Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMS3

Protein Details
Accession C5DMS3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-425YTSSSQLSRRRSKKWKRSLASFVERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
409-416RRRSKKWK
Subcellular Location(s) plas 23, extr 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040254  Ecm3-like  
IPR004776  Mem_trans  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0055085  P:transmembrane transport  
KEGG lth:KLTH0G11220g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03547  Mem_trans  
Amino Acid Sequences MSIGVGVAIYAAIKPVLKIYVIILVGYLLARYNLATVETSRGVSNMVVNAILPCLTFNKIVGNISDKDIKEVGVLVLTAFLIFAVGGVGALITKWLTNSPKQWYWGLLFAGIFPNISDLPIAYVQSMSNGSVFTSGQVDRGVAYCCIFLCTQSFLMMNFGMFRLVGLDFREPSKDEEQLSENSDNSSHLNSKLREGEFTKTPENDVIADKQGPASFHGDRQPQMLASDKGSVDMPRSLYGQDENSSQSEADLGDEPQHFLNTVSTGSSLSSSSGATASDVFRSGSRHSGSENSHSRAGVPISISDTIHRMTTARSTASALSIGSQRKSRGRQRRLSQTAKDVINEYSAVQKIKTGEMDLSRPLSLTQEFGSGNAFPSDKSDDEDEEYDGSLPAEGDRRASYTSSSQLSRRRSKKWKRSLASFVERYKLGWLVYIMVNFCRPASLGALLGIIFCMIPWVKALFVHTDVHMHQAPDGQPVLNFLMDFTAYIGNACVPLGLLLLGGTLARLEIGSLPKGFWKTTVAMTAFRLVILPIVGIAWANKLYDINWIENDVAKFVVILTWAMPSATAQVYFTAFYTPLEGEHLQMDCLSVFFLSQYAVLFITLSIVVSYALKVDLKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.12
14 0.11
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.17
46 0.19
47 0.2
48 0.21
49 0.24
50 0.23
51 0.26
52 0.33
53 0.28
54 0.29
55 0.28
56 0.26
57 0.22
58 0.21
59 0.18
60 0.12
61 0.12
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.05
82 0.1
83 0.14
84 0.19
85 0.25
86 0.33
87 0.37
88 0.4
89 0.41
90 0.4
91 0.38
92 0.38
93 0.33
94 0.26
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.14
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.07
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.11
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.16
158 0.15
159 0.2
160 0.22
161 0.23
162 0.21
163 0.23
164 0.25
165 0.25
166 0.29
167 0.25
168 0.22
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.17
174 0.14
175 0.16
176 0.22
177 0.22
178 0.26
179 0.32
180 0.31
181 0.32
182 0.32
183 0.33
184 0.32
185 0.35
186 0.34
187 0.28
188 0.29
189 0.26
190 0.25
191 0.22
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.17
202 0.16
203 0.18
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.26
208 0.24
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.17
213 0.15
214 0.18
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.11
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.2
276 0.21
277 0.27
278 0.31
279 0.29
280 0.29
281 0.28
282 0.27
283 0.24
284 0.23
285 0.16
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.17
313 0.22
314 0.3
315 0.39
316 0.45
317 0.53
318 0.61
319 0.67
320 0.75
321 0.78
322 0.78
323 0.71
324 0.67
325 0.63
326 0.55
327 0.48
328 0.39
329 0.3
330 0.24
331 0.21
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.11
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.11
342 0.12
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.07
363 0.1
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.17
390 0.19
391 0.21
392 0.24
393 0.3
394 0.38
395 0.46
396 0.5
397 0.56
398 0.64
399 0.73
400 0.79
401 0.83
402 0.86
403 0.82
404 0.84
405 0.83
406 0.81
407 0.79
408 0.74
409 0.66
410 0.58
411 0.52
412 0.44
413 0.37
414 0.29
415 0.2
416 0.15
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.11
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.07
437 0.05
438 0.04
439 0.03
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.14
450 0.15
451 0.14
452 0.17
453 0.17
454 0.21
455 0.21
456 0.18
457 0.16
458 0.2
459 0.2
460 0.2
461 0.21
462 0.17
463 0.15
464 0.17
465 0.18
466 0.14
467 0.13
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.05
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.07
497 0.09
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.17
502 0.2
503 0.2
504 0.18
505 0.19
506 0.19
507 0.21
508 0.27
509 0.25
510 0.25
511 0.26
512 0.28
513 0.24
514 0.22
515 0.2
516 0.13
517 0.12
518 0.1
519 0.09
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.17
532 0.2
533 0.21
534 0.21
535 0.22
536 0.22
537 0.26
538 0.26
539 0.19
540 0.16
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.1
557 0.12
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.19
571 0.19
572 0.16
573 0.16
574 0.16
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.07
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.09