FuNGI

C5DKJ2

Protein Details

Accession

C5DKJ2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
544-566	KLIRKCQLMIKRKPQRREKMSTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	lth:KLTH0F05148g -
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MSYAENIEQAISNCRQQTVLMQRCLSQGKLMDALKHTSIMLTELRSPTLSPKQYYELYILIYDSLSILSSYFVECHPKKHHLADLYELVQYAGNILPRLYLMITVGSSYLQSSDAPREEILKDMIEMCKGVQNPIRGLFLRYYLSQRTKPFFETEDPEAKRANISLIVANFIEMNKLWVRLQHQGPLREREQRTRERKELKILVGTNLVRLSQIVESDFAMYRDEILPLVLEQVVQCRDIVSQEYLLDVICQVFPDEFHLGTLSELLSTTLKLSPAAPVNEVVLTLVERLNGYIDRQEHPGPDELAKKLESLDISSESQNVFFVFWKFLNQLNEERPDLSLQEFAPIIKGILKLTLRWYPDNLSNVDVLLKFMYEKCKESGQTVPEDYDYLFQELLLANDLRHDPRFFYQVLTKCESYQKLFRVQNKGLQKFCVNEILDAITHADLRISSETELQKILGVCEVMIEVGAEKASSSLILDEDDGTDAEKWSLNADQEKLAKIAHLCYNKSIEKHTELLIACREWFQKGDKNAKYLYPAVICNIWKLIRKCQLMIKRKPQRREKMSTTIKQLFKLASRTINELYNTCEGGCLDLLYKLNLQTASLADQLELGDIAYDFFSQAFTIFEESLSDSRTQFQAIVNMAQTLQKTRSLYAESSYDTLITRCTLHGSKLLKKQDQCRAVYTCSHLWWATEISLLGEEEGVTDNFFREGKRVLECLQRSLRVADSIMDNVQSCQLMVEILNRCCYYFVHGDENSTHVGTKYINGLIELIKTNLKSLKMEANQGEDSGERFFIGTDGSYIHQSPVNSVSAVYNKPPTSKGNNLASVPIEFFQRTLQYIEDQKDVDERFKAISVGSTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.24
4	0.32
5	0.37
6	0.43
7	0.44
8	0.44
9	0.45
10	0.5
11	0.52
12	0.44
13	0.37
14	0.31
15	0.29
16	0.34
17	0.34
18	0.34
19	0.34
20	0.37
21	0.33
22	0.31
23	0.28
24	0.21
25	0.2
26	0.18
27	0.18
28	0.16
29	0.21
30	0.21
31	0.23
32	0.23
33	0.23
34	0.28
35	0.35
36	0.38
37	0.36
38	0.38
39	0.42
40	0.44
41	0.45
42	0.41
43	0.33
44	0.29
45	0.26
46	0.23
47	0.18
48	0.15
49	0.13
50	0.1
51	0.08
52	0.07
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.07
57	0.08
58	0.09
59	0.1
60	0.2
61	0.21
62	0.28
63	0.34
64	0.41
65	0.45
66	0.5
67	0.55
68	0.52
69	0.54
70	0.53
71	0.51
72	0.46
73	0.41
74	0.35
75	0.29
76	0.23
77	0.19
78	0.15
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.11
87	0.09
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.08
99	0.11
100	0.17
101	0.18
102	0.2
103	0.2
104	0.23
105	0.22
106	0.24
107	0.23
108	0.18
109	0.17
110	0.18
111	0.18
112	0.16
113	0.16
114	0.14
115	0.16
116	0.16
117	0.2
118	0.22
119	0.25
120	0.27
121	0.3
122	0.33
123	0.29
124	0.32
125	0.28
126	0.27
127	0.26
128	0.25
129	0.27
130	0.31
131	0.36
132	0.4
133	0.44
134	0.47
135	0.47
136	0.48
137	0.47
138	0.42
139	0.41
140	0.41
141	0.41
142	0.45
143	0.43
144	0.42
145	0.4
146	0.36
147	0.32
148	0.27
149	0.23
150	0.15
151	0.15
152	0.17
153	0.16
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.14
158	0.12
159	0.12
160	0.08
161	0.12
162	0.11
163	0.13
164	0.13
165	0.16
166	0.2
167	0.26
168	0.29
169	0.32
170	0.37
171	0.43
172	0.48
173	0.52
174	0.52
175	0.54
176	0.55
177	0.58
178	0.61
