FuNGI

C5DMB9

Protein Details

Accession

C5DMB9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
332-361	PDLSASKNKNAKQKKRKDRRKKGAMSDVSG	Hydrophilic
452-473	EVSKGKLSQRRLKERSKGGVDG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
338-354	KNKNAKQKKRKDRRKKG
438-441	KKSK
455-466	KGKLSQRRLKER

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	lth:KLTH0G07568g -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSSKGAFNRNNAQKFAVVHRPHDDPHFHDPEVGGHVLVPVNDPKANRAQVKAKSPLTRNVVGQSARQSRKPTNDHVGEAALYGIGFDDSNYDYTKHLKPIGTDPENSFLINASKPAEKPQTAKKLNVEDLFVEPEYKESSKKNESMFQRGVAKREYLIQQQDIEEDLRGFKPDLNPALREVLEALEDEAYVVNKDIVVEKPKKKKTAAEETESIFGAEETGDEDIFAELLMSGQAGDADEFEQEFDEWDMENLEDYEDEHYNNELQQFQNIENLEDLQNIDYQADVARFKQHKSRAGPEDGWDSVDEFEDDGASLSAASIEEEEQDQLGDLPDLSASKNKNAKQKKRKDRRKKGAMSDVSGFSMSSSAIARTEVLTVLDDKYDRIISGYENYEQEQEEEEEQSYQPFDMANERADFESMLDDFLDNYELESGGRKLVKKSKEIDRLKNAADEVSKGKLSQRRLKERSKGGVDGITGSLSSLKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.5
3	0.5
4	0.43
5	0.43
6	0.45
7	0.47
8	0.46
9	0.49
10	0.47
11	0.42
12	0.48
13	0.49
14	0.45
15	0.43
16	0.41
17	0.37
18	0.37
19	0.31
20	0.21
21	0.15
22	0.17
23	0.16
24	0.15
25	0.15
26	0.13
27	0.16
28	0.19
29	0.19
30	0.22
31	0.29
32	0.36
33	0.37
34	0.4
35	0.46
36	0.51
37	0.58
38	0.63
39	0.62
40	0.63
41	0.64
42	0.66
43	0.64
44	0.61
45	0.55
46	0.5
47	0.49
48	0.42
49	0.41
50	0.42
51	0.45
52	0.45
53	0.48
54	0.5
55	0.52
56	0.6
57	0.63
58	0.61
59	0.61
60	0.61
61	0.59
62	0.54
63	0.48
64	0.38
65	0.32
66	0.24
67	0.14
68	0.09
69	0.07
70	0.05
71	0.05
72	0.04
73	0.04
74	0.06
75	0.07
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.17
81	0.21
82	0.23
83	0.27
84	0.27
85	0.29
86	0.36
87	0.45
88	0.43
89	0.43
90	0.41
91	0.41
92	0.4
93	0.37
94	0.29
95	0.2
96	0.19
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.15
101	0.16
102	0.23
103	0.28
104	0.28
105	0.32
106	0.41
107	0.49
108	0.5
109	0.54
110	0.53
111	0.54
112	0.57
113	0.54
114	0.46
115	0.36
116	0.35
117	0.33
118	0.27
119	0.21
120	0.15
121	0.14
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.16
126	0.23
127	0.29
128	0.33
129	0.35
130	0.39
131	0.43
132	0.48
133	0.47
134	0.44
135	0.47
136	0.45
137	0.45
138	0.39
139	0.36
140	0.28
141	0.31
142	0.3
143	0.27
144	0.29
145	0.27
146	0.27
147	0.26
148	0.26
149	0.23
150	0.2
151	0.14
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.12
158	0.14
159	0.18
160	0.23
161	0.24
162	0.24
163	0.24
164	0.27
165	0.25
166	0.22
167	0.18
168	0.13
169	0.11
170	0.1
171	0.09
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.07
183	0.09
184	0.15
185	0.23
186	0.3
187	0.4
188	0.46
189	0.51
190	0.51
191	0.55
192	0.57
193	0.61
194	0.59
195	0.54
196	0.51
197	0.48
198	0.47
199	0.4
200	0.32
201	0.2
202	0.14
203	0.09
204	0.06
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.03
215	0.02
216	0.03
217	0.03
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.15
257	0.14
258	0.13
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.15
275	0.17
276	0.19
277	0.26
278	0.31
279	0.37
280	0.42
281	0.5
282	0.48
283	0.52
284	0.51
285	0.46
286	0.44
287	0.37
288	0.32
289	0.24
290	0.19
291	0.14
292	0.13
293	0.11
294	0.07
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.1
323	0.11
324	0.18
325	0.25
326	0.3
327	0.4
328	0.5
329	0.6
330	0.67
331	0.77
332	0.81
333	0.86
334	0.93
335	0.95
336	0.96
337	0.96
338	0.96
339	0.94
340	0.93
341	0.92
342	0.85
343	0.78
344	0.7
345	0.6
346	0.5
347	0.4
348	0.3
349	0.2
350	0.15
351	0.11
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.12
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.16
375	0.18
376	0.19
377	0.19
378	0.21
379	0.21
380	0.21
381	0.2
382	0.18
383	0.18
384	0.16
385	0.17
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.14
391	0.12
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.13
396	0.15
397	0.17
398	0.18
399	0.19
400	0.2
401	0.2
402	0.19
403	0.14
404	0.15
405	0.12
406	0.11
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.11
418	0.11
419	0.14
420	0.18
421	0.2
422	0.27
423	0.35
424	0.42
425	0.46
426	0.53
427	0.58
428	0.65
429	0.72
430	0.75
431	0.76
432	0.76
433	0.71
434	0.68
435	0.58
436	0.51
437	0.43
438	0.37
439	0.3
440	0.29
441	0.27
442	0.24
443	0.3
444	0.32
445	0.4
446	0.46
447	0.53
448	0.6
449	0.68
450	0.77
451	0.8
452	0.83
453	0.84
454	0.81
455	0.74
456	0.66
457	0.62
458	0.53
459	0.45
460	0.37
461	0.27
462	0.2
463	0.17

C5DMB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer