Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJ80

Protein Details
Accession C5DJ80    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-110LEDRLDRLLKKPKSRRSRRDEDDLEQBasic
277-301AVLDSAKSKKSKKRRTEDDVSGKSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-102LKKPKSRRSR
280-291DSAKSKKSKKRR
360-367AKRTKRTK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG lth:KLTH0F14212g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSSEEPEYSVGLTESHEFDSRDGASEDFGTAQTERQRKRIDMGDSDEEDTVSTEQRLESQRIINAGNDRDLELGLDQSTRRRQELEDRLDRLLKKPKSRRSRRDEDDLEQYLDERILRLKDEMNVAAQRDIETLNRRLEGEDESAVAMEKVKLLPKVVSTLSKAHLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFAALETLPIKTEHLKESGLGKVVIFYTKSKRVEPKLARLADRMVAEWTRPIIGASDNYRDKRVMKLDFDVEQHRKKAVLDSAKSKKSKKRRTEDDVSGKSAYELAAARRNRAAAPSQTTTDYKYAPVSNLNSMPSNLRSSGVGSSLNNSETFKRLNSRLAKRTKRTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.23
7 0.21
8 0.22
9 0.21
10 0.18
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.16
19 0.22
20 0.3
21 0.33
22 0.4
23 0.46
24 0.46
25 0.51
26 0.55
27 0.53
28 0.51
29 0.55
30 0.54
31 0.51
32 0.5
33 0.45
34 0.37
35 0.3
36 0.25
37 0.19
38 0.13
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.16
43 0.2
44 0.22
45 0.24
46 0.27
47 0.28
48 0.3
49 0.31
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.2
58 0.17
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.15
65 0.22
66 0.24
67 0.26
68 0.27
69 0.29
70 0.38
71 0.47
72 0.51
73 0.52
74 0.52
75 0.53
76 0.56
77 0.55
78 0.5
79 0.5
80 0.48
81 0.5
82 0.57
83 0.65
84 0.71
85 0.81
86 0.85
87 0.85
88 0.89
89 0.85
90 0.85
91 0.81
92 0.74
93 0.71
94 0.63
95 0.54
96 0.43
97 0.37
98 0.27
99 0.22
100 0.18
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.16
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.21
126 0.2
127 0.17
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.21
150 0.21
151 0.18
152 0.18
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.15
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.16
214 0.23
215 0.26
216 0.29
217 0.36
218 0.4
219 0.49
220 0.52
221 0.56
222 0.58
223 0.59
224 0.57
225 0.51
226 0.48
227 0.41
228 0.36
229 0.27
230 0.2
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.12
241 0.14
242 0.21
243 0.26
244 0.27
245 0.29
246 0.29
247 0.29
248 0.32
249 0.36
250 0.34
251 0.32
252 0.34
253 0.36
254 0.37
255 0.39
256 0.41
257 0.41
258 0.4
259 0.39
260 0.36
261 0.34
262 0.32
263 0.35
264 0.34
265 0.37
266 0.37
267 0.45
268 0.53
269 0.6
270 0.64
271 0.66
272 0.68
273 0.7
274 0.76
275 0.77
276 0.79
277 0.81
278 0.85
279 0.87
280 0.88
281 0.88
282 0.81
283 0.75
284 0.64
285 0.54
286 0.45
287 0.36
288 0.25
289 0.17
290 0.14
291 0.14
292 0.22
293 0.22
294 0.25
295 0.26
296 0.28
297 0.26
298 0.28
299 0.3
300 0.29
301 0.35
302 0.36
303 0.36
304 0.38
305 0.39
306 0.39
307 0.36
308 0.3
309 0.25
310 0.26
311 0.26
312 0.24
313 0.29
314 0.29
315 0.31
316 0.33
317 0.34
318 0.31
319 0.3
320 0.32
321 0.29
322 0.29
323 0.25
324 0.23
325 0.21
326 0.22
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.17
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.21
335 0.22
336 0.22
337 0.23
338 0.25
339 0.25
340 0.3
341 0.33
342 0.41
343 0.49
344 0.56
345 0.62
346 0.71
347 0.77