Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNH1

Protein Details
Accession C5DNH1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-82RPSTTCAHCKELRKNKNANPTGGCTCGRQQKKRLAQKAKEEARAKHydrophilic
92-118CIETDKCTCHARRKNRRSVSSRSRTTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-84KKRLAQKAKEEARAKAK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001083  Cu_fist_DNA-bd_dom  
IPR036395  Cu_fist_DNA-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005507  F:copper ion binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG lth:KLTH0G16984g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00649  Copper-fist  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01119  COPPER_FIST_1  
PS50073  COPPER_FIST_2  
Amino Acid Sequences MVLVNGIKYACERCIRGHRVTTCNHTDQPLMMIKPKGRPSTTCAHCKELRKNKNANPTGGCTCGRQQKKRLAQKAKEEARAKAKSKDDSCRCIETDKCTCHARRKNRRSVSSRSRTTTTTTSSIASEDSPTMPTCDGPDFLGRIAKSHAMGSLPSFHSSQSLDRDFGLATSPVLSPSLSNYHGNSSNWDANSITSLKSDSRINLSDRSHQSIGLDSLHSTRAFPPQARARVGELPIPMEDYSSDLNSLSANSNFNPSGSSNRVAWSEADPNHGLLDLFADTSENVNTNYMAMKSSLKRNKSYASGLGVMTPQCAGKDPYAQITRSQSYQRDVPKHLVSRPSVDSVISHSSKVSEGANNGRETLQSNHSLPFITARQLQPRMSYGGNNFPPGCLSLDDDSAKSVEVLSLTPSFMDIPDNTNFYSATSNPFLHQQKVEPRKRSVSIHRNHRYDSFTRGASGESHTPVIQQTQSPHSRQGGEVKAEATTRAESQDADSDSAFPLSQVTPSGPSMNISPGADSNSLTQTSHVSSPRDTLTNQFMEPTSSFTSEIDHILGSNNDDVQSLFSDPTISLDATHSMNLEASPIDQAHRMPSLCYSETTGASNLDDLDKLMAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.49
3 0.53
4 0.6
5 0.62
6 0.63
7 0.67
8 0.68
9 0.65
10 0.64
11 0.6
12 0.53
13 0.47
14 0.41
15 0.41
16 0.39
17 0.34
18 0.33
19 0.36
20 0.37
21 0.44
22 0.51
23 0.53
24 0.51
25 0.51
26 0.52
27 0.57
28 0.6
29 0.62
30 0.58
31 0.58
32 0.61
33 0.67
34 0.72
35 0.73
36 0.75
37 0.75
38 0.81
39 0.81
40 0.86
41 0.83
42 0.79
43 0.72
44 0.69
45 0.63
46 0.57
47 0.51
48 0.43
49 0.44
50 0.47
51 0.51
52 0.53
53 0.58
54 0.64
55 0.73
56 0.8
57 0.84
58 0.85
59 0.84
60 0.86
61 0.89
62 0.86
63 0.85
64 0.78
65 0.74
66 0.73
67 0.74
68 0.67
69 0.64
70 0.62
71 0.62
72 0.65
73 0.69
74 0.67
75 0.65
76 0.66
77 0.64
78 0.58
79 0.55
80 0.51
81 0.49
82 0.5
83 0.47
84 0.46
85 0.48
86 0.51
87 0.56
88 0.62
89 0.65
90 0.68
91 0.75
92 0.82
93 0.85
94 0.91
95 0.87
96 0.88
97 0.88
98 0.86
99 0.83
100 0.78
101 0.7
102 0.62
103 0.61
104 0.55
105 0.49
106 0.42
107 0.35
108 0.31
109 0.28
110 0.27
111 0.23
112 0.18
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.18
140 0.17
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.21
147 0.22
148 0.23
149 0.22
150 0.22
151 0.23
152 0.21
153 0.19
154 0.17
155 0.11
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.1
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.2
169 0.24
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.28
174 0.26
175 0.26
176 0.22
177 0.19
178 0.21
179 0.19
180 0.14
181 0.1
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.15
186 0.14
187 0.18
188 0.2
189 0.22
190 0.27
191 0.29
192 0.36
193 0.37
194 0.42
195 0.37
196 0.34
197 0.32
198 0.28
199 0.27
200 0.2
201 0.17
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.13
208 0.17
209 0.2
210 0.2
211 0.26
212 0.31
213 0.37
214 0.38
215 0.37
216 0.35
217 0.37
218 0.37
219 0.33
220 0.25
