Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBF2

Protein Details
Accession C5DBF2    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-77LSVNEIKKRAHDLRKKAKPKGDHTRAHYLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-68KKRAHDLRKKAKPKG
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007231  Nucleoporin_int_Nup93/Nic96  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG lth:KLTH0A02112g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04097  Nic96  
Amino Acid Sequences MHSDKPVSMDTYANNEGVLKGSAKTFGNLIETSKNLPTTSSELGTILLSVNEIKKRAHDLRKKAKPKGDHTRAHYLLAGSGLAIQDVELSLNNLKSRQLIEHNVTNRETDGDLDTYLRTKKDENILSSIEQSLTSAAKDFDNFVNQTFNLDWEQRKDEVRENFGIILKKRRGNDYGKDSLPHPDYPSWGKSGRGILDGDSRLNVNENFATRTKFERYAKIINGFNNARQSGYEFSLAKEISETFSSSAEQAGRQLPEAWSIIEHAQNSTDVVMSSRTFLEKQFLNYVDNLYKKNLNEGLPTNVNKVKSFIDYKLKNPNNTWKYGNLTIVNGVPIWAFIFYLLRAGLTKEALEVAIANKLSFKKVEQSFLTYFKAYATSKDQRLPNEFVSRLHTEYNQHIKNALDGDPFRLAVYKIVGRCDLTRKNISSITLSIEDWLWFHFMLIKQDVSDDDPVYEKYDLKDFQTIVTSYGISRFSSTYLHVLLLSGLYELAVQHATSINEIDAVHLAIALAYHKKLNISHYKSEHDSNLLSEEDGRFEINFAKLLGNYTKSFKFSDPRIAVEYLILIALNGNKDQIEVCHESLRELVLETKEFTILLGKVNRDGSRIPGVIEERHSLLFLSDEQDFLHRITEQAARRADEDGRVFDSLLLYQLADEYDIVIRIVNKLLSDLLSNTDLNQPLLNLDDNNETSPVLIAKKLINVYVNNMEISRKVSSKNKETCLLLLKVVDIRRSFYSQNWQEALSKVEDIDVIPFIDEVSSRRKAQEFSSLSPEIAKNIPNLLIITMTCVSNIVAQLNQSEYHSASKDQQIRALRRLAKSCMIYAGMIQYKMPRETYSVLINLEVHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.21
4 0.2
5 0.2
6 0.14
7 0.12
8 0.14
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.23
18 0.23
19 0.26
20 0.28
21 0.28
22 0.24
23 0.24
24 0.25
25 0.27
26 0.29
27 0.26
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.21
32 0.18
33 0.13
34 0.09
35 0.08
36 0.1
37 0.15
38 0.18
39 0.2
40 0.2
41 0.23
42 0.33
43 0.42
44 0.5
45 0.55
46 0.62
47 0.71
48 0.82
49 0.88
50 0.88
51 0.86
52 0.85
53 0.86
54 0.86
55 0.85
56 0.83
57 0.8
58 0.82
59 0.75
60 0.68
61 0.6
62 0.48
63 0.39
64 0.32
65 0.24
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.18
83 0.2
84 0.23
85 0.27
86 0.32
87 0.36
88 0.44
89 0.48
90 0.5
91 0.48
92 0.44
93 0.38
94 0.32
95 0.27
96 0.21
97 0.19
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.19
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.24
108 0.33
109 0.38
110 0.39
111 0.41
112 0.43
113 0.42
114 0.41
115 0.37
116 0.28
117 0.21
118 0.17
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.15
128 0.2
129 0.2
130 0.2
131 0.22
132 0.21
133 0.23
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.22
138 0.23
139 0.24
140 0.29
141 0.29
142 0.32
143 0.33
144 0.38
145 0.4
146 0.43
147 0.4
148 0.38
149 0.38
150 0.38
151 0.4
152 0.36
153 0.39
154 0.4
155 0.43
156 0.44
157 0.47
158 0.5
159 0.52
160 0.57
161 0.56
162 0.57
163 0.54
164 0.52
165 0.48
166 0.48
167 0.44
168 0.38
169 0.34
170 0.28
171 0.3
172 0.33
173 0.34
174 0.31
175 0.29
176 0.28
177 0.27
178 0.31
179 0.29
180 0.26
181 0.24
182 0.22
183 0.27
184 0.27
185 0.24
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.19
190 0.17
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.18
195 0.19
196 0.21
197 0.2
198 0.24
199 0.27
200 0.32
201 0.34
202 0.38
203 0.43
204 0.48
205 0.51
206 0.52
207 0.51
208 0.45
209 0.49
210 0.43
211 0.4
212 0.38
213 0.34
214 0.28
215 0.25
216 0.26
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.18
221 0.18
222 0.23
223 0.22
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.12
238 0.15
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.15
267 0.15
268 0.17
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.24
274 0.24
275 0.25
276 0.23
277 0.21
278 0.23
279 0.22
280 0.26
281 0.28
282 0.25
283 0.26
284 0.27
285 0.29
286 0.31
287 0.31
288 0.3
289 0.29
290 0.29
291 0.26
292 0.26
293 0.22
294 0.21
295 0.24
296 0.24
297 0.31
298 0.32
299 0.36
300 0.45
301 0.47
302 0.46
303 0.47
304 0.53
305 0.47
306 0.49
307 0.47
308 0.39
309 0.4
310 0.39
311 0.39
312 0.29
313 0.26
314 0.23
315 0.21
316 0.19
317 0.13
318 0.11
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.04
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.17
350 0.19
351 0.24
352 0.23
353 0.28
354 0.29
355 0.32
356 0.33
357 0.25
358 0.23
359 0.18
360 0.21
361 0.16
362 0.16
363 0.21
364 0.24
365 0.27
366 0.32
367 0.35
368 0.34
369 0.39
370 0.4
371 0.37
372 0.36
373 0.34
374 0.3
375 0.32
376 0.31
377 0.27
378 0.24
379 0.22
380 0.19
381 0.25
382 0.32
383 0.28
384 0.26
385 0.26
386 0.25
387 0.25
388 0.25
389 0.2
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.15
406 0.2
407 0.23
408 0.25
409 0.28
410 0.28
411 0.3
412 0.3
413 0.3
414 0.25
415 0.21
416 0.19
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.05
426 0.05
427 0.08
428 0.09
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.12
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.18
449 0.16
450 0.16
451 0.18
452 0.17
453 0.15
454 0.14
455 0.13
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.11
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.1
504 0.17
505 0.26
506 0.31
507 0.36
508 0.39
509 0.43
510 0.44
511 0.45
512 0.39
513 0.32
514 0.26
515 0.2
516 0.19
517 0.16
518 0.13
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.09
524 0.07
525 0.08
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.09
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.15
536 0.18
537 0.19
538 0.21
539 0.22
540 0.23
541 0.26
542 0.26
543 0.35
544 0.33
545 0.34
546 0.35
547 0.33
548 0.31
549 0.26
550 0.23
551 0.13
552 0.11
553 0.08
554 0.04
555 0.04
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.12
565 0.15
566 0.16
567 0.19
568 0.19
569 0.19
570 0.2
571 0.2
572 0.14
573 0.11
574 0.13
575 0.11
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.12
583 0.11
584 0.14
585 0.17
586 0.17
587 0.2
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.23
592 0.22
593 0.25
594 0.25
595 0.22
596 0.22
597 0.23
598 0.24
599 0.26
600 0.23
601 0.19
602 0.19
603 0.18
604 0.15
605 0.13
606 0.12
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.1
615 0.11
616 0.09
617 0.09
618 0.12
619 0.19
620 0.2
621 0.26
622 0.28
623 0.28
624 0.29
625 0.31
626 0.29
627 0.28
628 0.27
629 0.23
630 0.23
631 0.22
632 0.21
633 0.19
634 0.19
635 0.14
636 0.12
637 0.1
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.1
652 0.1
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.12
660 0.14
661 0.14
662 0.14
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.17
667 0.15
668 0.13
669 0.15
670 0.14
671 0.1
672 0.11
673 0.15
674 0.16
675 0.17
676 0.17
677 0.15
678 0.14
679 0.14
680 0.14
681 0.11
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.17
686 0.18
687 0.19
688 0.21
689 0.21
690 0.25
691 0.28
692 0.28
693 0.24
694 0.23
695 0.22
696 0.19
697 0.22
698 0.2
699 0.17
700 0.22
701 0.29
702 0.37
703 0.47
704 0.54
705 0.55
706 0.57
707 0.57
708 0.56
709 0.54
710 0.48
711 0.39
712 0.31
713 0.28
714 0.28
715 0.29
716 0.3
717 0.24
718 0.25
719 0.28
720 0.31
721 0.31
722 0.31
723 0.39
724 0.4
725 0.46
726 0.44
727 0.42
728 0.4
729 0.4
730 0.39
731 0.3
732 0.24
733 0.18
734 0.17
735 0.16
736 0.13
737 0.14
738 0.11
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.08
743 0.08
744 0.09
745 0.09
746 0.15
747 0.2
748 0.21
749 0.25
750 0.29
751 0.31
752 0.33
753 0.41
754 0.4
755 0.4
756 0.46
757 0.43
758 0.4
759 0.41
760 0.38
761 0.31
762 0.28
763 0.26
764 0.2
765 0.21
766 0.22
767 0.19
768 0.19
769 0.17
770 0.16
771 0.13
772 0.16
773 0.15
774 0.14
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.14
779 0.15
780 0.12
781 0.12
782 0.13
783 0.14
784 0.16
785 0.16
786 0.15
787 0.16
788 0.16
789 0.2
790 0.21
791 0.22
792 0.25
793 0.34
794 0.4
795 0.4
796 0.45
797 0.5
798 0.54
799 0.57
800 0.61
801 0.59
802 0.59
803 0.62
804 0.61
805 0.59
806 0.56
807 0.51
808 0.46
809 0.41
810 0.34
811 0.29
812 0.32
813 0.28
814 0.26
815 0.25
816 0.27
817 0.3
818 0.33
819 0.33
820 0.27
821 0.28
822 0.31
823 0.34
824 0.34
825 0.32
826 0.3
827 0.29