Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBM9

Protein Details
Accession C5DBM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105TAPAKVGKRQGLRKKKQVDYISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-99SKKRKIEPTAPAKVGKRQGLRKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lth:KLTH0A03960g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
Amino Acid Sequences MTKDVCSYCSSDGADGAVWVQCEVCDQWVHVTCIPIKYLTNEMREPLDSYPKLARQIKRFSCSAHGSPVLEVKSTSKKRKIEPTAPAKVGKRQGLRKKKQVDYISLNEGDDKRLKDEHPHMHAFLACFSKWENKTNVIESSRLERDFNAITIPMKVQDPENSGMRIPEYSEGRAFTVDTVTKFLGADYPVDVMDVQSQQNSTWSMSQWNQYFTETAADARDRIRNVISLEVSHVDQFKTGLRRPRVVESHDLVDLLWEEVKDDIPRPKVTKYVLMSVGNAYTDFHLDFAGTSVYYKVIFGSKKFILFPPTPHNLKAYESWCGNDHQNLIFLGDQLEQGVAMELRAGDLFMIPSGFIHAVFTPQDSLVVGGNFLTLRDLATQLVVTEIEKLTKVPKKFTFPQFEAVMGKTAELTLQKSGTDEDLALSIEKEEALLEYIKTPTFKYKPVNFSTKRELISQFQKHIEARSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.15
3 0.14
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.13
14 0.2
15 0.25
16 0.29
17 0.28
18 0.32
19 0.32
20 0.34
21 0.34
22 0.29
23 0.25
24 0.25
25 0.32
26 0.33
27 0.36
28 0.35
29 0.36
30 0.37
31 0.37
32 0.36
33 0.31
34 0.35
35 0.29
36 0.31
37 0.36
38 0.36
39 0.44
40 0.5
41 0.53
42 0.52
43 0.63
44 0.67
45 0.66
46 0.64
47 0.58
48 0.58
49 0.58
50 0.52
51 0.48
52 0.43
53 0.39
54 0.38
55 0.4
56 0.33
57 0.26
58 0.24
59 0.22
60 0.3
61 0.38
62 0.46
63 0.49
64 0.55
65 0.62
66 0.72
67 0.77
68 0.76
69 0.77
70 0.78
71 0.78
72 0.75
73 0.74
74 0.66
75 0.64
76 0.62
77 0.59
78 0.57
79 0.58
80 0.65
81 0.71
82 0.77
83 0.79
84 0.82
85 0.81
86 0.82
87 0.77
88 0.75
89 0.71
90 0.67
91 0.63
92 0.54
93 0.48
94 0.43
95 0.37
96 0.33
97 0.3
98 0.26
99 0.23
100 0.25
101 0.26
102 0.3
103 0.38
104 0.43
105 0.46
106 0.48
107 0.45
108 0.44
109 0.44
110 0.37
111 0.31
112 0.26
113 0.19
114 0.17
115 0.18
116 0.24
117 0.25
118 0.3
119 0.3
120 0.33
121 0.36
122 0.38
123 0.42
124 0.35
125 0.34
126 0.3
127 0.33
128 0.31
129 0.29
130 0.26
131 0.21
132 0.23
133 0.22
134 0.21
135 0.16
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.14
145 0.17
146 0.19
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.15
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.06
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.13
192 0.15
193 0.2
194 0.2
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.2
199 0.17
200 0.17
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.14
226 0.17
227 0.24
228 0.26
229 0.31
230 0.33
231 0.39
232 0.39
233 0.38
234 0.4
235 0.34
236 0.33
237 0.29
238 0.26
239 0.2
240 0.16
241 0.13
242 0.08
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.13
251 0.16
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.25
256 0.26
257 0.31
258 0.28
259 0.3
260 0.31
261 0.29
262 0.29
263 0.26
264 0.24
265 0.18
266 0.15
267 0.11
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.1
285 0.12
286 0.12
287 0.18
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.28
295 0.29
296 0.34
297 0.35
298 0.34
299 0.35
300 0.3
301 0.31
302 0.32
303 0.27
304 0.25
305 0.23
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.24
310 0.21
311 0.21
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.17
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.05
327 0.04
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.08
344 0.07
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.19
378 0.25
379 0.27
380 0.33
381 0.39
382 0.46
383 0.55
384 0.64
385 0.65
386 0.62
387 0.66
388 0.59
389 0.55
390 0.49
391 0.41
392 0.35
393 0.25
394 0.22
395 0.16
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.15
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.17
406 0.16
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.14
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.26
428 0.29
429 0.35
430 0.43
431 0.5
432 0.57
433 0.64
434 0.73
435 0.69
436 0.73
437 0.75
438 0.72
439 0.65
440 0.61
441 0.57
442 0.55
443 0.6
444 0.6
445 0.56
446 0.53
447 0.57
448 0.54