Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E3P6

Protein Details
Accession C5E3P6    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-50KKDVSRTQGKENKREPNDKSBasic
101-124DWLTSVGTRKKPKRTLDKVYEEQEHydrophilic
258-280FAPIKIKKRKKLKSSSLSQKRSRHydrophilic
541-568GTHSNRRKLTKAQRKVEQRNQQNQHENFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-277KIKKRKKLKSSSLSQK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0H15312g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAHEISLSLEETNKLRLSLGLKPINAKADDKKDVSRTQGKENKREPNDKSEGAGADSHGYERSAFIDDKVSKLRWNLKRAKSKISSPVTLVDEDDAADGQDWLTSVGTRKKPKRTLDKVYEEQEEASQDVELGMKISHRMSDFSGRRNVILTLQEASVDAEDKEDVLVDEGVTQDLQQAKRLELKRMNQDRKRKGVGANFVSENEDQEATSLRLVNGKIVDEETLTLQQEPEASQDNRIKASIEPSASEDEERQTTDFAPIKIKKRKKLKSSSLSQKRSRPVSQIPKVTLVNEDAEDPAEEELQGFLKIRKSRSSKADSSERSAEQIAIEARKEALERKERATKVANVKISQEMVLDENSVFLHNLKKDLISNKSSSHKFEKLNLKAPASDEAQSVPGSKATDERASVFEKKDEPQFHEGLASTLSFLKERNVLPQQPKASTASLRSKDLELLALKQKLETRKVKEKFKEELSQDKIQYSREELDRIEELQHQEIAKRNQSLQKERLAGYNPEVKLTYKDERGNELTTKEAYKQLSQAFHGTHSNRRKLTKAQRKVEQRNQQNQHENFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.21
4 0.23
5 0.29
6 0.37
7 0.38
8 0.38
9 0.42
10 0.45
11 0.47
12 0.46
13 0.43
14 0.42
15 0.44
16 0.5
17 0.49
18 0.52
19 0.53
20 0.55
21 0.59
22 0.6
23 0.55
24 0.59
25 0.64
26 0.66
27 0.69
28 0.74
29 0.76
30 0.75
31 0.81
32 0.75
33 0.77
34 0.76
35 0.67
36 0.6
37 0.54
38 0.46
39 0.39
40 0.35
41 0.26
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.22
54 0.23
55 0.27
56 0.31
57 0.31
58 0.3
59 0.37
60 0.46
61 0.45
62 0.54
63 0.61
64 0.65
65 0.75
66 0.76
67 0.79
68 0.75
69 0.74
70 0.74
71 0.71
72 0.64
73 0.55
74 0.56
75 0.49
76 0.44
77 0.37
78 0.27
79 0.21
80 0.18
81 0.16
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.12
93 0.2
94 0.28
95 0.38
96 0.46
97 0.55
98 0.64
99 0.73
100 0.79
101 0.8
102 0.83
103 0.83
104 0.85
105 0.81
106 0.77
107 0.71
108 0.6
109 0.51
110 0.42
111 0.33
112 0.24
113 0.18
114 0.13
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.16
128 0.26
129 0.29
130 0.32
131 0.39
132 0.37
133 0.37
134 0.37
135 0.34
136 0.27
137 0.26
138 0.22
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.12
163 0.13
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.28
168 0.3
169 0.35
170 0.38
171 0.43
172 0.49
173 0.59
174 0.68
175 0.67
176 0.76
177 0.76
178 0.77
179 0.76
180 0.69
181 0.64
182 0.61
183 0.61
184 0.54
185 0.5
186 0.43
187 0.38
188 0.37
189 0.31
190 0.25
191 0.18
192 0.15
193 0.11
194 0.1
195 0.12
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.13
220 0.13
221 0.18
222 0.22
223 0.23
224 0.23
225 0.23
226 0.23
227 0.18
228 0.2
229 0.18
