Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DIE3

Protein Details
Accession C5DIE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-42ADRPAGKPPGKSRARRGPRRRGERGERGERSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-43RPAGKPPGKSRARRGPRRRGERGERGERSGS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0034641  P:cellular nitrogen compound metabolic process  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
KEGG lth:KLTH0E11836g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPEKPFGTPADRPAGKPPGKSRARRGPRRRGERGERGERSGSRPSSASSTSPSSASSAAPQSPVSSASQGPTSPADDKSAGFSPSQQRAIFYSRQVTKHSAQHKNYSHVPCRFFRQGACQAGDSCPFSHSLNALAADQTPCKYFQRGHCRFGAKCANAHILPDGTRANPTKYRGAPASAPASAPASLPLGEPLGGPLGAQLRGAALPDAVFSRNNAYCAGAFSSSAPGLAPAAPLQPYFTDASAVVFEDDADPAGPADSACDFDGEDFIPGELADLLTPRELERRRSSLPHRLSFNDSGPGPAAPLPAPLSASGHSPNYLASPVFDYVHQRDAAWPADPPSLASVHELGAHLARIKIPENSDSRAAGISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.55
3 0.52
4 0.56
5 0.58
6 0.58
7 0.65
8 0.71
9 0.73
10 0.74
11 0.81
12 0.84
13 0.88
14 0.88
15 0.9
16 0.93
17 0.92
18 0.92
19 0.91
20 0.91
21 0.9
22 0.89
23 0.83
24 0.77
25 0.74
26 0.67
27 0.62
28 0.6
29 0.52
30 0.44
31 0.41
32 0.37
33 0.36
34 0.35
35 0.32
36 0.27
37 0.3
38 0.28
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.22
43 0.2
44 0.2
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.17
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.22
67 0.23
68 0.21
69 0.19
70 0.23
71 0.27
72 0.32
73 0.37
74 0.33
75 0.31
76 0.33
77 0.39
78 0.36
79 0.32
80 0.34
81 0.35
82 0.38
83 0.4
84 0.42
85 0.42
86 0.46
87 0.53
88 0.54
89 0.53
90 0.6
91 0.61
92 0.61
93 0.64
94 0.64
95 0.63
96 0.59
97 0.6
98 0.52
99 0.55
100 0.54
101 0.47
102 0.41
103 0.42
104 0.44
105 0.44
106 0.43
107 0.37
108 0.34
109 0.34
110 0.35
111 0.28
112 0.2
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.15
131 0.18
132 0.26
133 0.37
134 0.42
135 0.44
136 0.48
137 0.52
138 0.49
139 0.52
140 0.52
141 0.41
142 0.37
143 0.37
144 0.35
145 0.3
146 0.31
147 0.24
148 0.16
149 0.15
150 0.16
151 0.14
152 0.1
153 0.13
154 0.14
155 0.17
156 0.2
157 0.22
158 0.27
159 0.27
160 0.3
161 0.27
162 0.28
163 0.25
164 0.25
165 0.25
166 0.19
167 0.18
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.12
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.05
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.15
269 0.17
270 0.25
271 0.31
272 0.37
273 0.4
274 0.48
275 0.54
276 0.57
277 0.63
278 0.62
279 0.59
280 0.57
281 0.6
282 0.56
283 0.51
284 0.46
285 0.37
286 0.32
287 0.29
288 0.25
289 0.2
290 0.17
291 0.16
292 0.11
293 0.13
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.16
308 0.13
309 0.12
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.21
315 0.23
316 0.28
317 0.27
318 0.24
319 0.25
320 0.28
321 0.29
322 0.24
323 0.22
324 0.2
325 0.23
326 0.22
327 0.21
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.18
332 0.16
333 0.14
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.22
345 0.24
346 0.3
347 0.33
348 0.36
349 0.38
350 0.36
351 0.35