Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DN15

Protein Details
Accession C5DN15    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-204QSSHNFKRKAVRIKQRMWWQNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 12.5, nucl 9.5, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038426  Nyv1_longin_sf  
IPR001388  Synaptobrevin-like  
IPR042855  V_SNARE_CC  
IPR019005  Vacuolar_R-SNAR_Nyv1_longi_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG lth:KLTH0G13376g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09426  Nyv1_longin  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd15843  R-SNARE  
Amino Acid Sequences MKEYNVTYLEVIQRGDVVAKYYNDQTSGYGSLGRAGKNATPKVFERLVEELVIPKVVHVEGNKVTKMSTPLLDGFDCYYGTADDATTYVCFSQIDVPKILPLRLLTELKSISNGSDEELAEHVRTIVRQFHEELLTYHDSSTAEATEQDLQDIIQLMNDNIDKFLQRQERVSLLVDRTSKLNQSSHNFKRKAVRIKQRMWWQNVKLCSTLVAVTVLVLFVVVAAVHYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.14
4 0.13
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.23
9 0.24
10 0.23
11 0.23
12 0.22
13 0.21
14 0.21
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.19
19 0.21
20 0.2
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.28
25 0.32
26 0.29
27 0.3
28 0.32
29 0.37
30 0.37
31 0.35
32 0.31
33 0.3
34 0.29
35 0.25
36 0.24
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.14
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.1
46 0.15
47 0.18
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.24
54 0.21
55 0.17
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.13
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.15
88 0.11
89 0.12
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.16
97 0.13
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.17
152 0.22
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.29
157 0.3
158 0.32
159 0.29
160 0.23
161 0.27
162 0.26
163 0.24
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.25
168 0.26
169 0.28
170 0.34
171 0.43
172 0.5
173 0.58
174 0.56
175 0.57
176 0.64
177 0.66
178 0.7
179 0.7
180 0.72
181 0.72
182 0.77
183 0.82
184 0.83
185 0.83
186 0.8
187 0.79
188 0.75
189 0.72
190 0.71
191 0.65
192 0.55
193 0.46
194 0.4
195 0.33
196 0.26
197 0.2
198 0.15
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03