Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJN4

Protein Details
Accession C5DJN4    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-216RTEQIPSPPSKKRRKSSRRESLFHPHydrophilic
513-538ITNKAPAKPSNKTKKLFKKPIVGDLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-210PSKKRRKSSRR
526-526K
578-595PKTHRARAGQATEKRGRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011515  Shugoshin_C  
IPR011516  Shugoshin_N  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0045132  P:meiotic chromosome segregation  
KEGG lth:KLTH0F17842g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07557  Shugoshin_C  
PF07558  Shugoshin_N  
Amino Acid Sequences MAKTVRKRGSGTQLQVSPTHDSNDMPQIQQFQDLIDLQKSEFETIRSGYTQQNAQLAKSNSSLMIKVREMDKSVSELIQENVLLRSKLSMKELQFKERLTCHIQVMEKGVLQRFEEILHMFASIRRREGLEPPPENLMERSSFFSEPKSILKRNRASSGGKNPRGSTIAFDETENQVFSPQADRQQENASTRTEQIPSPPSKKRRKSSRRESLFHPSDFEFSDDEENANSSPGMDAVDSPQLPSEPITSNENVELDTARVGMESQQEPVEEPCNLTNSLIDYSIPEEVPEGEQESFSADTSSKVSVYRDNRDILNTRSIAYSTELSSERSPGNQGAAKDSQHPSFIQNSTSSQKKVKHSMKSRGVQKKMIDEVMPTTCGTTSELSDSSRSRRTRGRAINYALPSLRAKMRRPTEKLVDATTVTNIRDLQVVTGRTKSSSKSRDGTPFYDENSVQNLPPQPSNMIPGSDYEKPKNVTPTSHEKPKEASILNDAQESSANVESINVAKLNPLKDITNKAPAKPSNKTKKLFKKPIVGDLGDENSCSLDESSASHSASFRVNEEDLSVFDLLDDLKTNKAPKTHRARAGQATEKRGRKTAFRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.53
4 0.47
5 0.39
6 0.36
7 0.29
8 0.26
9 0.27
10 0.34
11 0.33
12 0.28
13 0.29
14 0.31
15 0.31
16 0.33
17 0.29
18 0.21
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.21
24 0.17
25 0.21
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.23
33 0.21
34 0.23
35 0.24
36 0.27
37 0.29
38 0.29
39 0.34
40 0.32
41 0.31
42 0.37
43 0.35
44 0.34
45 0.32
46 0.3
47 0.26
48 0.27
49 0.28
50 0.23
51 0.26
52 0.24
53 0.26
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.26
60 0.27
61 0.24
62 0.23
63 0.22
64 0.19
65 0.19
66 0.17
67 0.14
68 0.15
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.17
73 0.19
74 0.21
75 0.25
76 0.29
77 0.31
78 0.41
79 0.45
80 0.49
81 0.49
82 0.48
83 0.49
84 0.45
85 0.47
86 0.42
87 0.41
88 0.36
89 0.38
90 0.38
91 0.34
92 0.36
93 0.32
94 0.28
95 0.28
96 0.28
97 0.25
98 0.23
99 0.23
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.13
109 0.2
110 0.19
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.25
115 0.32
116 0.37
117 0.4
118 0.41
119 0.41
120 0.42
121 0.4
122 0.39
123 0.33
124 0.27
125 0.19
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.28
135 0.31
136 0.35
137 0.41
138 0.5
139 0.55
140 0.58
141 0.61
142 0.59
143 0.57
144 0.59
145 0.63
146 0.64
147 0.63
148 0.61
149 0.56
150 0.54
151 0.51
152 0.42
153 0.34
154 0.29
155 0.27
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.23
160 0.24
161 0.21
162 0.15
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.19
169 0.23
170 0.25
171 0.26
172 0.31
173 0.35
174 0.34
175 0.34
176 0.3
177 0.27
178 0.27
179 0.28
180 0.24
181 0.2
182 0.22
183 0.27
184 0.31
185 0.36
186 0.42
187 0.5
188 0.59
189 0.68
