Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DEK1

Protein Details
Accession C5DEK1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-67PEGMSKSQWKKVWKKKRFEETKDEFAKIRREKRQKAKETRRAKIQEYHydrophilic
72-93EEVPEDLRRKPRKNQDQKDSGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-63WKKVWKKKRFEETKDEFAKIRREKRQKAKETRRAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028564  MT_TRM10-typ  
IPR038459  MT_TRM10-typ_sf  
IPR016653  TRM10/TRM10A  
IPR007356  tRNA_m1G_MeTrfase_euk  
IPR016009  tRNA_MeTrfase_TRMD/TRM10  
Gene Ontology GO:0052905  F:tRNA (guanine(9)-N(1))-methyltransferase activity  
KEGG lth:KLTH0C09922g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01746  tRNA_m1G_MT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51675  SAM_MT_TRM10  
CDD cd18089  SPOUT_Trm10-like  
Amino Acid Sequences MSDSKPEKPITMHPHPLPPVPEGMSKSQWKKVWKKKRFEETKDEFAKIRREKRQKAKETRRAKIQEYLDRGEEVPEDLRRKPRKNQDQKDSGINIILDCAFDDLMNDKEVVSLSTQITRAYSHNKRENHFAKVKVTSFNKRLRTRFEEGLKDAHHDEWKNFEFTEDPTLPTENSVYLTADTDETLEKLEPGTNYIVGGIVDKNRHKLLCYNKARELGIPTKKLPLAEFIKLTGREVLTCTHVIHLMLRYFDNLDWKEAFETVLPQRKLEEAEAAAEAAAKAQSPQAESSEPSSATSEEEPQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.61
4 0.54
5 0.47
6 0.42
7 0.36
8 0.37
9 0.33
10 0.35
11 0.37
12 0.43
13 0.46
14 0.5
15 0.52
16 0.58
17 0.65
18 0.71
19 0.75
20 0.77
21 0.82
22 0.85
23 0.91
24 0.91
25 0.89
26 0.88
27 0.85
28 0.86
29 0.8
30 0.71
31 0.63
32 0.57
33 0.59
34 0.57
35 0.59
36 0.59
37 0.65
38 0.73
39 0.81
40 0.87
41 0.88
42 0.91
43 0.93
44 0.92
45 0.92
46 0.89
47 0.88
48 0.83
49 0.76
50 0.73
51 0.69
52 0.67
53 0.63
54 0.59
55 0.5
56 0.45
57 0.41
58 0.34
59 0.26
60 0.2
61 0.17
62 0.19
63 0.2
64 0.23
65 0.33
66 0.41
67 0.46
68 0.54
69 0.62
70 0.68
71 0.77
72 0.83
73 0.83
74 0.83
75 0.8
76 0.77
77 0.68
78 0.57
79 0.47
80 0.37
81 0.27
82 0.19
83 0.17
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.21
108 0.26
109 0.33
110 0.4
111 0.44
112 0.46
113 0.54
114 0.55
115 0.54
116 0.53
117 0.46
118 0.43
119 0.43
120 0.43
121 0.39
122 0.41
123 0.4
124 0.42
125 0.46
126 0.51
127 0.53
128 0.55
129 0.55
130 0.58
131 0.56
132 0.56
133 0.53
134 0.48
135 0.43
136 0.44
137 0.37
138 0.32
139 0.27
140 0.23
141 0.21
142 0.18
143 0.17
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.21
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.09
187 0.14
188 0.15
189 0.18
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.27
194 0.34
195 0.4
196 0.48
197 0.51
198 0.53
199 0.56
200 0.56
201 0.51
202 0.47
203 0.45
204 0.44
205 0.41
206 0.38
207 0.39
208 0.39
209 0.38
210 0.32
211 0.31
212 0.29
213 0.28
214 0.28
215 0.25
216 0.3
217 0.29
218 0.3
219 0.25
220 0.21
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.16
231 0.19
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.24
239 0.21
240 0.23
241 0.22
242 0.23
243 0.23
244 0.22
245 0.21
246 0.14
247 0.18
248 0.22
249 0.31
250 0.3
251 0.29
252 0.3
253 0.32
254 0.34
255 0.3
256 0.28
257 0.19
258 0.21
259 0.21
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.13
264 0.09
265 0.08
266 0.06
267 0.06
268 0.09
269 0.11
270 0.13
271 0.15
272 0.18
273 0.2
274 0.21
275 0.25
276 0.27
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.22
281 0.23
282 0.23