Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DD53

Protein Details
Accession C5DD53    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-324EQNLFLKRRRPLPKPKTPPTPRAEPSHydrophilic
330-350TVVKVNSTKIHRKNTKTSIFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-298RRKPTP
301-330NLFLKRRRPLPKPKTPPTPRAEPSVKRKPT
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG lth:KLTH0B08382g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPISENEEEFTMEHKQTKIKSLSSLCEISLMRNHLMLQNVANVPYRLVRNVLLKLKMEHLCKLEESNVLLIFEDEEAWVELLKKDFPMHVHDTYHRKRDEIVAFYADFVEKHDPPKLRDEELMRGFLRFAVRKEPATHKYKVPSRMLYFKYQEDMLRKQELSTQRLRMRMQEMQQEKEKKQIVPLDDPVYCERRTKAAARAGAGERSGLFAKSYKEHQKRQLHFKSGGYDAKSRPVKRLAFGGQVGRPAPSPAAPAPCAAPAPPVAAPAPLPATMQDTSQPKRSTPAVAPSARRKPTPEQNLFLKRRRPLPKPKTPPTPRAEPSVKRKPTVVKVNSTKIHRKNTKTSIFAAPSPQQQVLSQHSNTSSAYIFDQPRQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.32
4 0.41
5 0.44
6 0.41
7 0.47
8 0.48
9 0.5
10 0.51
11 0.49
12 0.4
13 0.39
14 0.37
15 0.32
16 0.32
17 0.31
18 0.26
19 0.25
20 0.27
21 0.24
22 0.26
23 0.24
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.25
29 0.22
30 0.21
31 0.24
32 0.25
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.26
37 0.33
38 0.38
39 0.37
40 0.37
41 0.38
42 0.43
43 0.45
44 0.42
45 0.4
46 0.36
47 0.34
48 0.33
49 0.34
50 0.29
51 0.26
52 0.25
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.17
57 0.15
58 0.13
59 0.11
60 0.09
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.15
74 0.21
75 0.25
76 0.27
77 0.3
78 0.35
79 0.44
80 0.48
81 0.55
82 0.49
83 0.43
84 0.42
85 0.47
86 0.47
87 0.41
88 0.37
89 0.32
90 0.31
91 0.31
92 0.3
93 0.22
94 0.15
95 0.14
96 0.17
97 0.15
98 0.17
99 0.23
100 0.25
101 0.27
102 0.36
103 0.37
104 0.34
105 0.37
106 0.38
107 0.41
108 0.4
109 0.42
110 0.33
111 0.3
112 0.28
113 0.25
114 0.27
115 0.21
116 0.2
117 0.23
118 0.25
119 0.27
120 0.31
121 0.37
122 0.4
123 0.43
124 0.45
125 0.42
126 0.48
127 0.52
128 0.55
129 0.52
130 0.51
131 0.49
132 0.55
133 0.54
134 0.52
135 0.49
136 0.42
137 0.38
138 0.34
139 0.33
140 0.3
141 0.31
142 0.28
143 0.29
144 0.28
145 0.26
146 0.3
147 0.33
148 0.33
149 0.34
150 0.38
151 0.37
152 0.42
153 0.42
154 0.4
155 0.39
156 0.39
157 0.37
158 0.38
159 0.37
160 0.36
161 0.42
162 0.44
163 0.39
164 0.41
165 0.41
166 0.34
167 0.35
168 0.36
169 0.32
170 0.31
171 0.34
172 0.3
173 0.27
174 0.28
175 0.26
176 0.25
177 0.23
178 0.2
179 0.18
180 0.17
181 0.2
182 0.21
183 0.26
184 0.28
185 0.29
186 0.29
187 0.32
188 0.3
189 0.28
190 0.25
191 0.19
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.19
201 0.28
202 0.34
203 0.41
204 0.5
205 0.58
206 0.63
207 0.72
208 0.73
209 0.69
210 0.64
211 0.6
212 0.54
213 0.49
214 0.46
215 0.38
216 0.35
217 0.3
218 0.36
219 0.4
220 0.38
221 0.38
222 0.41
223 0.4
224 0.37
225 0.42
226 0.37
227 0.34
228 0.36
229 0.35
230 0.28
231 0.29
232 0.28
233 0.22
234 0.2
235 0.16
236 0.15
237 0.11
238 0.13
239 0.13
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.17
264 0.22
265 0.24
266 0.32
267 0.33
268 0.29
269 0.33
270 0.34
271 0.35
272 0.32
273 0.38
274 0.38
275 0.42
276 0.47
277 0.53
278 0.6
279 0.58
280 0.56
281 0.53
282 0.54
283 0.59
284 0.64
285 0.62
286 0.58
287 0.64
288 0.73
289 0.75
290 0.74
291 0.7
292 0.65
293 0.68
294 0.71
295 0.71
296 0.72
297 0.75
298 0.79
299 0.82
300 0.87
301 0.88
302 0.87
303 0.88
304 0.83
305 0.82
306 0.73
307 0.72
308 0.71
309 0.69
310 0.7
311 0.72
312 0.7
313 0.62
314 0.65
315 0.64
316 0.65
317 0.68
318 0.64
319 0.63
320 0.66
321 0.74
322 0.75
323 0.74
324 0.74
325 0.72
326 0.76
327 0.75
328 0.75
329 0.77
330 0.8
331 0.81
332 0.75
333 0.71
334 0.69
335 0.64
336 0.58
337 0.55
338 0.5
339 0.47
340 0.48
341 0.44
342 0.36
343 0.34
344 0.38
345 0.38
346 0.41
347 0.36
348 0.35
349 0.35
350 0.36
351 0.34
352 0.31
353 0.24
354 0.18
355 0.2
356 0.24
357 0.26