Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DER0

Protein Details
Accession C5DER0    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100AKSFERRRCNHPPKEAKPPIBasic
194-215VSKNKRKGPKGPNPLSIKKKKTBasic
234-260AEPVDRSSSGRRRRRHHKRSSTEAGEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-214KNKRKGPKGPNPLSIKKKK
243-252GRRRRRHHKR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0C11352g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYRKQMLVYNHNFKFREPYQVLVDDQIVCDTHRASFDLVKGLQRTLQAEVKPMITQCCIQAIYETKNQDAIELAKSFERRRCNHPPKEAKPPIECLQSVVSVNGNNKHRYVVASQDPSIRKKLRQVPGVPLIYMNRSVMVMEPLSKASGDFSRAQEKEKLFKGLNDPKYAGLPAEEEGGKTDNGTEVSKNKRKGPKGPNPLSIKKKKTVPDSKDESPPSDKISVTDAEPVDRSSSGRRRRRHHKRSSTEAGEEGESGNISS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.76
3 0.75
4 0.69
5 0.68
6 0.65
7 0.59
8 0.57
9 0.48
10 0.49
11 0.41
12 0.41
13 0.39
14 0.41
15 0.41
16 0.34
17 0.35
18 0.25
19 0.23
20 0.2
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.17
30 0.18
31 0.22
32 0.23
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.24
38 0.24
39 0.23
40 0.27
41 0.23
42 0.26
43 0.27
44 0.26
45 0.25
46 0.24
47 0.22
48 0.18
49 0.18
50 0.15
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.22
57 0.26
58 0.27
59 0.24
60 0.27
61 0.26
62 0.23
63 0.2
64 0.18
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.18
70 0.22
71 0.25
72 0.32
73 0.32
74 0.4
75 0.51
76 0.58
77 0.64
78 0.71
79 0.77
80 0.74
81 0.81
82 0.8
83 0.74
84 0.66
85 0.64
86 0.57
87 0.5
88 0.45
89 0.36
90 0.3
91 0.26
92 0.23
93 0.18
94 0.15
95 0.13
96 0.15
97 0.19
98 0.21
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.29
110 0.31
111 0.31
112 0.36
113 0.33
114 0.28
115 0.34
116 0.42
117 0.43
118 0.47
119 0.48
120 0.47
121 0.52
122 0.51
123 0.43
124 0.35
125 0.29
126 0.23
127 0.21
128 0.15
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.13
145 0.15
146 0.23
147 0.24
148 0.26
149 0.3
150 0.31
151 0.33
152 0.33
153 0.35
154 0.28
155 0.3
156 0.37
157 0.41
158 0.43
159 0.4
160 0.39
161 0.35
162 0.36
163 0.33
164 0.24
165 0.15
166 0.12
167 0.09
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.17
181 0.27
182 0.34
183 0.38
184 0.44
185 0.52
186 0.57
187 0.65
188 0.7
189 0.71
190 0.75
191 0.78
192 0.79
193 0.79
194 0.82
195 0.82
196 0.8
197 0.76
198 0.71
199 0.71
200 0.69
201 0.71
202 0.73
203 0.69
204 0.69
205 0.71
206 0.69
207 0.71
208 0.66
209 0.6
210 0.55
211 0.5
212 0.45
213 0.4
214 0.35
215 0.28
216 0.29
217 0.26
218 0.22
219 0.26
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.22
224 0.2
225 0.19
226 0.2
227 0.23
228 0.33
229 0.41
230 0.49
231 0.57
232 0.64
233 0.75
234 0.85
235 0.86
236 0.88
237 0.89
238 0.9
239 0.91
240 0.92
241 0.87
242 0.79
243 0.71
244 0.62
245 0.52
246 0.43
247 0.34
248 0.24