FuNGI

C5DFD1

Protein Details

Accession

C5DFD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1194-1227	GTAKTGASRRTAKNKRREERKRARGKKGTIYEEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1198-1220	TGASRRTAKNKRREERKRARGKK

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006849 Elp1 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
KEGG	lth:KLTH0D14146g -
Pfam	View protein in Pfam PF04762 IKI3

Amino Acid Sequences

MRNLITLNRGRFKPQSFEVPDLRLYGSVFDTLSDSITCVLGDYDLGAFEVHQYMKDGSCNTLASFNLQTLGGELLSFAHFGDLGQLVFVMSQGDIITASYDTVGFDPSFAVVEIVGSIDGGISAAEWSYDEETLALVTAERNVVLLSRQFDPIAEYKLEEDDLKMSKHVNVGWGKKETQFRGKGARAMEREALESLKASGLVGDELRDPTMPYLVDKGTVSAMDSRKASISWRGDCEYFVVSTIEAVHEESDEPFERRVLRVFSRDGQLQNVSEPVDGLEDLVSWKPQGSLIASVQRRDQIPGEESVDLVFFERNGLRHGEFDTRLSLNEKIQALCWNCNSEVLAIVLADRIQLWTTKNYHWYLKQEVYANDIKFVKWHPEKDFTLMFGDEDYVNVVDFAYKLALGPTLEPSDSGTVLVVDGCTVNITPLGLANVPPPAYYRDFDAPGNVLDAATSLSNELYVAITNNELVLATVPSLEDMKKGLQPCVVSRLHKSILATEYDSLRQVAFMNDNVLGVLLDADNLSRIALIDVTDITQPTVFNIIETFDKVVLLRTSFEYNYMVYETKDSRVVQLDQEGQTVEVAKFPQLVRDLRVKRVENSKAVDEDDRLAEDSKIVAFGLAANGKLYANDILLTSTVTSMEVTEKFLMFTTAQHNLQFVHLNSTEFKALPIVEDSVADERVRAIEMGSTLVTAMPSRSSVVLQAARGNLETIAPRIMVLAGVRKSILAKKYLEALMSCRTHRVHLDILHDYAPDLFYENLEHFINDIGKGEHLDLFISCLTEEDVTITKYKETLRASMDERFELAPSAPTEMELYMKKKMFNPELSKVNKICNALLEVFLNNPDYKKKYIQSILTAYACQNPPNLEAAMMLISSLEEESDTCLTYLCFLHDVNQLYKVALSLYDIKLTLNIAQKSQMDPREYLPFLQELHEKEPLVRQFMIDDYLKRYEKALDHLSALEKDSKRLSQKFIDYVQTHDLYIYALSMFRYEPDKQNDIYHIYAPFLSSKQEYGEAAVIYEMLGENREAVEAYTLGKKWCEALALAALKFSDDVPSVADQLVSSLSFDHRFEEAAQIEFVYLKNTREAVKLYCKAYSYEKATLVAVNDKHPELIEEVLDPGLGEGFGTIAELLADCQSQVNSQLRRLRELRQKKGDDPYAFYGQETEQADDVSIAASETSTKESFFTRYTGKTGGTAKTGASRRTAKNKRREERKRARGKKGTIYEEEYLIQSIGRLIDRLTQTEPDALKLIEALLRRRRREEAYQIQKRFVEVTSLLKDNVAEIYTLSEKDRERVDEDGNIYYVPEIPVPTIKDFPALKTVGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.56
3	0.54
4	0.59
5	0.58
6	0.54
7	0.51
8	0.45
9	0.41
10	0.32
11	0.27
12	0.22
13	0.19
14	0.17
15	0.15
16	0.13
17	0.14
18	0.13
19	0.15
20	0.12
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.1
25	0.09
26	0.09
27	0.07
28	0.07
29	0.07
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.06
35	0.08
36	0.12
37	0.11
38	0.11
39	0.14
40	0.16
41	0.17
42	0.21
43	0.21
44	0.2
45	0.23
46	0.24
47	0.22
48	0.24
49	0.22
50	0.23
51	0.22
52	0.2
53	0.18
54	0.17
55	0.16
56	0.13
57	0.14
58	0.1
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.1
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.06
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.09
97	0.09
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.05
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.03
109	0.03
110	0.03
111	0.03
112	0.04
113	0.04
114	0.07
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.06
123	0.05
124	0.05
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.08
131	0.1
132	0.13
133	0.15
134	0.16
135	0.18
136	0.18
137	0.18
138	0.22
139	0.23
140	0.24
141	0.21
142	0.2
143	0.2
144	0.21
145	0.22
146	0.18
147	0.16
148	0.16
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.18
153	0.19
154	0.22
155	0.22
156	0.25
157	0.3
158	0.35
159	0.4
160	0.43
161	0.43
162	0.46
163	0.53
164	0.51
165	0.53
166	0.53
167	0.52
168	0.57
169	0.58
170	0.57
171	0.54
172	0.56
173	0.49
174	0.48
175	0.47
176	0.39
177	0.37
178	0.34
179	0.3
180	0.22
181	0.19
182	0.16
183	0.12
184	0.11