221 0.21
222 0.19
223 0.19
224 0.16
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.16
245 0.17
246 0.19
247 0.17
248 0.18
249 0.19
250 0.18
251 0.18
252 0.16
253 0.19
254 0.18
255 0.21
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.17
260 0.14
261 0.08
262 0.09
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.1
280 0.12
281 0.21
282 0.27
283 0.29
284 0.31
285 0.34
286 0.35
287 0.36
288 0.36
289 0.29
290 0.27
291 0.25
292 0.23
293 0.21
294 0.19
295 0.15
296 0.13
297 0.1
298 0.08
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.12
304 0.12
305 0.18
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.25
310 0.25
311 0.24
312 0.27
313 0.23
314 0.23
315 0.28
316 0.31
317 0.32
318 0.33
319 0.36
320 0.38
321 0.39
322 0.4
323 0.4
324 0.35
325 0.34
326 0.33
327 0.3
328 0.26
329 0.22
330 0.19
331 0.18
332 0.22
333 0.19
334 0.17
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.14
340 0.1
341 0.11
342 0.16
343 0.2
344 0.2
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.18
351 0.18
352 0.19
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.16
357 0.16
358 0.14
359 0.14
360 0.17
361 0.18
362 0.24
363 0.27
364 0.28
365 0.26
366 0.27
367 0.27
368 0.24
369 0.25
370 0.21
371 0.26
372 0.26
373 0.27
374 0.26
375 0.23
376 0.22
377 0.21
378 0.2
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.13
387 0.12
388 0.09
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.1
401 0.08
402 0.11
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.15
410 0.12
411 0.15
412 0.17
413 0.17
414 0.17
415 0.25
416 0.26
417 0.27
418 0.28
419 0.28
420 0.35
421 0.46
422 0.53
423 0.52
424 0.55
425 0.58
426 0.61
427 0.62
428 0.63
429 0.62
430 0.63
431 0.68
432 0.72
433 0.69
434 0.68
435 0.65
436 0.6
437 0.52
438 0.5
439 0.43
440 0.34
441 0.32
442 0.3
443 0.26
444 0.22
445 0.23
446 0.2
447 0.18
448 0.19
449 0.17
450 0.18
451 0.17
452 0.19
453 0.17
454 0.16
455 0.17
456 0.24
457 0.3
458 0.31
459 0.35
460 0.36
461 0.36
462 0.36
463 0.4
464 0.38
465 0.35
466 0.34
467 0.3
468 0.28
469 0.27
470 0.26
471 0.2
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.14
476 0.13
477 0.15
478 0.2
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.17
483 0.17
484 0.18
485 0.15
486 0.09
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.14
494 0.16
495 0.14
496 0.15
497 0.16
498 0.17
499 0.18
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.18
513 0.23
514 0.24
515 0.24
516 0.24
517 0.28
518 0.3
519 0.3
520 0.28
521 0.28
522 0.31
523 0.31
524 0.3
525 0.28
526 0.26
527 0.27
528 0.26
529 0.27
530 0.23
531 0.21
532 0.22
533 0.2
534 0.23
535 0.2
536 0.21
537 0.17
538 0.14
539 0.12
540 0.14
541 0.15
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.14
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.14
556 0.15
557 0.13
558 0.12
559 0.14
560 0.16
561 0.16
562 0.17
563 0.15
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.09
569 0.09
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.14
574 0.15
575 0.18
576 0.22
577 0.22
578 0.2
579 0.24
580 0.29
581 0.29
582 0.3
583 0.31
584 0.29
585 0.3
586 0.32
587 0.29
588 0.23
589 0.23
590 0.22
591 0.18
592 0.16
593 0.15
594 0.13