Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMT8

Protein Details
Accession C5DMT8    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-107DFSNRPPKYKRAHIRFLPGFHydrophilic
675-701KPVMPTPPPQEKEKKRSKFSKFLRSKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
686-700KEKKRSKFSKFLRSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG lth:KLTH0G11550g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MSDLIELQRNYILSFINDIKTEHNLKFLIIDDCVNALLDSLFADKNELLRAVTAIDLIDSSKRKGQPSVEAIYLLKPTKFNINCMDADFSNRPPKYKRAHIRFLPGFRDYLIKHFHGKQYLPQYICTLAEVQCAFTPRESLVFQTLGVDQPLQIFYNKKCIDLIERNIDRTVQCMLNLCIVTGEYPIVRYSQPSPEAYKICPATMLAKKLAFQFQEALDDYARKDETFPPPSSRPRAVCIITERSLDPFSLILHEFSYQSMAYDLAPGVDTRTDIYHYSAETETGQREDKVSKLSELVDPDWAELRHQHIMDASEYLTAKINELIAKNPLLVDRANVKTSTDLLSVVAHLKDFDEERRRITLHRSLIDECLKINEQRQLAELADFEQALAGFGLDADGNKFKGVTEKLLEVLMNKGANITDKIRYILAYALYRGGIIKEDFVKLLSFIGVNAGHPFFQHFMTLFSNFGYLGYTLIKEKAGDKPYKKEWHHETILNDPNTYNTSRFVPAAANNLSKVITNPLFLNEEAFPYVKDKPIEVLEDETPDNIGYNYSSTSLRNPRHKASWTKNTQNRAPRQRFFYYSLGGLTYGEIRTAYMQSQLKNKDIFIGTDCILTPLDVMQSVEKLSEPRNALGLQDDAKEKEKVPDFLFDRAVVAPVVSQHVHKVSHQRPSNDAKPVMPTPPPQEKEKKRSKFSKFLRSKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.24
7 0.29
8 0.34
9 0.29
10 0.31
11 0.28
12 0.28
13 0.28
14 0.29
15 0.25
16 0.2
17 0.2
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.12
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.12
31 0.12
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.24
49 0.29
50 0.32
51 0.37
52 0.4
53 0.44
54 0.49
55 0.5
56 0.44
57 0.42
58 0.4
59 0.37
60 0.37
61 0.29
62 0.25
63 0.21
64 0.21
65 0.3
66 0.31
67 0.33
68 0.35
69 0.37
70 0.37
71 0.38
72 0.41
73 0.31
74 0.36
75 0.34
76 0.33
77 0.38
78 0.38
79 0.4
80 0.41
81 0.49
82 0.5
83 0.59
84 0.64
85 0.64
86 0.73
87 0.74
88 0.8
89 0.8
90 0.77
91 0.72
92 0.62
93 0.53
94 0.44
95 0.43
96 0.34
97 0.32
98 0.32
99 0.29
100 0.32
101 0.37
102 0.42
103 0.42
104 0.43
105 0.44
106 0.48
107 0.53
108 0.49
109 0.45
110 0.42
111 0.38
112 0.37
113 0.3
114 0.23
115 0.16
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.19
121 0.19
122 0.17
123 0.18
124 0.14
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.13
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.15
142 0.16
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.25
147 0.26
148 0.33
149 0.37
150 0.42
151 0.42
152 0.43
153 0.44
154 0.44
155 0.44
156 0.35
157 0.29
158 0.27
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.2
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.14
178 0.19
179 0.23
180 0.24
181 0.28
182 0.32
183 0.34
184 0.33
185 0.37
186 0.31
187 0.28
188 0.26
189 0.22
190 0.24
191 0.26
192 0.28
193 0.24
194 0.24
195 0.26
196 0.28
197 0.32
198 0.25
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.12
211 0.14
212 0.18
213 0.26
214 0.31
215 0.33
216 0.36
217 0.41
218 0.47
219 0.51
220 0.51
221 0.45
222 0.42
223 0.45
224 0.41
225 0.39
226 0.38
227 0.38
228 0.33
229 0.33
230 0.3
231 0.27
232 0.26
233 0.22
234 0.17
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.11
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.16
278 0.16
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.12
292 0.14
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.13
321 0.14
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.16
327 0.16
328 0.11
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.12
341 0.18
342 0.19
343 0.21
344 0.23
345 0.23
346 0.24
347 0.28
348 0.3
349 0.28
350 0.29
351 0.3
352 0.29
353 0.33
354 0.34
355 0.29
356 0.22
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.18
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.17
366 0.16
367 0.15
368 0.13
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.06
434 0.05
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.08
447 0.11
448 0.13
449 0.14
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.1
455 0.09
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.09
464 0.11
465 0.18
466 0.24
467 0.31
468 0.34
469 0.4
470 0.49
471 0.58
472 0.58
473 0.59
474 0.59
475 0.6
476 0.61
477 0.58
478 0.52
479 0.51
480 0.57
481 0.49
482 0.42
483 0.34
484 0.31
485 0.29
486 0.28
487 0.2
488 0.14
489 0.16
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.22
496 0.24
497 0.22
498 0.21
499 0.22
500 0.21
501 0.18
502 0.17
503 0.17
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.17
508 0.19
509 0.19
510 0.21
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.14
517 0.16
518 0.17
519 0.18
520 0.17
521 0.18
522 0.21
523 0.23
524 0.21
525 0.23
526 0.2
527 0.22
528 0.21
529 0.18
530 0.16
531 0.14
532 0.13
533 0.09
534 0.09
535 0.06
536 0.07
537 0.08
538 0.09
539 0.11
540 0.11
541 0.19
542 0.28
543 0.35
544 0.43
545 0.48
546 0.52
547 0.58
548 0.64
549 0.67
550 0.68
551 0.71
552 0.71
553 0.76
554 0.77
555 0.78
556 0.78
557 0.78
558 0.78
559 0.79
560 0.78
561 0.74
562 0.74
563 0.73
564 0.7
565 0.66
566 0.6
567 0.51
568 0.43
569 0.38
570 0.31
571 0.26
572 0.21
573 0.16
574 0.14
575 0.11
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.11
580 0.12
581 0.12
582 0.17
583 0.2
584 0.23
585 0.31
586 0.35
587 0.38
588 0.38
589 0.38
590 0.37
591 0.35
592 0.33
593 0.29
594 0.29
595 0.24
596 0.24
597 0.24
598 0.18
599 0.17
600 0.15
601 0.12
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.1
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.11
611 0.13
612 0.15
613 0.21
614 0.23
615 0.23
616 0.26
617 0.25
618 0.25
619 0.25
620 0.25
621 0.21
622 0.21
623 0.23
624 0.23
625 0.26
626 0.27
627 0.26
628 0.31
629 0.35
630 0.36
631 0.36
632 0.42
633 0.41
634 0.44
635 0.45
636 0.37
637 0.33
638 0.28
639 0.27
640 0.18
641 0.15
642 0.12
643 0.11
644 0.15
645 0.13
646 0.14
647 0.17
648 0.21
649 0.23
650 0.26
651 0.36
652 0.38
653 0.47
654 0.54
655 0.53
656 0.56
657 0.64
658 0.66
659 0.64
660 0.6
661 0.52
662 0.52
663 0.52
664 0.49
665 0.45
666 0.44
667 0.44
668 0.52
669 0.53
670 0.55
671 0.62
672 0.68
673 0.74
674 0.79
675 0.81
676 0.81
677 0.88
678 0.89
679 0.89
680 0.88
681 0.89