179	0.63
180	0.68
181	0.7
182	0.75
183	0.74
184	0.75
185	0.75
186	0.73
187	0.65
188	0.63
189	0.56
190	0.48
191	0.46
192	0.42
193	0.34
194	0.28
195	0.25
196	0.17
197	0.16
198	0.16
199	0.1
200	0.11
201	0.09
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.13
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.14
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.12
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.07
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.12
262	0.16
263	0.17
264	0.16
265	0.15
266	0.16
267	0.15
268	0.15
269	0.12
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.11
281	0.13
282	0.14
283	0.18
284	0.19
285	0.19
286	0.2
287	0.22
288	0.2
289	0.21
290	0.23
291	0.2
292	0.21
293	0.2
294	0.18
295	0.16
296	0.17
297	0.13
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.14
302	0.14
303	0.15
304	0.13
305	0.13
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.1
313	0.12
314	0.13
315	0.17
316	0.19
317	0.2
318	0.23
319	0.25
320	0.28
321	0.26
322	0.25
323	0.22
324	0.2
325	0.18
326	0.15
327	0.13
328	0.1
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.07
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.16
342	0.2
343	0.2
344	0.21
345	0.22
346	0.21
347	0.25
348	0.27
349	0.24
350	0.21
351	0.18
352	0.17
353	0.17
354	0.14
355	0.11
356	0.08
357	0.07
358	0.06
359	0.08
360	0.14
361	0.14
362	0.16
363	0.18
364	0.21
365	0.22
366	0.24
367	0.27
368	0.23
369	0.24
370	0.23
371	0.22
372	0.19
373	0.19
374	0.17
375	0.14
376	0.12
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.15
394	0.14
395	0.15
396	0.2
397	0.24
398	0.28
399	0.3
400	0.29
401	0.27
402	0.31
403	0.31
404	0.28
405	0.27
406	0.26
407	0.31
408	0.35
409	0.4
410	0.43
411	0.43
412	0.46
413	0.5
414	0.52
415	0.45
416	0.42
417	0.38
418	0.31
419	0.31
420	0.31
421	0.22
422	0.17
423	0.17
424	0.16
425	0.14
426	0.13
427	0.12
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.14
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.12
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.04
451	0.04
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.11
480	0.12
481	0.15
482	0.16
483	0.16
484	0.16
485	0.14
486	0.14
487	0.13
488	0.15
489	0.17
490	0.2
491	0.2
492	0.21
493	0.26
494	0.27
495	0.28
496	0.28
497	0.25
498	0.25
499	0.26
500	0.24
501	0.25
502	0.22
503	0.24
504	0.22
505	0.19
506	0.16
507	0.17
508	0.17
509	0.13
510	0.14
511	0.16
512	0.2
513	0.27
514	0.36
515	0.36
516	0.39
517	0.39
518	0.39
519	0.38
520	0.34
521	0.3
522	0.22
523	0.2
524	0.18
525	0.2
526	0.19
527	0.16
528	0.17
529	0.17
530	0.21
531	0.23
532	0.3
533	0.35
534	0.37
535	0.38
536	0.43
537	0.51
538	0.55
539	0.62
540	0.64
541	0.66
