FuNGI

C5DJK2

Protein Details

Accession

C5DJK2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	lth:KLTH0F17116g -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEDTPQIEDGVALPIDYAGPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENRPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAQIQNEERERVLLEKEDMGEIIDDSVRNKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWTSFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRADPQYNPNTSHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRRRQRVQDTINMSEEDKAALLQQDSQKPFLWLHISVLREYLAVELFVPRLSFEFDTERAVDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRENSIDILVEIWKTILPRLKTYMTCDGELNLDSVELLLQHLGAREPQMFKDRFQQEIRKQEAAKRRKMLKSNNNVTKGKTDRNFTIPLENMPVYDVSGNAADGSLNLSNRDFVKLRKEMNLANEGDKKSAAALKIQSEQNTQPTKDYTKEEISSAVEVANEANFSAASSLKQKLIERKAEAVQENGEDKENVEESEKPMNDAIKRKFEEVDDPEESTSVDAESQTPSSISVVHTGNVKSGVVDTDEEVKLFEPGYHDRYYTAKFHIDERDIDQLRKEVVRSYVEGVSWVLLYYYQGCASWNWYYPYHYAPFASDFKDIKDLKITFEKGEPFLPFEQLMSVLPAASGHNLPSIFRPLMSEPDSEIIDFYPEEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDEKRLLRVVRDQYERLSPEEKARNVRKQEVLLISNKNVNYEKFSSKLYGATPVEVVVFQHFRSGLSGQAMVDQEGFAPNGKLICPVSGGGLPDLSTNLFLKVGYKMPTLPGPSKSVILNGFIPPQPMLTAQDRDAIVYRYNHRWNAMDMKHNIVPVGPCATTQYQPRMGGYKSFLFYQQSHSAQPVSRFQQQEQSGYSRPQNSRYGGGGGGSSNRGRFGGPHSAPGAYNSRYSASNRQGPPSGRGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.58
7	0.57
8	0.54
9	0.46
10	0.41
11	0.34
12	0.31
13	0.28
14	0.21
15	0.15
16	0.12
17	0.12
18	0.15
19	0.13
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.09
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.17
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.16
38	0.13
39	0.12
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.23
50	0.28
51	0.37
52	0.47
53	0.53
54	0.57
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.58
59	0.49
60	0.41
61	0.36
62	0.31
63	0.27
64	0.2
65	0.14
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.24
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.78
107	0.77
108	0.75
109	0.75
110	0.72
111	0.65
112	0.7
113	0.66
114	0.6
115	0.56
116	0.48
117	0.39
118	0.35
119	0.33
120	0.24
121	0.22
122	0.21
123	0.18
124	0.19
125	0.19
126	0.19
127	0.18
128	0.16
129	0.14
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.18
136	0.19
137	0.19
138	0.2
139	0.25
140	0.32
141	0.39
142	0.46
143	0.44
144	0.48
145	0.54
146	0.55
147	0.49
148	0.41
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.17
161	0.16
162	0.17
163	0.19
164	0.18
165	0.17
166	0.17
167	0.17
168	0.21
169	0.22
170	0.22
171	0.3
172	0.33
173	0.33
174	0.36
175	0.36
176	0.31
177	0.32
178	0.3
179	0.21
180	0.2
181	0.18
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.29
201	0.32
202	0.37
203	0.43
204	0.45
205	0.45
206	0.52
207	0.51
208	0.53
209	0.54
210	0.47
211	0.46
212	0.42
213	0.41
214	0.31
215	0.25
216	0.21
217	0.19
218	0.18
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.29
243	0.3
244	0.32
245	0.34
246	0.39
247	0.41
248	0.45
249	0.44
250	0.42
251	0.5
252	0.53
253	0.53
254	0.54
255	0.55
256	0.52
257	0.53
258	0.51
259	0.41
260	0.33
261	0.28
262	0.2
263	0.13
264	0.1
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.12
269	0.17
270	0.24
271	0.26
272	0.28
273	0.28
274	0.28
275	0.28
276	0.26
277	0.24
278	0.18
279	0.2
280	0.21
281	0.22
282	0.2
283	0.21
284	0.18
285	0.14
286	0.14
287	0.11
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.14
301	0.14
302	0.17
303	0.17
304	0.18
305	0.15
306	0.16
307	0.14
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.15
328	0.19
329	0.18
330	0.18
331	0.19
332	0.18
333	0.18
334	0.17
335	0.12
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.09
345	0.13
346	0.14
347	0.17
348	0.21
349	0.25
350	0.25
351	0.3
352	0.37
353	0.34
354	0.34
355	0.32
356	0.28
357	0.25
358	0.24
359	0.2
360	0.1
361	0.08
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.07
374	0.09
375	0.11
376	0.12
377	0.2
378	0.2
379	0.21
380	0.3
381	0.31
382	0.34
383	0.37
384	0.45
385	0.44
386	0.52
387	0.56
388	0.51
389	0.49
390	0.51
391	0.56
392	0.55
393	0.56
394	0.54
395	0.58
396	0.6
397	0.67
398	0.71
399	0.71
400	0.73
401	0.76
402	0.76
403	0.75
404	0.7
405	0.63
406	0.6
407	0.54
408	0.51
409	0.44
410	0.4
411	0.35
412	0.38
413	0.4
414	0.34
415	0.34
416	0.28
417	0.25
418	0.25
419	0.22
420	0.18
421	0.15
422	0.14
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.12
441	0.11
442	0.12
443	0.19
444	0.23
445	0.25
446	0.27
447	0.29
448	0.28
449	0.31
450	0.34
451	0.28
452	0.27
453	0.3
454	0.27
455	0.25
456	0.23
457	0.19
458	0.15
459	0.16
460	0.13
461	0.11
462	0.12
463	0.14
464	0.19
465	0.2
466	0.2
467	0.21
468	0.22
469	0.26
470	0.28
471	0.26
472	0.22
473	0.23
474	0.24
475	0.24
476	0.27
477	0.24
478	0.24
479	0.24
480	0.23
481	0.23
482	0.21
483	0.19
484	0.15
485	0.11
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.05
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.03
494	0.03
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.13
502	0.16
503	0.23
504	0.29
505	0.33
506	0.32
507	0.34
508	0.35
509	0.37
510	0.36
511	0.29
512	0.23
513	0.2
514	0.19
515	0.16
516	0.14
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.11
525	0.17
526	0.17
527	0.16
528	0.17
529	0.19
530	0.22
531	0.28
532	0.3
533	0.32
534	0.33
535	0.34
536	0.34
537	0.32
538	0.35
539	0.31
540	0.34
541	0.27
542	0.26
543	0.25
544	0.24
545	0.23
546	0.16
547	0.12
548	0.06
549	0.05
550	0.04
551	0.05
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.14
564	0.13
565	0.14
566	0.14
567	0.13
568	0.09
569	0.09
570	0.09
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.08
583	0.12
584	0.16
585	0.17
586	0.17
587	0.17
588	0.2
589	0.22
590	0.22
591	0.22
592	0.21
593	0.21
594	0.25
595	0.29
596	0.28
597	0.27
598	0.27
599	0.33
600	0.31
601	0.3
602	0.27
603	0.24
604	0.24
605	0.23
606	0.2
607	0.14
608	0.16
609	0.18
610	0.18
611	0.2
612	0.2
613	0.18
614	0.19
615	0.16
616	0.13
617	0.11
618	0.09
619	0.06
620	0.05
621	0.05
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.12
629	0.13
630	0.15
631	0.17
632	0.18
633	0.2
634	0.21
635	0.25
636	0.23
637	0.21
638	0.19
639	0.18
640	0.21
641	0.21
642	0.21
643	0.21
644	0.2
645	0.2
646	0.28
647	0.27
648	0.24
649	0.29
650	0.28
651	0.27
652	0.33
653	0.34
654	0.27
655	0.3
656	0.31
657	0.25
658	0.27
659	0.25
660	0.21
661	0.21
662	0.21
663	0.17
664	0.15
665	0.14
666	0.12
667	0.11
668	0.09
669	0.08
670	0.07
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.08
675	0.08
676	0.07
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.12
681	0.16
682	0.15
683	0.15
684	0.17
685	0.16
686	0.21
687	0.23
688	0.22
689	0.18
690	0.2
691	0.2
692	0.17
693	0.16
694	0.11
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.09
703	0.11
704	0.14
705	0.13
706	0.14
707	0.15
708	0.14
709	0.16
710	0.18
711	0.18
712	0.15
713	0.15
714	0.16
715	0.18
716	0.19
717	0.18
718	0.15
719	0.13
720	0.14
721	0.13
722	0.13
723	0.1
724	0.1
725	0.14
726	0.2
727	0.2
728	0.21
729	0.29
730	0.35
731	0.42
732	0.46
733	0.43
734	0.4
735	0.46
736	0.46
737	0.41
738	0.36
739	0.3
740	0.33
741	0.4
742	0.41
743	0.44
744	0.51
745	0.56
746	0.59
747	0.64
748	0.6
749	0.54
750	0.57
751	0.53
752	0.48
753	0.45
754	0.43
755	0.38
756	0.39
757	0.37
758	0.34
759	0.31
760	0.28
761	0.29
762	0.3
763	0.31
764	0.28
765	0.3
766	0.29
767	0.27
768	0.29
769	0.24
770	0.27
771	0.25
772	0.24
773	0.22
774	0.2
775	0.19
776	0.17
777	0.16
778	0.12
779	0.13
780	0.12
781	0.14
782	0.14
783	0.14
784	0.16
785	0.16
786	0.15
787	0.15
788	0.17
789	0.14
790	0.18
791	0.18
792	0.16
793	0.15
794	0.13
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.08
799	0.08
800	0.09
801	0.09
802	0.1
803	0.12
804	0.12
805	0.12
806	0.12
807	0.12
808	0.14
809	0.14
810	0.15
811	0.13
812	0.13
813	0.12
814	0.11
815	0.12
816	0.1
817	0.1
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.11
823	0.13
824	0.17
825	0.18
826	0.19
827	0.19
828	0.21
829	0.26
830	0.3
831	0.32
832	0.31
833	0.33
834	0.33
835	0.34
836	0.31
837	0.31
838	0.27
839	0.25
840	0.24
841	0.22
842	0.24
843	0.23
844	0.24
845	0.2
846	0.19
847	0.18
848	0.16
849	0.19
850	0.2
851	0.23
852	0.22
853	0.27
854	0.26
855	0.27
856	0.28
857	0.26
858	0.25
859	0.27
860	0.32
861	0.35
862	0.42
863	0.43
864	0.44
865	0.43
866	0.44
867	0.48
868	0.48
869	0.48
870	0.44
871	0.47
872	0.46
873	0.45
874	0.4
875	0.32
876	0.28
877	0.22
878	0.24
879	0.18
880	0.16
881	0.21
882	0.24
883	0.26
884	0.3
885	0.35
886	0.37
887	0.39
888	0.41
889	0.41
890	0.39
891	0.4
892	0.39
893	0.38
894	0.33
895	0.33
896	0.33
897	0.33
898	0.33
899	0.35
900	0.39
901	0.36
902	0.36
903	0.36
904	0.37
905	0.36
906	0.4
907	0.4
908	0.38
909	0.43
910	0.45
911	0.44
912	0.5
913	0.49
914	0.49
915	0.46
916	0.46
917	0.42
918	0.44
919	0.49
920	0.48
921	0.48
922	0.5
923	0.53
924	0.5
925	0.5
926	0.48
927	0.44
928	0.35
929	0.33
930	0.27
931	0.22
932	0.21
933	0.21
934	0.21
935	0.19
936	0.2
937	0.19
938	0.19
939	0.2
940	0.23
941	0.3
942	0.29
943	0.34
944	0.34
945	0.36
946	0.35
947	0.37
948	0.37
949	0.28
950	0.29
951	0.26
952	0.26
953	0.28
954	0.33
955	0.38
956	0.4
957	0.48
958	0.49
959	0.53
960	0.58
961	0.58
962	0.6

C5DJK2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer