FuNGI

C5DG68

Protein Details

Accession

C5DG68

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
277-301	QVKDHKVRIKQYKREYEKMRKQLKD	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
KEGG	lth:KLTH0D02816g -
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MLSSGEERHKYDPNALPRTHNEEDGAPSSKRLKLGEDDLALFRAGSIVTLRLENFVTYALTEFHMSPSLNMIIGPNGSGKSTFVCAVCLGLAGKPEYIGRSTKIEDYIKNGEDRSVIEVTLKRDPEAEDRYVASDGTTKVTRVLHRNRKASEYFLNGQSVTESAVKRLVSELNIQLDNLCQFLSQERVEEFARLKSDKLLVETARSVDVNMVADLEDLKALQGEELVEAKELELKSSRVLELKATRDKLTASVRALENFKKKKEELGMHEKLLPYVQVKDHKVRIKQYKREYEKMRKQLKDLISDKKPFRHTQQLIETETVERNENKKKLEVQLKVSKRTFPSYLEKLEHLKEKVRGKQAQLKYYEDRTGKIKDEIVVVEHNLKEEQAKREALPVPDQGAFERIQAERKEITDKGVELEQQRTDLNANLVNADYHMDILKRKLQQENESLVSTDRIGILDGKRFEELRNAVLFMRSRPEMQGKVLEPPIMSISVKDPQFASYLGTCTDFATSLALTVVDSDSYRTFGDELLNKFRVNIRELSAAPTTSPLPLSELRKLGFQGYLSDFLSGDNGVLKMLCQQHKLHTIPVSRTAMSSRLMDYLMKPDESNNLKFRRVIAGNYVYDFKRSAYGRRQIFSSEFKVRPCQFFKGSVLTEERKGEIKESMARINGQIQAKKDEVQFITQKIQELRSELQSNKQEDAELHKITSKLNDQKKTIAHCSHRIKALENKLSMLKTDLQQDVTTKINDCRESIKSSLREQVKVMSGITQFVAKLQGLQREISLATIEHLEAFNTERSMNEVIGFFNEKEEQLRGAYEEAKNKYASMKETDEYRGWMDKIRHYTDAEKTQLADLAEKYQQSNNFDLSFISNTIDRLRSEIGMLNQDESVLEIMRQTEAELGELDCVVPRKEAALLEIRRTIQEKRSQLEPKLDAIVEKISQNFCALFKNVGSAGAVRLDKPEQFSDWKIEIMVKFRDNATLKRLDSHTQSGGERAVSTVLYMIALQDVTSAPFRVVDEINQGMDSRNERIVHKSMVESACSQNNSQYILVTPKLLTQLHYHEKVRIHCVMAGAWIPDPIVDHDKIRFGQTSNYVF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.57
3	0.59
4	0.58
5	0.65
6	0.58
7	0.52
8	0.44
9	0.38
10	0.42
11	0.4
12	0.39
13	0.3
14	0.31
15	0.34
16	0.36
17	0.37
18	0.33
19	0.33
20	0.34
21	0.4
22	0.43
23	0.41
24	0.4
25	0.38
26	0.37
27	0.33
28	0.26
29	0.2
30	0.14
31	0.1
32	0.08
33	0.08
34	0.09
35	0.11
36	0.13
37	0.13
38	0.15
39	0.16
40	0.15
41	0.14
42	0.13
43	0.12
44	0.1
45	0.11
46	0.1
47	0.11
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.17
52	0.16
53	0.16
54	0.19
55	0.18
56	0.16
57	0.16
58	0.15
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.12
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.13
68	0.15
69	0.17
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.15
75	0.14
76	0.12
77	0.11
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.14
83	0.15
84	0.17
85	0.19
86	0.19
87	0.23
88	0.25
89	0.28
90	0.33
91	0.36
92	0.35
93	0.39
94	0.43
95	0.41
96	0.41
97	0.38
98	0.32
99	0.29
100	0.29
101	0.27
102	0.2
103	0.18
104	0.2
105	0.23
106	0.26
107	0.31
108	0.31
109	0.26
110	0.27
111	0.3
112	0.34
113	0.36
114	0.35
115	0.3
116	0.3
117	0.32
118	0.3
119	0.27
120	0.2
121	0.19
122	0.17
123	0.19
124	0.2
125	0.17
126	0.21
127	0.26
128	0.31
129	0.36
130	0.46
131	0.52
132	0.6
133	0.68
134	0.68
135	0.7
136	0.67
137	0.63
138	0.59
139	0.55
140	0.51
141	0.46
142	0.45
143	0.38
144	0.35
145	0.3
146	0.23
