Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJM2

Protein Details
Accession C5DJM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-187LLHAPKPNKKWYCCDKCRRQATKKKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lth:KLTH0F17578g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences MDTDVRYTFLDTLDHLPSELIRGLWTLQGLELREDQQRNFVDQEAVKEAQHLERLLRQHREWLEFQKQEMREMAAVRARYEAYEGTVESRGKPSRALRENATAAAAAAEPKPPTPLKIKINLRPSQPEEPRYCVCRDVSYGAMIACDNKRCPTEWFHYGCVGLLHAPKPNKKWYCCDKCRRQATKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.17
6 0.15
7 0.11
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.1
14 0.1
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.22
21 0.24
22 0.23
23 0.28
24 0.28
25 0.29
26 0.28
27 0.27
28 0.25
29 0.24
30 0.27
31 0.25
32 0.24
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.19
37 0.21
38 0.18
39 0.15
40 0.18
41 0.24
42 0.29
43 0.33
44 0.31
45 0.36
46 0.38
47 0.41
48 0.4
49 0.42
50 0.45
51 0.4
52 0.41
53 0.41
54 0.38
55 0.36
56 0.33
57 0.27
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.17
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.2
80 0.21
81 0.28
82 0.32
83 0.34
84 0.32
85 0.36
86 0.37
87 0.33
88 0.3
89 0.2
90 0.15
91 0.13
92 0.1
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.17
102 0.24
103 0.27
104 0.37
105 0.43
106 0.47
107 0.56
108 0.58
109 0.56
110 0.56
111 0.57
112 0.57
113 0.55
114 0.55
115 0.5
116 0.51
117 0.51
118 0.48
119 0.43
120 0.37
121 0.33
122 0.29
123 0.28
124 0.25
125 0.23
126 0.2
127 0.2
128 0.17
129 0.16
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.21
137 0.22
138 0.26
139 0.29
140 0.34
141 0.38
142 0.41
143 0.4
144 0.41
145 0.39
146 0.36
147 0.3
148 0.24
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.21
153 0.27
154 0.33
155 0.38
156 0.48
157 0.53
158 0.55
159 0.63
160 0.68
161 0.73
162 0.77
163 0.83
164 0.84
165 0.86
166 0.92
167 0.93