Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DDZ1

Protein Details
Accession C5DDZ1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSALNQKYKKPRLQQAETAGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG lth:KLTH0C04950g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSALNQKYKKPRLQQAETAGAVAPAAPATPEAPETPATPAKYAATAESSVLDAALSDADSALGESYAACGRLAATMGLHQLAVVNLAKSMQKLPRDVGVLVDFAKALGAKANQESIVVSTLADAVQRSPELSDPRVWLQLASSYYHLLKPDEAFHSVSRAIAAQEIQGIKDAGTWALQARILLLWMDSDAKMTLETLTPYFIGAIEMAIAAGDTQLELQSRVSLAQLYHRFACYPESQAEVSRAFVLVRSDPSSGMPRPSTVNTLCYLYNFLGIIQFKMNYKASAYSVIQEAMSALPQVSATARLLATLAQFYMIDENLPQLRAILPALLVEKTALTEKELIRLYLMNWLLGRVYDMLDDTKQSYHFYQQAVNCKPQSASLWVGIGSLYLRMRQFEDAHIAFSHALNYASKLENFEQPFFLRFNRLFAAFAWVGLSQVFVATFQKQSALDALRQASVLFTAEGDLVHSSQVDQLYNDVLATPPQNPMYVIMNVPPQILLELFLYYDTGVFANQTEGNFPKISSCEPVAHIMPLYDHQASPVATLPHGPAVTPSVPPPPPQQVYNDLATRPALSQQHPSTVFLAYPQPAVTVPATSALNIKPIAKNMPGVNYGFPAQPYQNPPVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.78
4 0.69
5 0.6
6 0.5
7 0.39
8 0.31
9 0.22
10 0.14
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.06
15 0.06
16 0.08
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.16
22 0.21
23 0.26
24 0.26
25 0.25
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.26
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.1
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.04
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.1
59 0.11
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.18
77 0.21
78 0.24
79 0.27
80 0.29
81 0.33
82 0.34
83 0.33
84 0.31
85 0.26
86 0.23
87 0.21
88 0.19
89 0.15
90 0.11
91 0.12
92 0.09
93 0.07
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.14
117 0.18
118 0.2
119 0.23
120 0.24
121 0.27
122 0.29
123 0.28
124 0.23
125 0.2
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.2
133 0.2
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.21
142 0.24
143 0.22
144 0.2
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.15
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.24
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.21
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.19
246 0.2
247 0.23
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.17
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.16
272 0.15
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.11
325 0.11
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.17
333 0.17
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.17
354 0.18
355 0.22
356 0.24
357 0.33
358 0.35
359 0.38
360 0.35
361 0.32
362 0.32
363 0.28
364 0.26
365 0.21
366 0.19
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.13
372 0.11
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.15
381 0.16
382 0.15
383 0.21
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.19
388 0.17
389 0.16
390 0.15
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.21
401 0.24
402 0.23
403 0.23
404 0.22
405 0.24
406 0.22
407 0.21
408 0.2
409 0.18
410 0.2
411 0.2
412 0.2
413 0.19
414 0.18
415 0.24
416 0.18
417 0.18
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.16
435 0.16
436 0.16
437 0.19
438 0.2
439 0.18
440 0.18
441 0.17
442 0.13
443 0.11
444 0.11
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.15
474 0.17
475 0.18
476 0.17
477 0.16
478 0.19
479 0.19
480 0.18
481 0.16
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.1
500 0.1
501 0.13
502 0.14
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.2
509 0.21
510 0.22
511 0.22
512 0.23
513 0.27
514 0.25
515 0.25
516 0.23
517 0.19
518 0.17
519 0.16
520 0.19
521 0.16
522 0.15
523 0.15
524 0.18
525 0.17
526 0.17
527 0.2
528 0.17
529 0.15
530 0.17
531 0.17
532 0.19
533 0.18
534 0.17
535 0.14
536 0.18
537 0.2
538 0.19
539 0.2
540 0.23
541 0.25
542 0.28
543 0.32
544 0.36
545 0.38
546 0.39
547 0.41
548 0.41
549 0.44
550 0.46
551 0.43
552 0.35
553 0.33
554 0.32
555 0.29
556 0.23
557 0.25
558 0.25
559 0.24
560 0.33
561 0.34
562 0.41
563 0.41
564 0.43
565 0.38
566 0.34
567 0.31
568 0.25
569 0.27
570 0.2
571 0.2
572 0.18
573 0.17
574 0.16
575 0.19
576 0.18
577 0.14
578 0.13
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.18
583 0.16
584 0.19
585 0.2
586 0.23
587 0.23
588 0.26
589 0.31
590 0.3
591 0.34
592 0.33
593 0.37
594 0.37
595 0.36
596 0.34
597 0.31
598 0.31
599 0.27
600 0.25
601 0.24
602 0.24
603 0.28
604 0.33