190 0.73
191 0.77
192 0.82
193 0.86
194 0.89
195 0.91
196 0.89
197 0.83
198 0.8
199 0.79
200 0.74
201 0.63
202 0.55
203 0.44
204 0.37
205 0.33
206 0.29
207 0.18
208 0.14
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.09
233 0.11
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.15
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.15
293 0.19
294 0.23
295 0.25
296 0.26
297 0.26
298 0.28
299 0.3
300 0.26
301 0.26
302 0.22
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.09
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.11
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.22
326 0.24
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.19
331 0.21
332 0.21
333 0.18
334 0.17
335 0.2
336 0.22
337 0.25
338 0.25
339 0.25
340 0.31
341 0.34
342 0.43
343 0.48
344 0.54
345 0.6
346 0.68
347 0.71
348 0.73
349 0.78
350 0.77
351 0.74
352 0.69
353 0.63
354 0.58
355 0.52
356 0.46
357 0.36
358 0.27
359 0.26
360 0.22
361 0.21
362 0.15
363 0.13
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.15
373 0.16
374 0.19
375 0.26
376 0.26
377 0.28
378 0.34
379 0.39
380 0.46
381 0.54
382 0.57
383 0.57
384 0.61
385 0.64
386 0.59
387 0.56
388 0.46
389 0.39
390 0.31
391 0.26
392 0.28
393 0.25
394 0.28
395 0.34
396 0.42
397 0.49
398 0.55
399 0.59
400 0.6
401 0.61
402 0.6
403 0.53
404 0.46
405 0.38
406 0.33
407 0.28
408 0.24
409 0.17
410 0.17
411 0.15
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.15
417 0.17
418 0.17
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.22
423 0.23
424 0.28
425 0.32
426 0.36
427 0.38
428 0.43
429 0.5
430 0.53
431 0.52
432 0.49
433 0.45
434 0.41
435 0.42
436 0.36
437 0.29
438 0.29
439 0.27
440 0.21
441 0.23
442 0.25
443 0.23
444 0.24
445 0.24
446 0.22
447 0.21
448 0.26
449 0.22
450 0.19
451 0.17
452 0.18
453 0.21
454 0.26
455 0.29
456 0.28
457 0.32
458 0.34
459 0.37
460 0.43
461 0.4
462 0.37
463 0.39
464 0.46
465 0.48
466 0.55
467 0.54
468 0.48
469 0.5
470 0.5
471 0.52
472 0.43
473 0.38
474 0.35
475 0.38
476 0.37
477 0.35
478 0.3
479 0.23
480 0.22
481 0.2
482 0.17
483 0.13
484 0.12
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.1
491 0.09
492 0.12
493 0.17
494 0.18
495 0.19
496 0.2
497 0.21
498 0.25
499 0.33
500 0.34
501 0.4
502 0.41
503 0.41
504 0.48
505 0.52
506 0.55
507 0.57
508 0.63
509 0.64
510 0.71
511 0.75
512 0.77
513 0.82
514 0.86
515 0.87
516 0.85
517 0.84
518 0.8
519 0.82
520 0.78
521 0.67
522 0.58
523 0.51
524 0.47
525 0.37
526 0.32
527 0.23
528 0.17
529 0.16
530 0.15
531 0.12
532 0.08
533 0.08
534 0.1
535 0.15
536 0.18
537 0.19
538 0.18
539 0.18
540 0.2
541 0.24
542 0.23
543 0.2
544 0.22
545 0.22
546 0.21
547 0.23
548 0.22
549 0.18
550 0.2
551 0.18
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.1
557 0.12
558 0.1
559 0.13
560 0.18
561 0.22
562 0.25
563 0.32
564 0.37
565 0.44
566 0.54
567 0.61
568 0.66
569 0.7
570 0.74
571 0.76
572 0.79
573 0.79
574 0.75
575 0.75
576 0.75
577 0.75
578 0.71
579 0.69
580 0.64