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.15
201	0.14
202	0.16
203	0.15
204	0.16
205	0.14
206	0.14
207	0.14
208	0.17
209	0.18
210	0.2
211	0.2
212	0.2
213	0.2
214	0.21
215	0.22
216	0.24
217	0.3
218	0.31
219	0.35
220	0.37
221	0.37
222	0.36
223	0.36
224	0.29
225	0.22
226	0.18
227	0.14
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.09
232	0.08
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.12
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.17
243	0.18
244	0.19
245	0.22
246	0.24
247	0.26
248	0.3
249	0.33
250	0.35
251	0.38
252	0.41
253	0.38
254	0.36
255	0.35
256	0.31
257	0.27
258	0.25
259	0.21
260	0.17
261	0.15
262	0.12
263	0.1
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.14
278	0.17
279	0.25
280	0.26
281	0.27
282	0.28
283	0.3
284	0.29
285	0.28
286	0.27
287	0.23
288	0.24
289	0.26
290	0.27
291	0.23
292	0.22
293	0.2
294	0.18
295	0.13
296	0.11
297	0.08
298	0.06
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.12
303	0.15
304	0.15
305	0.16
306	0.19
307	0.22
308	0.22
309	0.22
310	0.24
311	0.21
312	0.22
313	0.23
314	0.22
315	0.18
316	0.23
317	0.23
318	0.2
319	0.21
320	0.26
321	0.26
322	0.28
323	0.29
324	0.27
325	0.25
326	0.25
327	0.25
328	0.19
329	0.16
330	0.13
331	0.11
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.07
341	0.09
342	0.14
343	0.18
344	0.21
345	0.27
346	0.29
347	0.34
348	0.37
349	0.4
350	0.41
351	0.41
352	0.42
353	0.4
354	0.38
355	0.38
356	0.4
357	0.35
358	0.33
359	0.3
360	0.26
361	0.23
362	0.24
363	0.29
364	0.28
365	0.34
366	0.34
367	0.41
368	0.43
369	0.45
370	0.45
371	0.36
372	0.33
373	0.27
374	0.22
375	0.15
376	0.15
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.12
401	0.11
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.13
426	0.15
427	0.15
428	0.18
429	0.2
430	0.22
431	0.22
432	0.22
433	0.19
434	0.16
435	0.17
436	0.13
437	0.09
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.09
469	0.12
470	0.13
471	0.14
472	0.16
473	0.17
474	0.18
475	0.23
476	0.24
477	0.23
478	0.25
479	0.29
480	0.28
481	0.28
482	0.27
483	0.24
484	0.23
485	0.23
486	0.21
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.17
491	0.13
492	0.11
493	0.1
494	0.09
495	0.1
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.09
502	0.08
503	0.07
504	0.05
505	0.05
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.03
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.09
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.1
543	0.12
544	0.12
545	0.13
546	0.12
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.11
551	0.09
552	0.12
553	0.12
554	0.12
555	0.15
556	0.15
557	0.15
558	0.18
559	0.19
560	0.17
561	0.19
562	0.21
563	0.19
564	0.19
565	0.17
566	0.14
567	0.13
568	0.13
569	0.1
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.1
574	0.1
575	0.13
576	0.15
577	0.16
578	0.17
579	0.26
580	0.29
581	0.32
582	0.38
583	0.37
584	0.37
585	0.45
586	0.46
587	0.41
588	0.41
589	0.37
590	0.32
591	0.32
592	0.29
593	0.21
594	0.18
595	0.14
596	0.12
597	0.11
598	0.11
599	0.09
600	0.08
601	0.08
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.06
623	0.05
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.06
630	0.06
631	0.08
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.08
638	0.09
639	0.1
640	0.13
641	0.14
642	0.14
643	0.14
644	0.14
645	0.15
646	0.15
647	0.12
648	0.13
649	0.13
650	0.14
651	0.14
652	0.15
653	0.15
654	0.12
655	0.12
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.09
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.06
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.06
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.1
690	0.11
691	0.11
692	0.13
693	0.13
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.09
698	0.08
699	0.08
700	0.07
701	0.07
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.05
707	0.05
708	0.09
709	0.09
710	0.1
711	0.1
712	0.1
713	0.11
714	0.15
715	0.16
716	0.15
717	0.16
718	0.16
719	0.2
720	0.21
721	0.2
722	0.17
723	0.17
724	0.2
725	0.21
726	0.21
727	0.2
728	0.2
729	0.21
730	0.22
731	0.22
732	0.2
733	0.21
734	0.25
735	0.24
736	0.24
737	0.23
738	0.22
739	0.19
740	0.15
741	0.12
742	0.07
743	0.07
744	0.06
745	0.06
746	0.07
747	0.07
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.08
752	0.09
753	0.09
754	0.08
755	0.09
756	0.07
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.07
762	0.08
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.07
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.06
773	0.07
774	0.08
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.11
779	0.12
780	0.17
781	0.18
782	0.21
783	0.22
784	0.25
785	0.27
786	0.3
787	0.3
788	0.24
789	0.24
790	0.2
791	0.18
792	0.15
793	0.13
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.12
802	0.12
803	0.14
804	0.18
805	0.19
806	0.21
807	0.24
808	0.31
809	0.34
810	0.39
811	0.44
812	0.44
813	0.51
814	0.52
815	0.53
816	0.48
817	0.46
818	0.41
819	0.36
820	0.31
821	0.24
822	0.24
823	0.2
824	0.19
825	0.16
826	0.13
827	0.11
828	0.12
829	0.12
830	0.1
831	0.1
832	0.13
833	0.16
834	0.19
835	0.23
836	0.25
837	0.3
838	0.35
839	0.38
840	0.39
841	0.39
842	0.4
843	0.36
844	0.34
845	0.28
846	0.28
847	0.25
848	0.21
849	0.18
850	0.16
851	0.16
852	0.18
853	0.17
854	0.12
855	0.11
856	0.11
857	0.1
858	0.08
859	0.07
860	0.04
861	0.04
862	0.04
863	0.04
864	0.03
865	0.03
866	0.03
867	0.05
868	0.06
869	0.07
870	0.06
871	0.07
872	0.07
873	0.08
874	0.09
875	0.08
876	0.09
877	0.08
878	0.12
879	0.16
880	0.19
881	0.19
882	0.21
883	0.2
884	0.19
885	0.19
886	0.15
887	0.11
888	0.08
889	0.09
890	0.11
891	0.12
892	0.13
893	0.13
894	0.13
895	0.13
896	0.14
897	0.17
898	0.19
899	0.19
900	0.18
901	0.21
902	0.22
903	0.25
904	0.3
905	0.3
906	0.26
907	0.27
908	0.29
909	0.32
910	0.32
911	0.3
912	0.25
913	0.22
914	0.2
915	0.21
916	0.22
917	0.18
918	0.21
919	0.24
920	0.22
921	0.22
922	0.27
923	0.27
924	0.27
925	0.24
926	0.21
927	0.19
928	0.2
929	0.22
930	0.17
931	0.17
932	0.17
933	0.23
934	0.24
935	0.23
936	0.24
937	0.25
938	0.25
939	0.3
940	0.3
941	0.25
942	0.26
943	0.27
944	0.28
945	0.24
946	0.24
947	0.26
948	0.21
949	0.22
950	0.24
951	0.27
952	0.33
953	0.36
954	0.39
955	0.38
956	0.42
957	0.44
958	0.45
959	0.48
960	0.41
961	0.41
962	0.41
963	0.35
964	0.3
965	0.26
966	0.22
967	0.15
968	0.14
969	0.11
970	0.06
971	0.06
972	0.06
973	0.07
974	0.07
975	0.08
976	0.12
977	0.15
978	0.22
979	0.28
980	0.31
981	0.32
982	0.34
983	0.36
984	0.36
985	0.34
986	0.29
987	0.24
988	0.21
989	0.2
990	0.18
991	0.17
992	0.14
993	0.14
994	0.13
995	0.13
996	0.14
997	0.15
998	0.15
999	0.15
1000	0.17
1001	0.14
1002	0.13
1003	0.12
1004	0.1
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.06
1008	0.04
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.05
1013	0.06
1014	0.06
1015	0.06
1016	0.07
1017	0.06
1018	0.08
1019	0.12
1020	0.13
1021	0.14
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.15
1026	0.14
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.17
1030	0.2
1031	0.19
1032	0.18
1033	0.17
1034	0.16
1035	0.16
1036	0.14
1037	0.1
1038	0.08
1039	0.08
1040	0.1
1041	0.11
1042	0.12
1043	0.12
1044	0.12
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.1
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.09
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.13
1055	0.13
1056	0.14
1057	0.15
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.15
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.14
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.14
1070	0.16
1071	0.18
1072	0.2
1073	0.23
1074	0.25
1075	0.33
1076	0.37
1077	0.36
1078	0.37
1079	0.36
1080	0.36
1081	0.4
1082	0.41
1083	0.38
1084	0.37
1085	0.37
1086	0.35
1087	0.35
1088	0.34
1089	0.3
1090	0.29
1091	0.25
1092	0.23
1093	0.25
1094	0.24
1095	0.23
1096	0.22
1097	0.21
1098	0.16
1099	0.16
1100	0.13
1101	0.11
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.09
1106	0.07
1107	0.06
1108	0.05
1109	0.04
1110	0.03
1111	0.03
1112	0.03
1113	0.04
1114	0.03
1115	0.03
1116	0.03
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.05
1120	0.06
1121	0.05
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.08
1125	0.14
1126	0.21
1127	0.23
1128	0.3
1129	0.36
1130	0.37
1131	0.44
1132	0.46
1133	0.5
1134	0.53
1135	0.61
1136	0.65
1137	0.69
1138	0.73
1139	0.72
1140	0.78
1141	0.78
1142	0.7
1143	0.66
1144	0.62
1145	0.57
1146	0.52
1147	0.45
1148	0.38
1149	0.29
1150	0.32
1151	0.28
1152	0.23
1153	0.17
1154	0.17
1155	0.18
1156	0.15
1157	0.15
1158	0.09
1159	0.07
1160	0.05
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.06
1164	0.07
1165	0.12
1166	0.12
1167	0.12
1168	0.13
1169	0.16
1170	0.19
1171	0.2
1172	0.22
1173	0.23
1174	0.25
1175	0.29
1176	0.3
1177	0.29
1178	0.31
1179	0.34
1180	0.33
1181	0.31
1182	0.29
1183	0.26
1184	0.32
1185	0.36
1186	0.33
1187	0.36
1188	0.41
1189	0.46
1190	0.56
1191	0.66
1192	0.67
1193	0.73
1194	0.82
1195	0.85
1196	0.88
1197	0.91
1198	0.92
1199	0.92
1200	0.94
1201	0.94
1202	0.94
1203	0.94
1204	0.93
1205	0.9
1206	0.89
1207	0.87
1208	0.84
1209	0.78
1210	0.74
1211	0.65
1212	0.57
1213	0.5
1214	0.4
1215	0.32
1216	0.24
1217	0.18
1218	0.12
1219	0.12
1220	0.12
1221	0.11
1222	0.11
1223	0.11
1224	0.18
1225	0.2
1226	0.23
1227	0.24
1228	0.24
1229	0.25
1230	0.31
1231	0.31
1232	0.26
1233	0.26
1234	0.23
1235	0.2
1236	0.18
1237	0.17
1238	0.14
1239	0.17
1240	0.23
1241	0.31
1242	0.4
1243	0.45
1244	0.5
1245	0.55
1246	0.59
1247	0.65
1248	0.67
1249	0.68
1250	0.71
1251	0.77
1252	0.75
1253	0.74
1254	0.68
1255	0.6
1256	0.52
1257	0.41
1258	0.36
1259	0.28
1260	0.32
1261	0.31
1262	0.32
1263	0.31
1264	0.29
1265	0.29
1266	0.23
1267	0.23
1268	0.16
1269	0.11
1270	0.09
1271	0.14
1272	0.15
1273	0.17
1274	0.17
1275	0.21
1276	0.21
1277	0.25
1278	0.3
1279	0.29
1280	0.3
1281	0.33
1282	0.35
1283	0.36
1284	0.38
1285	0.36
1286	0.32
1287	0.28
1288	0.25
1289	0.21
1290	0.2
1291	0.15
1292	0.14
1293	0.12
1294	0.13
1295	0.18
1296	0.22
1297	0.25
1298	0.26
1299	0.25
1300	0.31
1301	0.31
1302	0.32
1303	0.34

C5DFD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer