Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E296

Protein Details
Accession C5E296    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-269GHTNKAVKSARRARKNKIRCILILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-260ARRARK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR006011  Syntaxin_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG lth:KLTH0H03168g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PF00804  Syntaxin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15849  SNARE_Sso1  
cd00179  SynN  
Amino Acid Sequences MSYNNPYQNDNPYTENYAMQDSVGHAQSGGDFVTFMNGINQINVELDDYANLINQIDSSQRRLLTEVNEDQELAMRQHLDGLVSRASDLQYQLRNKIKSAQQQGASDPSKQAQAENSRQRFLKLIQDYRITEANYKEQNKDQAKRQYRIIQPEATDDEVEAAISDVGGQQIFSQALLNANRRGEAKTALAEVQARHQELLKLEKTMAELTQLFNDMEQLVIEQQENIEVIDKNVEDAQQDVEQGVGHTNKAVKSARRARKNKIRCILILVVIVIVIVLAIALPLGLRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.3
4 0.29
5 0.25
6 0.22
7 0.19
8 0.16
9 0.19
10 0.17
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.11
17 0.07
18 0.06
19 0.06
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.11
44 0.13
45 0.17
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.24
50 0.26
51 0.24
52 0.29
53 0.29
54 0.28
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.25
59 0.22
60 0.16
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.2
78 0.22
79 0.29
80 0.35
81 0.36
82 0.35
83 0.4
84 0.42
85 0.44
86 0.49
87 0.48
88 0.45
89 0.46
90 0.46
91 0.47
92 0.42
93 0.34
94 0.28
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.23
101 0.32
102 0.4
103 0.42
104 0.42
105 0.42
106 0.42
107 0.38
108 0.33
109 0.33
110 0.3
111 0.32
112 0.32
113 0.36
114 0.36
115 0.36
116 0.37
117 0.29
118 0.25
119 0.22
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.35
126 0.39
127 0.41
128 0.43
129 0.47
130 0.52
131 0.52
132 0.55
133 0.54
134 0.53
135 0.57
136 0.52
137 0.44
138 0.38
139 0.38
140 0.35
141 0.28
142 0.23
143 0.16
144 0.13
145 0.1
146 0.09
147 0.06
148 0.05
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.09
163 0.12
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.14
179 0.17
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.26
187 0.22
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.1
223 0.11
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.16
236 0.16
237 0.22
238 0.27
239 0.27
240 0.37
241 0.48
242 0.56
243 0.64
244 0.7
245 0.76
246 0.81
247 0.87
248 0.87
249 0.86
250 0.82
251 0.72
252 0.72
253 0.65
254 0.57
255 0.48
256 0.37
257 0.28
258 0.21
259 0.19
260 0.11
261 0.07
262 0.04
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02