542	0.72
543	0.8
544	0.82
545	0.83
546	0.82
547	0.81
548	0.77
549	0.78
550	0.8
551	0.76
552	0.74
553	0.71
554	0.65
555	0.57
556	0.52
557	0.43
558	0.37
559	0.36
560	0.3
561	0.28
562	0.27
563	0.3
564	0.3
565	0.31
566	0.29
567	0.25
568	0.26
569	0.22
570	0.21
571	0.16
572	0.15
573	0.12
574	0.12
575	0.11
576	0.08
577	0.07
578	0.09
579	0.09
580	0.1
581	0.11
582	0.1
583	0.13
584	0.12
585	0.12
586	0.11
587	0.11
588	0.12
589	0.13
590	0.12
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.08
596	0.05
597	0.04
598	0.04
599	0.05
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.09
613	0.11
614	0.11
615	0.13
616	0.13
617	0.11
618	0.13
619	0.14
620	0.14
621	0.13
622	0.13
623	0.16
624	0.16
625	0.18
626	0.16
627	0.16
628	0.15
629	0.16
630	0.16
631	0.15
632	0.15
633	0.17
634	0.18
635	0.19
636	0.22
637	0.24
638	0.24
639	0.23
640	0.24
641	0.21
642	0.21
643	0.2
644	0.18
645	0.14
646	0.14
647	0.12
648	0.11
649	0.1
650	0.09
651	0.14
652	0.15
653	0.16
654	0.23
655	0.27
656	0.34
657	0.42
658	0.5
659	0.52
660	0.56
661	0.63
662	0.66
663	0.68
664	0.63
665	0.6
666	0.56
667	0.52
668	0.5
669	0.47
670	0.4
671	0.33
672	0.34
673	0.28
674	0.24
675	0.24
676	0.22
677	0.17
678	0.14
679	0.13
680	0.11
681	0.12
682	0.11
683	0.09
684	0.07
685	0.07
686	0.06
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.14
697	0.17
698	0.2
699	0.23
700	0.25
701	0.33
702	0.35
703	0.4
704	0.42
705	0.41
706	0.39
707	0.39
708	0.37
709	0.3
710	0.29
711	0.23
712	0.19
713	0.19
714	0.18
715	0.17
716	0.16
717	0.14
718	0.16
719	0.14
720	0.11
721	0.09
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.14
726	0.19
727	0.21
728	0.25
729	0.25
730	0.25
731	0.26
732	0.26
733	0.25
734	0.24
735	0.26
736	0.29
737	0.29
738	0.32
739	0.32
740	0.34
741	0.3
742	0.25
743	0.22
744	0.14
745	0.15
746	0.13
747	0.14
748	0.16
749	0.16
750	0.16
751	0.16
752	0.17
753	0.16
754	0.19
755	0.18
756	0.16
757	0.17
758	0.17
759	0.2
760	0.22
761	0.23
762	0.22
763	0.24
764	0.32
765	0.32
766	0.39
767	0.38
768	0.4
769	0.39
770	0.37
771	0.35
772	0.26
773	0.24
774	0.19
775	0.16
776	0.11
777	0.1
778	0.1
779	0.09
780	0.09
781	0.08
782	0.08
783	0.09
784	0.1
785	0.13
786	0.13
787	0.15
788	0.16
789	0.16
790	0.18
791	0.2
792	0.21
793	0.18
794	0.18
795	0.21
796	0.23
797	0.26
798	0.27
799	0.31
800	0.31
801	0.33
802	0.36
803	0.39
804	0.42
805	0.48
806	0.53
807	0.54
808	0.58
809	0.56
810	0.55
811	0.5
812	0.43
813	0.37
814	0.29
815	0.24
816	0.19
817	0.19
818	0.19
819	0.2
820	0.2
821	0.2
822	0.21
823	0.24
824	0.3
825	0.33
826	0.33
827	0.3
828	0.3
829	0.34
830	0.34
831	0.33
832	0.28
833	0.27
834	0.25
835	0.26
836	0.26
837	0.19

C5DKJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer