Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CQB8

Protein Details
Accession A0A550CQB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
617-645AGERPHRRAAPAPPKKRRKPPAIPVSAGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
620-637RPHRRAAPAPPKKRRKPP
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MSVPTIAMEDDLGIVYVVENAQQFWSELEDVLHFSKDAVPTLSQLDLALKRSLALCAAYHEQYLQTPMQIEHACDLILESELFAFHSERMCEILMGDIQSTTDPHMQLIFYHLLLHYGRRTRHATGTRAEFFRNQKKWQPVLPLLMDHIEVDIDEDAFDIDEDFDYYDQSAASGSSGDGAVAVPVPIEAKLRSLSVKLLYEVCRVQRFNIADLRVFPSQFIDFLFDLVEQTRDMRNDAFNYSVIKLIVALNEQFMVASLQASHTPSPSGSPAPDQEHHRRSSSVKLSIEPEGKNQNRVLSVLMRRLGTSKTFGENVIFMLNRSKRTPEDLTTQLLLLKILYLLFTTKGTEDFFYTNDLFVLVDVFLRELGDLMDVDETDAAHGNVLESLRHTYLRVLHPLLTKTELREVPYKRAQVAYLLESIVSSDGRGGTKEVGPTTRRLAERCLGGDWAHGLRSQRKMKAASDIAAHIPHTSGGAAHMSSSAVHMHAASSSGARPTPHRLTSKSVENLSSTMAGVNIAPPPPLPTTSTFLTSVGGSGLKKSGGLTKSVLVQGARADRAHAHRYQQAAPHDPIAIPVADGMADRESFSPMSISSASSVAESDASVSTVERPYLSAGERPHRRAAPAPPKKRRKPPAIPVSAGLERTSSGAFVQPVKPALRSAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.14
21 0.13
22 0.17
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.22
29 0.21
30 0.17
31 0.16
32 0.2
33 0.19
34 0.22
35 0.22
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.21
40 0.16
41 0.15
42 0.13
43 0.16
44 0.21
45 0.21
46 0.2
47 0.2
48 0.2
49 0.19
50 0.23
51 0.18
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.22
56 0.22
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.15
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.19
96 0.17
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.2
104 0.25
105 0.27
106 0.31
107 0.36
108 0.37
109 0.46
110 0.5
111 0.49
112 0.49
113 0.56
114 0.55
115 0.52
116 0.51
117 0.48
118 0.5
119 0.55
120 0.55
121 0.53
122 0.55
123 0.62
124 0.65
125 0.63
126 0.63
127 0.58
128 0.58
129 0.53
130 0.46
131 0.38
132 0.34
133 0.29
134 0.21
135 0.16
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.25
189 0.26
190 0.29
191 0.28
192 0.28
193 0.3
194 0.3
195 0.3
196 0.32
197 0.3
198 0.25
199 0.27
200 0.3
201 0.25
202 0.23
203 0.2
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.15
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.15
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.19
260 0.22
261 0.28
262 0.35
263 0.39
264 0.4
265 0.4
266 0.38
267 0.36
268 0.41
269 0.4
270 0.38
271 0.34
272 0.33
273 0.34
274 0.37
275 0.39
276 0.31
277 0.28
278 0.31
279 0.31
280 0.32
281 0.31
282 0.28
283 0.25
284 0.25
285 0.23
286 0.19
287 0.21
288 0.21
289 0.22
290 0.21
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.17
295 0.17
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.18
310 0.2
311 0.19
312 0.25
313 0.28
314 0.24
315 0.27
316 0.27
317 0.28
318 0.26
319 0.26
320 0.21
321 0.18
322 0.15
323 0.09
324 0.07
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.05
374 0.06
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.16
381 0.19
382 0.22
383 0.21
384 0.23
385 0.26
386 0.27
387 0.26
388 0.24
389 0.22
390 0.2
391 0.25
392 0.23
393 0.23
394 0.29
395 0.3
396 0.34
397 0.39
398 0.4
399 0.35
400 0.34
401 0.32
402 0.28
403 0.28
404 0.22
405 0.17
406 0.16
407 0.14
408 0.13
409 0.12
410 0.1
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.1
419 0.11
420 0.13
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.2
425 0.23
426 0.27
427 0.27
428 0.27
429 0.3
430 0.29
431 0.3
432 0.29
433 0.27
434 0.22
435 0.2
436 0.19
437 0.17
438 0.14
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.19
443 0.27
444 0.33
445 0.35
446 0.4
447 0.42
448 0.42
449 0.48
450 0.45
451 0.38
452 0.33
453 0.31
454 0.27
455 0.25
456 0.23
457 0.15
458 0.13
459 0.11
460 0.09
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.08
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.15
485 0.21
486 0.28
487 0.33
488 0.37
489 0.38
490 0.44
491 0.48
492 0.54
493 0.51
494 0.47
495 0.42
496 0.39
497 0.36
498 0.31
499 0.26
500 0.18
501 0.13
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.12
511 0.13
512 0.15
513 0.16
514 0.18
515 0.22
516 0.24
517 0.26
518 0.24
519 0.23
520 0.22
521 0.19
522 0.16
523 0.12
524 0.13
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.18
532 0.17
533 0.19
534 0.2
535 0.2
536 0.24
537 0.25
538 0.26
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.23
543 0.24
544 0.2
545 0.2
546 0.23
547 0.3
548 0.34
549 0.33
550 0.33
551 0.36
552 0.4
553 0.42
554 0.43
555 0.44
556 0.45
557 0.43
558 0.4
559 0.37
560 0.33
561 0.3
562 0.26
563 0.19
564 0.13
565 0.11
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.12
578 0.1
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.12
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.12
596 0.13
597 0.14
598 0.13
599 0.13
600 0.15
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.26
605 0.35
606 0.43
607 0.47
608 0.52
609 0.52
610 0.54
611 0.55
612 0.6
613 0.61
614 0.64
615 0.71
616 0.74
617 0.82
618 0.89
619 0.93
620 0.92
621 0.92
622 0.92
623 0.92
624 0.92
625 0.9
626 0.83
627 0.75
628 0.71
629 0.64
630 0.54
631 0.43
632 0.32
633 0.24
634 0.23
635 0.2
636 0.14
637 0.11
638 0.14
639 0.16
640 0.2
641 0.22
642 0.24
643 0.28
644 0.3
645 0.3