.38
244	0.39
245	0.33
246	0.29
247	0.26
248	0.2
249	0.17
250	0.18
251	0.18
252	0.17
253	0.16
254	0.18
255	0.24
256	0.23
257	0.25
258	0.26
259	0.27
260	0.35
261	0.38
262	0.39
263	0.34
264	0.34
265	0.35
266	0.33
267	0.33
268	0.31
269	0.33
270	0.3
271	0.3
272	0.3
273	0.27
274	0.28
275	0.28
276	0.22
277	0.19
278	0.19
279	0.21
280	0.2
281	0.19
282	0.19
283	0.18
284	0.18
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.17
293	0.23
294	0.24
295	0.28
296	0.28
297	0.29
298	0.35
299	0.41
300	0.41
301	0.37
302	0.39
303	0.43
304	0.51
305	0.57
306	0.55
307	0.52
308	0.54
309	0.57
310	0.59
311	0.55
312	0.58
313	0.6
314	0.64
315	0.7
316	0.74
317	0.76
318	0.79
319	0.85
320	0.83
321	0.82
322	0.79
323	0.78
324	0.76
325	0.73
326	0.7
327	0.62
328	0.61
329	0.57
330	0.54
331	0.48
332	0.43
333	0.39
334	0.37
335	0.37
336	0.27
337	0.24
338	0.21
339	0.19
340	0.15
341	0.13
342	0.09
343	0.09
344	0.1
345	0.09
346	0.1
347	0.09
348	0.12
349	0.14
350	0.17
351	0.17
352	0.18
353	0.19
354	0.21
355	0.2
356	0.23
357	0.22
358	0.21
359	0.22
360	0.26
361	0.25
362	0.22
363	0.22
364	0.18
365	0.18
366	0.19
367	0.17
368	0.13
369	0.14
370	0.14
371	0.18
372	0.2
373	0.19
374	0.2
375	0.22
376	0.23
377	0.21
378	0.21
379	0.19
380	0.23
381	0.31
382	0.37
383	0.41
384	0.42
385	0.47
386	0.47
387	0.46
388	0.42
389	0.41
390	0.41
391	0.37
392	0.35
393	0.32
394	0.32
395	0.3
396	0.27
397	0.23
398	0.2
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.16
403	0.17
404	0.17
405	0.14
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.13
413	0.15
414	0.15
415	0.14
416	0.16
417	0.16
418	0.18
419	0.24
420	0.26
421	0.24
422	0.26
423	0.25
424	0.23
425	0.26
426	0.24
427	0.18
428	0.17
429	0.19
430	0.19
431	0.2
432	0.19
433	0.16
434	0.16
435	0.16
436	0.15
437	0.12
438	0.11
439	0.14
440	0.16
441	0.18
442	0.18
443	0.23
444	0.28
445	0.35
446	0.41
447	0.44
448	0.49
449	0.54
450	0.54
451	0.56
452	0.53
453	0.5
454	0.44
455	0.4
456	0.35
457	0.3
458	0.32
459	0.29
460	0.27
461	0.24
462	0.25
463	0.22
464	0.21
465	0.25
466	0.29
467	0.33
468	0.43
469	0.46
470	0.49
471	0.52
472	0.53
473	0.53
474	0.55
475	0.57
476	0.55
477	0.52
478	0.48
479	0.45
480	0.45
481	0.47
482	0.44
483	0.41
484	0.36
485	0.36
486	0.36
487	0.38
488	0.38
489	0.38
490	0.35
491	0.34
492	0.39
493	0.46
494	0.46
495	0.48
496	0.51
497	0.48
498	0.5
499	0.48
500	0.43
501	0.39
502	0.48
503	0.48
504	0.46
505	0.44
506	0.43
507	0.45
508	0.5
509	0.56
510	0.56
511	0.62
512	0.67
513	0.74
514	0.81
515	0.84
516	0.84
517	0.8
518	0.74
519	0.67
520	0.61
521	0.51
522	0.41
523	0.36
524	0.29
525	0.26
526	0.23
527	0.22
528	0.21
529	0.27
530	0.33
531	0.38
532	0.46
533	0.51
534	0.57
535	0.62
536	0.64
537	0.63
538	0.65
539	0.66
540	0.66
541	0.63
542	0.58
543	0.52
544	0.47
545	0.43
546	0.39
547	0.3
548	0.25
549	0.21
550	0.23
551	0.29
552	0.36
553	0.43
554	0.47
555	0.54
556	0.6
557	0.63
558	0.63
559	0.63
560	0.65
561	0.64
562	0.66
563	0.67
564	0.68
565	0.72
566	0.74
567	0.74
568	0.76
569	0.77
570	0.78
571	0.78
572	0.74
573	0.75
574	0.69
575	0.66
576	0.57
577	0.5
578	0.41
579	0.31
580	0.28
581	0.24
582	0.22
583	0.2
584	0.2
585	0.21
586	0.25
587	0.3
588	0.34
589	0.36
590	0.43
591	0.47
592	0.53
593	0.52
594	0.53
595	0.49
596	0.48
597	0.4
598	0.34
599	0.3
600	0.23
601	0.21
602	0.17
603	0.17
604	0.15
605	0.16
606	0.16
607	0.16
608	0.14
609	0.16
610	0.16
611	0.19
612	0.24
613	0.32
614	0.4
615	0.47
616	0.52
617	0.58
618	0.65
619	0.7
620	0.73
621	0.75
622	0.75
623	0.74
624	0.73
625	0.68
626	0.64
627	0.56
628	0.49
629	0.39
630	0.33
631	0.3
632	0.28
633	0.3
634	0.28
635	0.31
636	0.32
637	0.33
638	0.36
639	0.38
640	0.46
641	0.5
642	0.57
643	0.54
644	0.57
645	0.66
646	0.66
647	0.64
648	0.54
649	0.46
650	0.39
651	0.37
652	0.31
653	0.22
654	0.18
655	0.17
656	0.22
657	0.24
658	0.25
659	0.26
660	0.26
661	0.27
662	0.27
663	0.3
664	0.35
665	0.41
666	0.48
667	0.51
668	0.57
669	0.61
670	0.69
671	0.74
672	0.74
673	0.75
674	0.76
675	0.81
676	0.79
677	0.84
678	0.81
679	0.76
680	0.72
681	0.65
682	0.63
683	0.56
684	0.54
685	0.44
686	0.41
687	0.38
688	0.35
689	0.34
690	0.27
691	0.25
692	0.21
693	0.22
694	0.27
695	0.25
696	0.24
697	0.21
698	0.22
699	0.23
700	0.24
701	0.27
702	0.25
703	0.29
704	0.29
705	0.3
706	0.31
707	0.36
708	0.39
709	0.4
710	0.36
711	0.37
712	0.39
713	0.38
714	0.35
715	0.31
716	0.27
717	0.23
718	0.2
719	0.16
720	0.14
721	0.15
722	0.14
723	0.13
724	0.12
725	0.11
726	0.1
727	0.09
728	0.07
729	0.1
730	0.1
731	0.1
732	0.1
733	0.11
734	0.18
735	0.18
736	0.22
737	0.23
738	0.24
739	0.3
740	0.37
741	0.41
742	0.37
743	0.4
744	0.39
745	0.39
746	0.41
747	0.39
748	0.39
749	0.35
750	0.35
751	0.33
752	0.31
753	0.27
754	0.25
755	0.25

A0A550CXT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer