Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DDY1

Protein Details
Accession C5DDY1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-71ASVSSTQRKSRRKSSSCNRKKEPSRTNKQEKPSKPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-67KSRRKSSSCNRKKEPSRTNKQEKP
98-105PKKNRRAS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020401  mRNA_transport_factor_GFD1  
KEGG lth:KLTH0C04730g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17331  GFD1  
Amino Acid Sequences MSLNSSIWASPSTDSEDRSALDSKTNGLGSSMWASASVSSTQRKSRRKSSSCNRKKEPSRTNKQEKPSKPSTGNALAARLGMLDLNKPLDSPQKQEGPKKNRRASPPQEKKSSNSLAARLGMVEDSESSGDSDSEDVTRPSTSDKKSIFDRIKPKRETKNDSSLERGSGAGKQAAKHGSKMELLKQKVEEQKRIKETNQHKSQQTELLKDFLNDDASFNWEDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.25
4 0.24
5 0.26
6 0.27
7 0.2
8 0.23
9 0.21
10 0.21
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.18
15 0.17
16 0.16
17 0.18
18 0.16
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.18
27 0.22
28 0.31
29 0.4
30 0.48
31 0.53
32 0.61
33 0.68
34 0.71
35 0.78
36 0.81
37 0.83
38 0.85
39 0.88
40 0.85
41 0.84
42 0.86
43 0.86
44 0.86
45 0.85
46 0.86
47 0.87
48 0.9
49 0.86
50 0.87
51 0.86
52 0.81
53 0.78
54 0.74
55 0.71
56 0.63
57 0.58
58 0.55
59 0.5
60 0.49
61 0.41
62 0.35
63 0.28
64 0.25
65 0.23
66 0.16
67 0.11
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.16
77 0.17
78 0.21
79 0.24
80 0.3
81 0.34
82 0.42
83 0.51
84 0.53
85 0.61
86 0.68
87 0.7
88 0.68
89 0.72
90 0.74
91 0.74
92 0.75
93 0.76
94 0.73
95 0.73
96 0.69
97 0.65
98 0.62
99 0.56
100 0.49
101 0.4
102 0.35
103 0.29
104 0.28
105 0.25
106 0.17
107 0.14
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.12
128 0.18
129 0.19
130 0.26
131 0.27
132 0.29
133 0.33
134 0.42
135 0.42
136 0.43
137 0.52
138 0.55
139 0.63
140 0.66
141 0.71
142 0.72
143 0.77
144 0.78
145 0.74
146 0.75
147 0.71
148 0.67
149 0.64
150 0.55
151 0.47
152 0.39
153 0.32
154 0.23
155 0.19
156 0.19
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.21
161 0.27
162 0.27
163 0.27
164 0.28
165 0.27
166 0.29
167 0.32
168 0.35
169 0.38
170 0.38
171 0.4
172 0.4
173 0.45
174 0.5
175 0.54
176 0.55
177 0.54
178 0.62
179 0.66
180 0.68
181 0.64
182 0.65
183 0.69
184 0.7
185 0.72
186 0.7
187 0.66
188 0.65
189 0.65
190 0.65
191 0.6
192 0.55
193 0.48
194 0.44
195 0.4
196 0.36
197 0.34
198 0.27
199 0.26
200 0.19
201 0.19
202 0.16
203 0.19
204 0.2