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.15
151	0.18
152	0.18
153	0.18
154	0.2
155	0.2
156	0.17
157	0.22
158	0.25
159	0.26
160	0.26
161	0.25
162	0.23
163	0.23
164	0.21
165	0.16
166	0.12
167	0.07
168	0.08
169	0.1
170	0.15
171	0.13
172	0.15
173	0.15
174	0.18
175	0.19
176	0.21
177	0.21
178	0.2
179	0.24
180	0.23
181	0.23
182	0.23
183	0.27
184	0.26
185	0.28
186	0.29
187	0.25
188	0.27
189	0.28
190	0.26
191	0.24
192	0.22
193	0.19
194	0.14
195	0.15
196	0.13
197	0.11
198	0.1
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.18
224	0.2
225	0.18
226	0.18
227	0.23
228	0.27
229	0.33
230	0.39
231	0.39
232	0.39
233	0.38
234	0.38
235	0.37
236	0.37
237	0.35
238	0.29
239	0.32
240	0.31
241	0.34
242	0.37
243	0.38
244	0.42
245	0.43
246	0.46
247	0.47
248	0.46
249	0.49
250	0.54
251	0.55
252	0.54
253	0.57
254	0.58
255	0.53
256	0.55
257	0.49
258	0.41
259	0.33
260	0.26
261	0.17
262	0.17
263	0.2
264	0.24
265	0.29
266	0.35
267	0.42
268	0.47
269	0.51
270	0.57
271	0.63
272	0.66
273	0.71
274	0.75
275	0.78
276	0.79
277	0.83
278	0.84
279	0.84
280	0.84
281	0.85
282	0.84
283	0.76
284	0.72
285	0.71
286	0.66
287	0.64
288	0.59
289	0.58
290	0.56
291	0.6
292	0.6
293	0.59
294	0.6
295	0.54
296	0.55
297	0.58
298	0.53
299	0.54
300	0.59
301	0.57
302	0.54
303	0.51
304	0.45
305	0.37
306	0.35
307	0.28
308	0.22
309	0.2
310	0.23
311	0.3
312	0.33
313	0.33
314	0.36
315	0.39
316	0.45
317	0.51
318	0.51
319	0.51
320	0.57
321	0.6
322	0.64
323	0.61
324	0.58
325	0.51
326	0.51
327	0.45
328	0.4
329	0.43
330	0.4
331	0.43
332	0.4
333	0.39
334	0.38
335	0.39
336	0.4
337	0.34
338	0.33
339	0.35
340	0.4
341	0.45
342	0.5
343	0.51
344	0.51
345	0.59
346	0.6
347	0.6
348	0.57
349	0.55
350	0.51
351	0.5
352	0.51
353	0.42
354	0.38
355	0.35
356	0.35
357	0.32
358	0.3
359	0.28
360	0.22
361	0.24
362	0.22
363	0.2
364	0.17
365	0.16
366	0.17
367	0.15
368	0.15
369	0.13
370	0.13
371	0.14
372	0.18
373	0.21
374	0.22
375	0.23
376	0.23
377	0.28
378	0.32
379	0.3
380	0.29
381	0.26
382	0.25
383	0.25
384	0.25
385	0.2
386	0.18
387	0.17
388	0.14
389	0.15
390	0.13
391	0.17
392	0.17
393	0.2
394	0.19
395	0.2
396	0.24
397	0.21
398	0.23
399	0.19
400	0.19
401	0.18
402	0.17
403	0.19
404	0.17
405	0.19
406	0.17
407	0.16
408	0.16
409	0.15
410	0.15
411	0.13
412	0.13
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.1
426	0.16
427	0.18
428	0.22
429	0.27
430	0.3
431	0.35
432	0.4
433	0.42
434	0.38
435	0.35
436	0.32
437	0.27
438	0.23
439	0.18
440	0.13
441	0.09
442	0.06
443	0.07
444	0.09
445	0.1
446	0.14
447	0.14
448	0.15
449	0.16
450	0.16
451	0.16
452	0.19
453	0.19
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.16
458	0.18
459	0.19
460	0.14
461	0.16
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.19
466	0.18
467	0.19
468	0.23
469	0.2
470	0.23
471	0.23
472	0.22
473	0.17
474	0.17
475	0.16
476	0.12
477	0.11
478	0.08
479	0.1
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.13
484	0.13
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.09
489	0.1
490	0.1
491	0.11
492	0.1
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.1
515	0.13
516	0.16
517	0.2
518	0.21
519	0.21
520	0.21
521	0.24
522	0.24
523	0.22
524	0.21
525	0.18
526	0.2
527	0.2
528	0.23
529	0.2
530	0.18
531	0.16
532	0.15
533	0.13
534	0.1
535	0.1
536	0.06
537	0.09
538	0.12
539	0.15
540	0.17
541	0.19
542	0.19
543	0.19
544	0.2
545	0.18
546	0.15
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.11
555	0.11
556	0.08
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.08
564	0.14
565	0.15
566	0.18
567	0.19
568	0.23
569	0.3
570	0.31
571	0.29
572	0.29
573	0.31
574	0.3
575	0.35
576	0.33
577	0.26
578	0.26
579	0.24
580	0.21
581	0.19
582	0.18
583	0.13
584	0.12
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.15
589	0.14
590	0.14
591	0.13
592	0.13
593	0.19
594	0.22
595	0.26
596	0.27
597	0.29
598	0.3
599	0.31
600	0.31
601	0.31
602	0.28
603	0.25
604	0.24
605	0.26
606	0.26
607	0.26
608	0.27
609	0.21
610	0.21
611	0.2
612	0.15
613	0.15
614	0.16
615	0.21
616	0.26
617	0.34
618	0.36
619	0.37
620	0.37
621	0.34
622	0.37
623	0.35
624	0.33
625	0.33
626	0.32
627	0.32
628	0.39
629	0.39
630	0.42
631	0.41
632	0.4
633	0.34
634	0.35
635	0.36
636	0.33
637	0.31
638	0.28
639	0.3
640	0.27
641	0.27
642	0.25
643	0.24
644	0.21
645	0.21
646	0.2
647	0.16
648	0.17
649	0.19
650	0.21
651	0.22
652	0.2
653	0.2
654	0.2
655	0.21
656	0.24
657	0.23
658	0.23
659	0.22
660	0.25
661	0.25
662	0.27
663	0.25
664	0.25
665	0.22
666	0.25
667	0.25
668	0.24
669	0.27
670	0.26
671	0.28
672	0.24
673	0.26
674	0.22
675	0.23
676	0.23
677	0.23
678	0.27
679	0.24
680	0.3
681	0.34
682	0.36
683	0.33
684	0.31
685	0.27
686	0.24
687	0.31
688	0.29
689	0.23
690	0.21
691	0.22
692	0.23
693	0.22
694	0.26
695	0.25
696	0.29
697	0.36
698	0.41
699	0.41
700	0.45
701	0.49
702	0.51
703	0.51
704	0.49
705	0.46
706	0.5
707	0.55
708	0.54
709	0.56
710	0.51
711	0.48
712	0.49
713	0.53
714	0.5
715	0.43
716	0.41
717	0.39
718	0.38
719	0.34
720	0.29
721	0.22
722	0.18
723	0.22
724	0.22
725	0.2
726	0.21
727	0.22
728	0.21
729	0.21
730	0.2
731	0.17
732	0.19
733	0.23
734	0.23
735	0.23
736	0.25
737	0.26
738	0.29
739	0.3
740	0.34
741	0.32
742	0.34
743	0.4
744	0.4
745	0.38
746	0.35
747	0.36
748	0.32
749	0.29
750	0.26
751	0.23
752	0.2
753	0.19
754	0.18
755	0.15
756	0.12
757	0.11
758	0.13
759	0.09
760	0.12
761	0.15
762	0.19
763	0.2
764	0.21
765	0.2
766	0.19
767	0.19
768	0.16
769	0.13
770	0.08
771	0.08
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.09
779	0.09
780	0.1
781	0.1
782	0.09
783	0.12
784	0.14
785	0.13
786	0.13
787	0.12
788	0.11
789	0.13
790	0.16
791	0.12
792	0.13
793	0.14
794	0.13
795	0.14
796	0.15
797	0.14
798	0.12
799	0.13
800	0.12
801	0.13
802	0.17
803	0.19
804	0.25
805	0.27
806	0.29
807	0.29
808	0.28
809	0.3
810	0.28
811	0.28
812	0.26
813	0.27
814	0.26
815	0.29
816	0.33
817	0.3
818	0.29
819	0.28
820	0.26
821	0.23
822	0.27
823	0.28
824	0.3
825	0.36
826	0.38
827	0.38
828	0.38
829	0.42
830	0.44
831	0.47
832	0.43
833	0.37
834	0.34
835	0.32
836	0.32
837	0.27
838	0.23
839	0.16
840	0.17
841	0.19
842	0.19
843	0.2
844	0.21
845	0.25
846	0.26
847	0.28
848	0.27
849	0.25
850	0.24
851	0.24
852	0.22
853	0.2
854	0.16
855	0.15
856	0.13
857	0.13
858	0.16
859	0.18
860	0.15
861	0.17
862	0.18
863	0.17
864	0.18
865	0.21
866	0.2
867	0.23
868	0.24
869	0.21
870	0.2
871	0.19
872	0.17
873	0.14
874	0.13
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.08
879	0.08
880	0.08
881	0.08
882	0.09
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.1
889	0.09
890	0.09
891	0.1
892	0.1
893	0.1
894	0.1
895	0.1
896	0.13
897	0.13
898	0.15
899	0.22
900	0.24
901	0.27
902	0.31
903	0.31
904	0.31
905	0.34
906	0.35
907	0.33
908	0.4
909	0.42
910	0.41
911	0.49
912	0.53
913	0.55
914	0.59
915	0.54
916	0.48
917	0.46
918	0.43
919	0.34
920	0.3
921	0.28
922	0.21
923	0.2
924	0.21
925	0.18
926	0.19
927	0.2
928	0.19
929	0.17
930	0.19
931	0.19
932	0.18
933	0.17
934	0.19
935	0.18
936	0.18
937	0.18
938	0.14
939	0.14
940	0.17
941	0.18
942	0.15
943	0.18
944	0.2
945	0.21
946	0.25
947	0.26
948	0.24
949	0.28
950	0.3
951	0.33
952	0.32
953	0.31
954	0.27
955	0.3
956	0.28
957	0.29
958	0.32
959	0.27
960	0.27
961	0.27
962	0.35
963	0.34
964	0.36
965	0.36
966	0.39
967	0.38
968	0.42
969	0.45
970	0.41
971	0.43
972	0.45
973	0.43
974	0.39
975	0.39
976	0.35
977	0.34
978	0.3
979	0.24
980	0.19
981	0.16
982	0.12
983	0.12
984	0.1
985	0.08
986	0.08
987	0.07
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.09
995	0.1
996	0.11
997	0.1
998	0.12
999	0.13
1000	0.15
1001	0.16
1002	0.16
1003	0.2
1004	0.21
1005	0.22
1006	0.21
1007	0.21
1008	0.18
1009	0.21
1010	0.22
1011	0.2
1012	0.24
1013	0.25
1014	0.27
1015	0.33
1016	0.36
1017	0.36
1018	0.35
1019	0.34
1020	0.36
1021	0.36
1022	0.37
1023	0.34
1024	0.33
1025	0.36
1026	0.36
1027	0.34
1028	0.31
1029	0.31
1030	0.32
1031	0.29
1032	0.25
1033	0.22
1034	0.25
1035	0.25
1036	0.23
1037	0.21
1038	0.21
1039	0.26
1040	0.25
1041	0.25
1042	0.25
1043	0.33
1044	0.4
1045	0.46
1046	0.45
1047	0.45
1048	0.51
1049	0.54
1050	0.55
1051	0.5
1052	0.43
1053	0.39
1054	0.39
1055	0.33
1056	0.31
1057	0.28
1058	0.22
1059	0.19
1060	0.17
1061	0.15
1062	0.13
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.19
1066	0.2
1067	0.22
1068	0.24
1069	0.3
1070	0.31
1071	0.33
1072	0.31
1073	0.28
1074	0.33

C5DG68

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer