FuNGI

A0A550C3E8

Protein Details

Accession

A0A550C3E8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-102	LGNSKKDGKKPERETQNPTA	Hydrophilic
143-170	LFSPARASSKKKHPSRPKHNMRTTSSTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
150-160	SSKKKHPSRPK

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MCDTPQMQSPATPARLPPPIRRLFMENDSTFVAPEGVYTVTEDHKPAIVLPNQPPATYPTRVRSIVVRFPQPKQGAAPFAQLLGNSKKDGKKPERETQNPTASPREDGVSLSSSDTDDDLPSQTPVDVPAGSPNLSALEQRHLFSPARASSKKKHPSRPKHNMRTTSSTFVTRMQSVEGLTKALQSRQGDTTFLFYNHSKTFVWVEAGAKSKEPLVKITFSAYPTCHDVNASTASPEHIDIVIGFSTGDLVWLGACALVYIPSCSNAHTDPITCRYARLNKGGFITNSPCTAVRWVPSSPTLFLVSHADGTIIVYDKEREDGAFSPQDPAHLSPPPSDGSSSSDSWDPMGDIFVSLPPWHPVSSGPAAPKADKDKAAKNPVSHWRVSRRAVVDFVFAPDVKYVAVVAEDGCLRIIDAISEQLVDCYASYFGALTSVAWSPDGRFIITGGQDDLLTIFSPWEQRVIARCQGHSSFVSSVAFDELRCDGRTYRFGSVGEDNKLILWDFSSGALHRPKYQATHHQRMSMSSTVSLGLRRDKSALYLPSLNSPGVDGDSSPRYHPAPARNDVAVVQPVLVKHLDGDLLGHISFIPRCILTSTRGGHIRLWIRPLALRPRHPRQGHMRAVTTDVEDLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.42
3	0.45
4	0.49
5	0.52
6	0.56
7	0.57
8	0.59
9	0.58
10	0.55
11	0.57
12	0.58
13	0.48
14	0.43
15	0.42
16	0.39
17	0.34
18	0.28
19	0.21
20	0.11
21	0.11
22	0.1
23	0.09
24	0.09
25	0.09
26	0.11
27	0.13
28	0.15
29	0.16
30	0.16
31	0.16
32	0.16
33	0.17
34	0.23
35	0.25
36	0.3
37	0.33
38	0.42
39	0.41
40	0.41
41	0.4
42	0.38
43	0.39
44	0.37
45	0.38
46	0.35
47	0.41
48	0.42
49	0.42
50	0.44
51	0.45
52	0.49
53	0.5
54	0.54
55	0.52
56	0.54
57	0.63
58	0.58
59	0.53
60	0.48
61	0.47
62	0.43
63	0.4
64	0.41
65	0.32
66	0.31
67	0.29
68	0.24
69	0.25
70	0.24
71	0.25
72	0.23
73	0.29
74	0.33
75	0.38
76	0.49
77	0.53
78	0.58
79	0.65
80	0.72
81	0.77
82	0.78
83	0.81
84	0.8
85	0.8
86	0.72
87	0.68
88	0.64
89	0.55
90	0.5
91	0.43
92	0.35
93	0.26
94	0.24
95	0.23
96	0.18
97	0.18
98	0.16
99	0.15
100	0.13
101	0.13
102	0.13
103	0.11
104	0.1
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.1
115	0.1
116	0.14
117	0.15
118	0.16
119	0.15
120	0.14
121	0.14
122	0.14
123	0.16
124	0.13
125	0.18
126	0.19
127	0.2
128	0.21
129	0.23
130	0.23
131	0.22
132	0.28
133	0.26
134	0.32
135	0.35
136	0.4
137	0.45
138	0.55
139	0.64
140	0.66
141	0.72
142	0.75
143	0.83
144	0.88
145	0.91
146	0.92
147	0.92
148	0.93
149	0.9
150	0.86
151	0.83
152	0.76
153	0.71
154	0.61
155	0.53
156	0.45
157	0.4
158	0.36
159	0.29
160	0.25
161	0.2
162	0.19
163	0.17
164	0.19
165	0.15
166	0.14
167	0.13
168	0.15
169	0.15
170	0.16
171	0.2
172	0.19
173	0.21
174	0.24
175	0.25
176	0.23
177	0.22
178	0.24
179	0.2
180	0.19
181	0.19
182	0.16
183	0.2
184	0.19
185	0.21
186	0.18
187	0.18
188	0.2
189	0.18
190	0.19
191	0.16
192	0.16
193	0.17
194	0.21
195	0.2
196	0.18
197	0.17
198	0.18
199	0.19
200	0.19
201	0.2
202	0.19
203	0.2
204	0.21
205	0.23
206	0.23
207	0.22
208	0.23
209	0.2
210	0.18
211	0.21
212	0.21
213	0.18
214	0.16
215	0.15
216	0.15
217	0.17
218	0.15
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.1
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.08
251	0.09
252	0.11
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.14
258	0.18
259	0.2
260	0.18
261	0.18
262	0.22
263	0.28
264	0.3
265	0.35
266	0.32
267	0.32
268	0.35
269	0.36
270	0.31
271	0.27
272	0.27
273	0.21
274	0.19
275	0.18
276	0.16
277	0.14
278	0.16
279	0.14
280	0.12
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.17
285	0.18
286	0.16
287	0.16
288	0.17
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.13
293	0.12
294	0.12
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.08
308	0.08
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.14
313	0.14
314	0.15
315	0.14
316	0.15
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.15
324	0.15
325	0.13
326	0.14
327	0.17
328	0.17
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.1
335	0.07
336	0.07
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.13
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.19
354	0.2
355	0.2
356	0.23
357	0.23
358	0.24
359	0.26
360	0.29
361	0.33
362	0.39
363	0.48
364	0.48
365	0.44
366	0.48
367	0.52
368	0.53
369	0.48
370	0.45
371	0.44
372	0.47
373	0.49
374	0.48
375	0.41
376	0.38
377	0.38
378	0.34
379	0.28
380	0.22
381	0.21
382	0.17
383	0.14
384	0.13
385	0.11
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.04
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.13
428	0.13
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.11
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.17
451	0.22
452	0.28
453	0.29
454	0.29
455	0.32
456	0.33
457	0.34
458	0.3
459	0.28
460	0.22
461	0.21
462	0.21
463	0.16
464	0.16
465	0.15
466	0.14
467	0.11
468	0.12
469	0.12
470	0.14
471	0.15
472	0.16
473	0.16
474	0.2
475	0.26
476	0.28
477	0.29
478	0.29
479	0.29
480	0.31
481	0.35
482	0.36
483	0.34
484	0.3
485	0.27
486	0.24
487	0.25
488	0.21
489	0.14
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.16
497	0.21
498	0.22
499	0.25
500	0.28
501	0.29
502	0.33
503	0.39
504	0.44
505	0.49
506	0.57
507	0.56
508	0.59
509	0.57
510	0.56
511	0.54
512	0.46
513	0.38
514	0.28
515	0.26
516	0.21
517	0.21
518	0.21
519	0.18
520	0.22
521	0.23
522	0.24
523	0.26
524	0.25
525	0.28
526	0.33
527	0.33
528	0.3
529	0.32
530	0.31
531	0.35
532	0.37
533	0.33
534	0.25
535	0.23
536	0.19
537	0.16
538	0.15
539	0.1
540	0.13
541	0.17
542	0.19
543	0.19
544	0.21
545	0.21
546	0.26
547	0.31
548	0.36
549	0.4
550	0.44
551	0.47
552	0.44
553	0.44
554	0.4
555	0.38
556	0.31
557	0.24
558	0.19
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.16
563	0.12
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.09
568	0.1
569	0.09
570	0.11
571	0.11
572	0.1
573	0.09
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.13
578	0.11
579	0.12
580	0.16
581	0.18
582	0.19
583	0.27
584	0.28
585	0.33
586	0.37
587	0.38
588	0.37
589	0.43
590	0.45
591	0.42
592	0.44
593	0.39
594	0.37
595	0.39
596	0.44
597	0.47
598	0.49
599	0.55
600	0.6
601	0.67
602	0.76
603	0.74
604	0.76
605	0.76
606	0.78
607	0.77
608	0.75
609	0.7
610	0.62
611	0.62
612	0.55
613	0.47

A0A550C3E8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer