Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNE0

Protein Details
Accession C5DNE0    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
572-598LSGTIWSKSSKIRKKNKARAAAWFRLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-303KSSHGKGHKKKP
581-591SKIRKKNKARA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006597  Sel1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG lth:KLTH0G16192g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08238  Sel1  
Amino Acid Sequences MSFSTNKVSPLDGFRGESDKSTERNTRISDIMSMRDRNGSIVSFDSVKTTERLLDKLDLSAEDEMLLQQALKEDEARRKQPEAFQQRRVVCMPASGFPSLRKPGSSSGNSNLENCEPLMNIINELSEKDRIKLSKRGDVKLFLPKSRFSYLVEEESDGESNPFHEDNLCFNGRAINIEKFRLETYAEDPKMGSSSLETEERLPFDIVPERPTLKLHSKSSVQTPVGSLSSIETRYLIKPSTQSSTESETSRSVDGRNKISESPPSWKFSTPRKSTSSTTVNKVSLSPTKTPKSSHGKGHKKKPSFSFKNLFKSPRVDNESSPAKPARQQYDATPPTNRLEFSTLHLEEGAPQSFYTNAPASASTDSPRSLASSRRFLPHHSRAASDTKIRYASASQRSGSKDASLSKEFKPKHILHPIKTTTPELPLVRDGRPLSPDSRIRVAIDLRNRGFLKESAEHLKVLCEASNPTGYLLFGLALRYGSGIEKNYVESFSYLKKAAGIKDEDSEVLNVDMDPFRLKDVPHVSPEPLAPALHECGISYLKGYGIGVIDELKAIKYLELAASKGHVDSMCLSGTIWSKSSKIRKKNKARAAAWFRLADRRGADLIGADWIYKDKYQNASVYSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.3
7 0.31
8 0.36
9 0.41
10 0.41
11 0.47
12 0.49
13 0.47
14 0.44
15 0.43
16 0.43
17 0.38
18 0.41
19 0.41
20 0.39
21 0.37
22 0.39
23 0.37
24 0.32
25 0.31
26 0.25
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.18
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.2
38 0.22
39 0.23
40 0.25
41 0.28
42 0.27
43 0.27
44 0.27
45 0.22
46 0.22
47 0.21
48 0.17
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.06
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.14
60 0.19
61 0.29
62 0.38
63 0.43
64 0.46
65 0.49
66 0.53
67 0.56
68 0.61
69 0.63
70 0.62
71 0.64
72 0.68
73 0.66
74 0.66
75 0.6
76 0.52
77 0.41
78 0.38
79 0.32
80 0.27
81 0.28
82 0.25
83 0.25
84 0.24
85 0.31
86 0.31
87 0.3
88 0.28
89 0.27
90 0.32
91 0.39
92 0.41
93 0.4
94 0.41
95 0.47
96 0.47
97 0.45
98 0.42
99 0.35
100 0.31
101 0.26
102 0.2
103 0.13
104 0.14
105 0.17
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.23
117 0.26
118 0.31
119 0.38
120 0.4
121 0.43
122 0.48
123 0.53
124 0.52
125 0.52
126 0.5
127 0.53
128 0.52
129 0.48
130 0.45
131 0.42
132 0.43
133 0.43
134 0.4
135 0.33
136 0.35
137 0.34
138 0.36
139 0.34
140 0.29
141 0.27
142 0.28
143 0.25
144 0.18
145 0.15
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.1
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.14
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.18
158 0.21
159 0.19
160 0.21
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.25
165 0.25
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.19
170 0.15
171 0.18
172 0.26
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.23
178 0.21
179 0.16
180 0.07
181 0.09
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.15
190 0.13
191 0.14
192 0.19
193 0.18
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.22
199 0.25
200 0.27
201 0.33
202 0.33
203 0.35
204 0.37
205 0.39
206 0.43
207 0.45
208 0.38
209 0.32
210 0.3
211 0.27
212 0.24
213 0.22
214 0.16
215 0.1
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.21
228 0.2
229 0.21
230 0.22
231 0.27
232 0.28
233 0.26
234 0.25
235 0.22
236 0.23
237 0.21
238 0.2
239 0.16
240 0.2
241 0.23
242 0.25
243 0.26
244 0.27
245 0.27
246 0.28
247 0.31
248 0.28
249 0.31
250 0.3
251 0.32
252 0.31
253 0.33
254 0.35
255 0.39
256 0.46
257 0.45
258 0.47
259 0.48
260 0.5
261 0.49
262 0.53
263 0.52
264 0.45
265 0.45
266 0.43
267 0.39
268 0.35
269 0.34
270 0.3
271 0.26
272 0.26
273 0.26
274 0.29
275 0.32
276 0.33
277 0.34
278 0.39
279 0.43
280 0.44
281 0.48
282 0.53
283 0.61
284 0.67
285 0.76
286 0.76
287 0.72
288 0.73
289 0.73
290 0.73
291 0.69
292 0.68
293 0.67
294 0.65
295 0.68
296 0.67
297 0.61
298 0.52
299 0.5
300 0.45
301 0.43
302 0.44
303 0.38
304 0.33
305 0.36
306 0.39
307 0.35
308 0.35
309 0.28
310 0.22
311 0.25
312 0.3
313 0.28
314 0.27
315 0.27
316 0.28
317 0.37
318 0.4
319 0.37
320 0.33
321 0.31
322 0.3
323 0.3
324 0.27
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.18
329 0.22
330 0.21
331 0.2
332 0.19
333 0.18
334 0.17
335 0.18
336 0.15
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.18
358 0.22
359 0.27
360 0.29
361 0.33
362 0.34
363 0.36
364 0.44
365 0.45
366 0.48
367 0.43
368 0.42
369 0.41
370 0.45
371 0.43
372 0.38
373 0.32
374 0.27
375 0.27
376 0.26
377 0.23
378 0.22
379 0.27
380 0.3
381 0.32
382 0.29
383 0.33
384 0.36
385 0.37
386 0.35
387 0.28
388 0.23
389 0.24
390 0.29
391 0.28
392 0.29
393 0.3
394 0.38
395 0.37
396 0.37
397 0.42
398 0.39
399 0.44
400 0.52
401 0.54
402 0.5
403 0.59
404 0.59
405 0.54
406 0.54
407 0.48
408 0.38
409 0.34
410 0.35
411 0.26
412 0.25
413 0.26
414 0.27
415 0.25
416 0.28
417 0.27
418 0.24
419 0.26
420 0.26
421 0.24
422 0.28
423 0.31
424 0.3
425 0.33
426 0.32
427 0.3
428 0.31
429 0.33
430 0.31
431 0.34
432 0.38
433 0.35
434 0.4
435 0.4
436 0.37
437 0.36
438 0.32
439 0.31
440 0.26
441 0.3
442 0.29
443 0.3
444 0.3
445 0.27
446 0.27
447 0.22
448 0.2
449 0.17
450 0.12
451 0.12
452 0.14
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.12
459 0.1
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.09
470 0.1
471 0.12
472 0.13
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.14
478 0.15
479 0.16
480 0.19
481 0.18
482 0.17
483 0.2
484 0.22
485 0.24
486 0.28
487 0.29
488 0.27
489 0.29
490 0.3
491 0.26
492 0.24
493 0.21
494 0.16
495 0.13
496 0.11
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.11
502 0.1
503 0.13
504 0.14
505 0.15
506 0.21
507 0.27
508 0.3
509 0.34
510 0.37
511 0.35
512 0.35
513 0.36
514 0.31
515 0.26
516 0.21
517 0.17
518 0.17
519 0.18
520 0.17
521 0.17
522 0.13
523 0.14
524 0.16
525 0.15
526 0.13
527 0.11
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.1
545 0.13
546 0.14
547 0.15
548 0.14
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.17
553 0.13
554 0.13
555 0.14
556 0.16
557 0.15
558 0.14
559 0.14
560 0.15
561 0.19
562 0.19
563 0.19
564 0.18
565 0.21
566 0.29
567 0.4
568 0.46
569 0.54
570 0.62
571 0.72
572 0.81
573 0.89
574 0.91
575 0.91
576 0.85
577 0.86
578 0.85
579 0.82
580 0.76
581 0.69
582 0.62
583 0.6
584 0.56
585 0.5
586 0.42
587 0.38
588 0.34
589 0.3
590 0.28
591 0.2
592 0.19
593 0.18
594 0.16
595 0.12
596 0.11
597 0.13
598 0.15
599 0.17
600 0.2
601 0.23
602 0.29
603 0.34
604 0.38