Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJN9

Protein Details
Accession C5DJN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-199IKQSWHPKRVLAREDRKKRKELWYRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-193KRVLAREDRKKRK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11.5, cyto_nucl 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024388  Ribosomal_L20_mt  
KEGG lth:KLTH0F17952g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12824  MRP-L20  
Amino Acid Sequences MSSIRQLHVSALLRQDVQNTSKNVKKISQLKSVPNLYNSKSSASNYKGALRAKIQPGVYLQTSQASSTGSINSETIPKAFLPKDDPRRRFVQMLRPRENLQSTWAPALHQKKEKSYHLTPEQVAEIQRLRSGNPEKYTRKVLAQQFGVSPFFISLVSSAPESRVAEMAERLEHIKQSWHPKRVLAREDRKKRKELWYRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.28
4 0.29
5 0.31
6 0.32
7 0.36
8 0.39
9 0.42
10 0.42
11 0.41
12 0.47
13 0.5
14 0.52
15 0.56
16 0.57
17 0.6
18 0.65
19 0.68
20 0.62
21 0.58
22 0.56
23 0.48
24 0.48
25 0.43
26 0.37
27 0.33
28 0.32
29 0.34
30 0.32
31 0.34
32 0.3
33 0.33
34 0.36
35 0.35
36 0.37
37 0.33
38 0.36
39 0.35
40 0.38
41 0.34
42 0.3
43 0.3
44 0.3
45 0.28
46 0.22
47 0.19
48 0.17
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.18
69 0.26
70 0.37
71 0.46
72 0.49
73 0.48
74 0.52
75 0.54
76 0.52
77 0.48
78 0.47
79 0.47
80 0.54
81 0.55
82 0.54
83 0.53
84 0.5
85 0.48
86 0.38
87 0.33
88 0.25
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.19
94 0.25
95 0.26
96 0.3
97 0.31
98 0.35
99 0.41
100 0.45
101 0.47
102 0.45
103 0.47
104 0.46
105 0.49
106 0.43
107 0.39
108 0.35
109 0.29
110 0.26
111 0.2
112 0.17
113 0.13
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.2
118 0.25
119 0.29
120 0.32
121 0.4
122 0.41
123 0.45
124 0.5
125 0.44
126 0.43
127 0.45
128 0.46
129 0.44
130 0.42
131 0.4
132 0.36
133 0.37
134 0.33
135 0.25
136 0.2
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.2
162 0.24
163 0.35
164 0.43
165 0.48
166 0.49
167 0.54
168 0.62
169 0.66
170 0.69
171 0.68
172 0.7
173 0.75
174 0.84
175 0.89
176 0.86
177 0.84
178 0.81
179 0.82