Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DFH1

Protein Details
Accession C5DFH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-224DSEFKPFVSRKNRRKNKTRIQEQVVDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-212NRRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012942  SRR1-like  
IPR040044  SRR1L  
KEGG lth:KLTH0D15048g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07985  SRR1  
Amino Acid Sequences MTESLESGFRQVRRTKEPRGQVGFDVSLAKHRETVRSSEMFKNLKEHLEPHSKDIRRVRCLAIGSFHEEFAALYQLALLLETCDHLKPSEGEPIRVSVYDPVFTTSDQDFIKNLGPDWSVDEETPWEPSEARYVLFFLPHAPLDLTERVVTLDRPHLWLANHIVKHTDRYTKLQLFDKYPVLSKLLNSLVNAQESVPDSEFKPFVSRKNRRKNKTRIQEQVVDYSAIPTHFSKCKILTDFNNGKTLADQPWINSFSDLTLHLIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.64
4 0.71
5 0.74
6 0.75
7 0.71
8 0.63
9 0.62
10 0.52
11 0.44
12 0.38
13 0.28
14 0.27
15 0.27
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.31
20 0.32
21 0.37
22 0.37
23 0.39
24 0.43
25 0.44
26 0.5
27 0.47
28 0.45
29 0.44
30 0.4
31 0.39
32 0.36
33 0.33
34 0.32
35 0.39
36 0.4
37 0.41
38 0.48
39 0.46
40 0.51
41 0.58
42 0.59
43 0.55
44 0.57
45 0.53
46 0.48
47 0.49
48 0.43
49 0.39
50 0.32
51 0.32
52 0.29
53 0.27
54 0.22
55 0.19
56 0.17
57 0.14
58 0.13
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.21
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.23
82 0.21
83 0.2
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.16
92 0.12
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.13
98 0.16
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.14
105 0.15
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.13
140 0.12
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.22
147 0.24
148 0.23
149 0.21
150 0.24
151 0.22
152 0.26
153 0.27
154 0.28
155 0.25
156 0.3
157 0.37
158 0.38
159 0.42
160 0.44
161 0.44
162 0.41
163 0.42
164 0.4
165 0.33
166 0.31
167 0.29
168 0.25
169 0.22
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.21
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.28
192 0.38
193 0.48
194 0.56
195 0.67
196 0.77
197 0.8
198 0.88
199 0.91
200 0.91
201 0.91
202 0.91
203 0.89
204 0.86
205 0.85
206 0.77
207 0.72
208 0.62
209 0.52
210 0.42
211 0.33
212 0.27
213 0.19
214 0.19
215 0.14
216 0.18
217 0.21
218 0.24
219 0.27
220 0.28
221 0.35
222 0.38
223 0.43
224 0.43
225 0.49
226 0.55
227 0.53
228 0.56
229 0.49
230 0.44
231 0.39
232 0.37
233 0.29
234 0.26
235 0.23
236 0.2
237 0.27
238 0.29
239 0.28
240 0.26
241 0.23
242 0.19
243 0.21
244 0.2