Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DEI0

Protein Details
Accession C5DEI0    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MAPVISKKSGKKHSLNAKDQKTAKKAHydrophilic
456-478EYSKATSKKPFEQRRKELLNKFAHydrophilic
617-645LSKTENKKFFKDLKKVSKKINKDDESNKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27KSGKKHSLNAKDQKTAKKAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 2, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
KEGG lth:KLTH0C09394g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MAPVISKKSGKKHSLNAKDQKTAKKAKLSSKVPEDEGVSGSSSEEEDDLDEVLSSGESDKDELDESSSEGEQEDGSEGSEDESEGSSEAKGEDDSKGGVSQHAEQRKLLKERKLQRKSGTQVQQIKSLWERLRVKNPPMPKEVREKLSNEIWELSKDCISDLVMKHDASRVVQTLVKYSSKARRDQIVAALKGQYYVLATSSYGKYLLVKLLHYGSKQSRQLIIDELHGSLRKLMRHREGAYVVEDLYVLYASHEQKQQMLREFWGSEYAVFRDAHKNQTLEQVCESSAEKKTIIARNLIGTISASVEKGSTGFQILHAAMRDYVKIAGEKETSEFIELLDEKYAELVHTPEGADVACTLLAKATAKERKMIIKNLKDHADKLIRNEHGNLVFITALMCVDDTVLMFKSFGPSVKEMLQSFVVDKYGRRPFLYILLGLDGKYFSPIVKKDLNRYIEYSKATSKKPFEQRRKELLNKFAPMYLSTISKYYDMILSDNLGSQFVSEVLVNDEFYDQLSDKEKEKHREIVNTVSTYFKGDVSEESHPIHKPFSVRLLKSLIQGGKWNAKEKKVEPLHSVLGLGTEFAQQFYEDIIDETNLLDWINNADSSFTIVAIYESLSKTENKKFFKDLKKVSKKINKDDESNKGARLLLKLMNNKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.85
3 0.85
4 0.82
5 0.82
6 0.81
7 0.81
8 0.79
9 0.78
10 0.75
11 0.74
12 0.75
13 0.76
14 0.79
15 0.77
16 0.77
17 0.76
18 0.74
19 0.67
20 0.62
21 0.55
22 0.46
23 0.41
24 0.33
25 0.24
26 0.19
27 0.17
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.2
88 0.27
89 0.33
90 0.34
91 0.34
92 0.4
93 0.47
94 0.54
95 0.55
96 0.56
97 0.59
98 0.68
99 0.77
100 0.79
101 0.78
102 0.76
103 0.79
104 0.77
105 0.78
106 0.76
107 0.74
108 0.75
109 0.69
110 0.69
111 0.6
112 0.57
113 0.5
114 0.49
115 0.43
116 0.43
117 0.48
118 0.47
119 0.57
120 0.59
121 0.63
122 0.61
123 0.66
124 0.63
125 0.64
126 0.63
127 0.57
128 0.6
129 0.6
130 0.6
131 0.57
132 0.53
133 0.5
134 0.51
135 0.48
136 0.4
137 0.36
138 0.31
139 0.28
140 0.27
141 0.24
142 0.19
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.17
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.25
154 0.25
155 0.2
156 0.22
157 0.17
158 0.17
159 0.19
160 0.18
161 0.2
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.26
166 0.32
167 0.36
168 0.41
169 0.41
170 0.44
171 0.46
172 0.47
173 0.5
174 0.49
175 0.45
176 0.4
177 0.38
178 0.32
179 0.29
180 0.26
181 0.17
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.18
199 0.2
200 0.19
201 0.23
202 0.24
203 0.31
204 0.34
205 0.34
206 0.35
207 0.34
208 0.35
209 0.33
210 0.29
211 0.24
212 0.22
213 0.2
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.27
222 0.32
223 0.38
224 0.4
225 0.41
226 0.4
227 0.38
228 0.35
229 0.29
230 0.23
231 0.17
232 0.14
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.04
237 0.04
238 0.08
239 0.1
240 0.13
241 0.16
242 0.16
243 0.2
244 0.24
245 0.27
246 0.29
247 0.29
248 0.27
249 0.27
250 0.27
251 0.24
252 0.22
253 0.18
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.19
261 0.21
262 0.25
263 0.27
264 0.27
265 0.25
266 0.34
267 0.33
268 0.27
269 0.26
270 0.23
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.21
280 0.25
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.23
285 0.24
286 0.21
287 0.15
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.07
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.06
351 0.13
352 0.18
353 0.19
354 0.22
355 0.23
356 0.31
357 0.34
358 0.42
359 0.44
360 0.46
361 0.51
362 0.52
363 0.57
364 0.5
365 0.46
366 0.45
367 0.43
368 0.37
369 0.35
370 0.39
371 0.34
372 0.34
373 0.35
374 0.31
375 0.25
376 0.25
377 0.21
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.06
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.1
398 0.12
399 0.13
400 0.15
401 0.18
402 0.21
403 0.19
404 0.21
405 0.2
406 0.17
407 0.17
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.18
413 0.23
414 0.24
415 0.24
416 0.25
417 0.24
418 0.29
419 0.31
420 0.23
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.06
431 0.11
432 0.13
433 0.17
434 0.24
435 0.26
436 0.33
437 0.41
438 0.45
439 0.42
440 0.45
441 0.43
442 0.4
443 0.4
444 0.36
445 0.35
446 0.35
447 0.37
448 0.39
449 0.41
450 0.46
451 0.54
452 0.62
453 0.66
454 0.72
455 0.78
456 0.8
457 0.84
458 0.84
459 0.81
460 0.79
461 0.75
462 0.68
463 0.6
464 0.52
465 0.44
466 0.36
467 0.31
468 0.23
469 0.18
470 0.16
471 0.16
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.12
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.12
484 0.11
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.11
500 0.08
501 0.1
502 0.15
503 0.17
504 0.2
505 0.29
506 0.36
507 0.42
508 0.46
509 0.53
510 0.52
511 0.58
512 0.58
513 0.58
514 0.56
515 0.5
516 0.46
517 0.4
518 0.35
519 0.31
520 0.28
521 0.2
522 0.15
523 0.14
524 0.16
525 0.18
526 0.22
527 0.21
528 0.22
529 0.25
530 0.26
531 0.26
532 0.26
533 0.23
534 0.23
535 0.23
536 0.31
537 0.37
538 0.36
539 0.38
540 0.43
541 0.42
542 0.42
543 0.46
544 0.38
545 0.31
546 0.35
547 0.36
548 0.38
549 0.4
550 0.46
551 0.44
552 0.48
553 0.54
554 0.51
555 0.57
556 0.56
557 0.57
558 0.53
559 0.53
560 0.51
561 0.44
562 0.42
563 0.31
564 0.24
565 0.19
566 0.15
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.1
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.08
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.09
588 0.1
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.14
594 0.14
595 0.11
596 0.1
597 0.09
598 0.1
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.12
604 0.14
605 0.18
606 0.23
607 0.33
608 0.4
609 0.42
610 0.47
611 0.54
612 0.62
613 0.69
614 0.73
615 0.75
616 0.78
617 0.83
618 0.84
619 0.87
620 0.87
621 0.86
622 0.86
623 0.86
624 0.81
625 0.79
626 0.81
627 0.79
628 0.77
629 0.7
630 0.61
631 0.52
632 0.48
633 0.43
634 0.38
635 0.34
636 0.31
637 0.36