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.09
242 0.1
243 0.14
244 0.16
245 0.15
246 0.22
247 0.26
248 0.35
249 0.44
250 0.5
251 0.53
252 0.61
253 0.69
254 0.72
255 0.77
256 0.79
257 0.78
258 0.82
259 0.85
260 0.84
261 0.84
262 0.8
263 0.75
264 0.71
265 0.68
266 0.6
267 0.55
268 0.53
269 0.55
270 0.56
271 0.54
272 0.5
273 0.48
274 0.46
275 0.41
276 0.33
277 0.23
278 0.18
279 0.14
280 0.13
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.12
295 0.16
296 0.18
297 0.25
298 0.31
299 0.36
300 0.44
301 0.5
302 0.48
303 0.51
304 0.58
305 0.52
306 0.51
307 0.49
308 0.42
309 0.36
310 0.32
311 0.27
312 0.18
313 0.18
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.18
323 0.25
324 0.27
325 0.31
326 0.4
327 0.4
328 0.43
329 0.43
330 0.43
331 0.44
332 0.48
333 0.47
334 0.39
335 0.41
336 0.39
337 0.35
338 0.28
339 0.19
340 0.14
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.17
356 0.22
357 0.27
358 0.26
359 0.28
360 0.3
361 0.37
362 0.38
363 0.39
364 0.41
365 0.42
366 0.41
367 0.47
368 0.53
369 0.51
370 0.58
371 0.56
372 0.51
373 0.46
374 0.45
375 0.41
376 0.33
377 0.28
378 0.2
379 0.17
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.13
388 0.15
389 0.17
390 0.17
391 0.18
392 0.19
393 0.23
394 0.27
395 0.25
396 0.25
397 0.25
398 0.27
399 0.33
400 0.34
401 0.35
402 0.37
403 0.36
404 0.33
405 0.32
406 0.29
407 0.22
408 0.2
409 0.14
410 0.1
411 0.1
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.15
417 0.16
418 0.23
419 0.28
420 0.35
421 0.39
422 0.46
423 0.49
424 0.45
425 0.47
426 0.42
427 0.38
428 0.34
429 0.36
430 0.39
431 0.38
432 0.39
433 0.39
434 0.37
435 0.35
436 0.33
437 0.3
438 0.22
439 0.23
440 0.27
441 0.28
442 0.27
443 0.27
444 0.32
445 0.34
446 0.41
447 0.45
448 0.47
449 0.55
450 0.62
451 0.7
452 0.73
453 0.75
454 0.73
455 0.72
456 0.72
457 0.66
458 0.69
459 0.65
460 0.64
461 0.58
462 0.54
463 0.49
464 0.42
465 0.4
466 0.35
467 0.34
468 0.3
469 0.31
470 0.27
471 0.3
472 0.29
473 0.28
474 0.26
475 0.25
476 0.25
477 0.25
478 0.27
479 0.23
480 0.25
481 0.31
482 0.36
483 0.37
484 0.38
485 0.41
486 0.45
487 0.53
488 0.59
489 0.56
490 0.58
491 0.57
492 0.54
493 0.54
494 0.53
495 0.47
496 0.43
497 0.46
498 0.38
499 0.36
500 0.36
501 0.32
502 0.31
503 0.34
504 0.36
505 0.35
506 0.41
507 0.41
508 0.47
509 0.5
510 0.5
511 0.47
512 0.41
513 0.37
514 0.34
515 0.34
516 0.29
517 0.31
518 0.3
519 0.3
520 0.34
521 0.37
522 0.38
523 0.38
524 0.41
525 0.36
526 0.36
527 0.41
528 0.39
529 0.43
530 0.49
531 0.55
532 0.56
533 0.59
534 0.62
535 0.64
536 0.72
537 0.74
538 0.74
539 0.75
540 0.79
541 0.86
542 0.91
543 0.91
544 0.9
545 0.9
546 0.9
547 0.89
548 0.89
549 0.88