Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJX2

Protein Details
Accession C5DJX2    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-76LMQQRLRQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
546-573KRTGDEEKGKTKKQRKTVKKAAPTTAAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
552-585EKGKTKKQRKTVKKAAPTTAAGEAPKKKKPTKKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG lth:KLTH0F19800g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MNEAGLGIAVNSAGSTGTSAAPDTPLGAFTQGPRSVSHPHQMPQTPAAMAAQRERLLMQQRLRQQQQQQQQQQQQQAMQNYENQFYQFLMTVNKRPKRLYNFAEDSDAVISKYEQFRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQQQRTPQATSDGLILNKNNETLKEFLEYVARGRIPEAIMEVLKDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVKHTQKKSADNNVGPNATPHVQSGAGQGPAAANTASPTPSGTPQTSQTSGTETGAASSDAAKHSEDKKDTKEVVATFKRPRVYRTLLRPNGLTHYYDMLSYADHTRFSDNIYQQLEAEILTLTKRNLKLDVPLNPFEHHDKLDESMFCSPEVGPRGDRIEHVHRDTSKKRGTKGQVGHIELHEESPQHSSSYEQMMLIMSERTTTTTMSTIAASLAKNAADLTNSSLKSGGGKGSSNVTGTPGRSNGSSSVAAAAVAAAAAVGSSSNDNNQFSRLKFVEQWRINKEKRKQQALNANIAPTTAYNQRISMAAPLTAQQIKQQQLLQQQQQQSGDQQRVSNKRTGDEEKGKTKKQRKTVKKAAPTTAAGEAPKKKKPTKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.05
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.13
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.24
21 0.27
22 0.33
23 0.36
24 0.42
25 0.39
26 0.4
27 0.48
28 0.5
29 0.51
30 0.47
31 0.45
32 0.37
33 0.32
34 0.31
35 0.26
36 0.24
37 0.24
38 0.26
39 0.24
40 0.24
41 0.25
42 0.28
43 0.33
44 0.38
45 0.4
46 0.42
47 0.5
48 0.59
49 0.63
50 0.65
51 0.66
52 0.68
53 0.72
54 0.76
55 0.77
56 0.77
57 0.8
58 0.8
59 0.77
60 0.73
61 0.68
62 0.63
63 0.59
64 0.53
65 0.46
66 0.45
67 0.41
68 0.39
69 0.34
70 0.29
71 0.24
72 0.2
73 0.2
74 0.15
75 0.13
76 0.18
77 0.21
78 0.28
79 0.38
80 0.43
81 0.46
82 0.49
83 0.57
84 0.59
85 0.64
86 0.62
87 0.62
88 0.62
89 0.6
90 0.6
91 0.51
92 0.43
93 0.35
94 0.31
95 0.2
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.19
100 0.22
101 0.25
102 0.26
103 0.29
104 0.33
105 0.36
106 0.34
107 0.32
108 0.29
109 0.25
110 0.33
111 0.35
112 0.33
113 0.33
114 0.31
115 0.3
116 0.28
117 0.28
118 0.21
119 0.21
120 0.22
121 0.27
122 0.35
123 0.37
124 0.42
125 0.49
126 0.53
127 0.56
128 0.56
129 0.58
130 0.59
131 0.6
132 0.57
133 0.5
134 0.47
135 0.41
136 0.36
137 0.29
138 0.23
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.21
195 0.29
196 0.31
197 0.34
198 0.38
199 0.44
200 0.47
201 0.54
202 0.56
203 0.5
204 0.54
205 0.52
206 0.49
207 0.42
208 0.35
209 0.28
210 0.21
211 0.19
212 0.14
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.07
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.17
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.19
241 0.2
242 0.2
243 0.19
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.11
256 0.14
257 0.19
258 0.23
259 0.25
260 0.28
261 0.32
262 0.33
263 0.3
264 0.31
265 0.27
266 0.31
267 0.32
268 0.33
269 0.31
270 0.34
271 0.38
272 0.35
273 0.36
274 0.35
275 0.38
276 0.39
277 0.45
278 0.52
279 0.51
280 0.52
281 0.5
282 0.44
283 0.41
284 0.36
285 0.27
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.1
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.18
302 0.16
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.19
307 0.2
308 0.17
309 0.11
310 0.11
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.15
320 0.16
321 0.21
322 0.25
323 0.33
324 0.33
325 0.35
326 0.36
327 0.35
328 0.36
329 0.34
330 0.31
331 0.23
332 0.19
333 0.16
334 0.17
335 0.19
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.16
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.22
352 0.27
353 0.3
354 0.32
355 0.35
356 0.35
357 0.42
358 0.44
359 0.47
360 0.47
361 0.46
362 0.47
363 0.51
364 0.54
365 0.56
366 0.58
367 0.58
368 0.58
369 0.56
370 0.55
371 0.46
372 0.42
373 0.33
374 0.29
375 0.21
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.17
385 0.16
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.11
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.07
414 0.08
415 0.12
416 0.17
417 0.17
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.19
422 0.2
423 0.18
424 0.13
425 0.14
426 0.15
427 0.18
428 0.19
429 0.18
430 0.16
431 0.17
432 0.17
433 0.18
434 0.2
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.19
439 0.18
440 0.19
441 0.18
442 0.16
443 0.16
444 0.14
445 0.14
446 0.12
447 0.1
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.04
458 0.05
459 0.09
460 0.12
461 0.14
462 0.15
463 0.19
464 0.22
465 0.22
466 0.29
467 0.27
468 0.28
469 0.33
470 0.4
471 0.46
472 0.49
473 0.57
474 0.57
475 0.65
476 0.68
477 0.71
478 0.73
479 0.72
480 0.75
481 0.78
482 0.76
483 0.76
484 0.8
485 0.75
486 0.75
487 0.68
488 0.59
489 0.48
490 0.43
491 0.34
492 0.24
493 0.22
494 0.18
495 0.19
496 0.19
497 0.2
498 0.21
499 0.21
500 0.21
501 0.22
502 0.18
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.19
507 0.21
508 0.2
509 0.21
510 0.27
511 0.29
512 0.33
513 0.34
514 0.35
515 0.42
516 0.51
517 0.53
518 0.53
519 0.55
520 0.57
521 0.56
522 0.52
523 0.51
524 0.49
525 0.47
526 0.43
527 0.42
528 0.46
529 0.53
530 0.55
531 0.53
532 0.48
533 0.46
534 0.51
535 0.53
536 0.54
537 0.55
538 0.58
539 0.64
540 0.7
541 0.74
542 0.77
543 0.8
544 0.79
545 0.79
546 0.82
547 0.83
548 0.86
549 0.89
550 0.89
551 0.9
552 0.9
553 0.87
554 0.83
555 0.74
556 0.67
557 0.6
558 0.53
559 0.44
560 0.44
561 0.45
562 0.46
563 0.51
564 0.56
565 0.61