Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DIP7

Protein Details
Accession C5DIP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-205NRTMNFCLKYKRKNEFKRLAEMLHydrophilic
830-849AERMRKEREERARINKEKDEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6.5, cyto_mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027512  EIF3A  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG lth:KLTH0E14168g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MAPPVLRPENALKRAEELISVGEPLAALQSLYAYLSSRRTRWAQPGALEPIVFKFLELGVDLKKGKIIKDGLHQYKKNMQISPEGLSSVGVVSRKFIDTIEVKMASEQAKADEQEQDADDDLEGGVTPENLLISASEEEQSVAGFNDEAITSWLRFTWESYRAVLDLLRNNSQLEVTYSGVVNRTMNFCLKYKRKNEFKRLAEMLRQHLDAANYQQKYNNYTVNLADPDTLQRYLDQRFQQVNVSVKLELWHEAFRSIEDVHHLMAMSKRPTKPSVLANYYENLAKIFFVSGNYLLNAAAWEKFFKLYLKNPNATEKDFHFYASTFMLASLSVPADDLPFVGFDPLIRLCNLLNLESKPTRTGLIEAATEETVYSKVDDEIKQLHELLGDEFDFKSIKQKLTDLLPALEAKPYFKSYTAPLRNYIVRKIFVGISEAYESIKSEDLSAFVTLPGPFELNELEIEKSLMQAAMEDYVTFTIDHETDTITFSKDPFEALTSVNTSTTEEAEGNEDEEDEAKTEGEELEAENDPEPVVTRNAAIRAHLSDLAKLLKEVEGFSDGSYMFKVKVARENLIQQSNDTIARERKAAEERAKHLEERKRAESGKYLTAEQAAELRMRRTMEEKAAADARMESEAKRRAEEKLEREKALVREKEMLKLIEEVNAKGIIHIDPKDAKKLTAEDVRRMTIEQLSKDKKELEDRMRTAFKRLDHTERAFRKVELPLLEKDAEKQETRDLENYNNMRAKLLDAAKKEHAEHLKLHERLSKMGDDFKKFKAGMMSEKEAQYQKQLAESAAKLEAAKNARIEEVRKQRYEQLVAERKAEIEAEQEAERMRKEREERARINKEKDELYLRQREREEAIERKMTSQKAAPAPAPAPAAPPAGKVSFAEAMRLRRQGVEVPSAAPARSAARSTPAAPAPEPVRAAPVQTPTPAPAPAPAAPAPAAAAPAAAAPAQEMTFAERMRLKRMNRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.34
4 0.25
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.15
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.11
22 0.19
23 0.24
24 0.25
25 0.32
26 0.37
27 0.43
28 0.51
29 0.57
30 0.55
31 0.53
32 0.59
33 0.59
34 0.55
35 0.48
36 0.39
37 0.32
38 0.3
39 0.25
40 0.18
41 0.13
42 0.11
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.28
54 0.31
55 0.3
56 0.4
57 0.5
58 0.57
59 0.64
60 0.65
61 0.64
62 0.67
63 0.71
64 0.67
65 0.6
66 0.52
67 0.5
68 0.51
69 0.49
70 0.42
71 0.34
72 0.28
73 0.24
74 0.22
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.19
85 0.19
86 0.23
87 0.28
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.29
92 0.23
93 0.23
94 0.19
95 0.16
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.18
105 0.18
106 0.16
107 0.12
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.15
144 0.2
145 0.23
146 0.25
147 0.26
148 0.27
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.28
156 0.27
157 0.28
158 0.27
159 0.26
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.13
171 0.15
172 0.16
173 0.19
174 0.21
175 0.23
176 0.32
177 0.39
178 0.47
179 0.53
180 0.61
181 0.69
182 0.77
183 0.84
184 0.85
185 0.81
186 0.81
187 0.77
188 0.72
189 0.67
190 0.62
191 0.58
192 0.51
193 0.46
194 0.38
195 0.34
196 0.31
197 0.26
198 0.28
199 0.29
200 0.27
201 0.27
202 0.31
203 0.31
204 0.34
205 0.36
206 0.33
207 0.27
208 0.28
209 0.28
210 0.28
211 0.27
212 0.23
213 0.2
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.18
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.21
222 0.27
223 0.27
224 0.3
225 0.32
226 0.33
227 0.35
228 0.36
229 0.38
230 0.34
231 0.33
232 0.26
233 0.24
234 0.24
235 0.21
236 0.19
237 0.16
238 0.15
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.14
253 0.19
254 0.21
255 0.27
256 0.28
257 0.32
258 0.34
259 0.36
260 0.38
261 0.41
262 0.44
263 0.42
264 0.42
265 0.4
266 0.39
267 0.36
268 0.32
269 0.24
270 0.16
271 0.12
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.15
294 0.22
295 0.32
296 0.38
297 0.41
298 0.43
299 0.5
300 0.51
301 0.49
302 0.44
303 0.36
304 0.35
305 0.31
306 0.29
307 0.22
308 0.19
309 0.18
310 0.16
311 0.14
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.14
341 0.14
342 0.19
343 0.2
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.16
349 0.17
350 0.13
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.07
364 0.11
365 0.12
366 0.13
367 0.16
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.14
383 0.16
384 0.18
385 0.19
386 0.2
387 0.22
388 0.24
389 0.28
390 0.22
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.17
395 0.16
396 0.13
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.14
403 0.16
404 0.26
405 0.32
406 0.31
407 0.32
408 0.34
409 0.38
410 0.38
411 0.39
412 0.32
413 0.26
414 0.25
415 0.24
416 0.22
417 0.18
418 0.18
419 0.13
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.05
510 0.04
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.12
530 0.15
531 0.14
532 0.12
533 0.14
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.11
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.09
552 0.11
553 0.11
554 0.18
555 0.2
556 0.22
557 0.24
558 0.29
559 0.31
560 0.34
561 0.32
562 0.25
563 0.24
564 0.24
565 0.22
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.16
570 0.17
571 0.16
572 0.19
573 0.23
574 0.29
575 0.33
576 0.35
577 0.38
578 0.44
579 0.45
580 0.43
581 0.46
582 0.46
583 0.46
584 0.47
585 0.46
586 0.44
587 0.44
588 0.44
589 0.43
590 0.39
591 0.38
592 0.33
593 0.31
594 0.26
595 0.26
596 0.24
597 0.18
598 0.16
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.13
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.18
608 0.2
609 0.24
610 0.24
611 0.24
612 0.26
613 0.25
614 0.22
615 0.19
616 0.16
617 0.13
618 0.13
619 0.11
620 0.16
621 0.23
622 0.23
623 0.25
624 0.25
625 0.26
626 0.34
627 0.41
628 0.43
629 0.47
630 0.51
631 0.5
632 0.5
633 0.52
634 0.49
635 0.51
636 0.44
637 0.35
638 0.38
639 0.38
640 0.41
641 0.39
642 0.34
643 0.26
644 0.27
645 0.25
646 0.22
647 0.22
648 0.18
649 0.17
650 0.17
651 0.16
652 0.13
653 0.14
654 0.1
655 0.12
656 0.13
657 0.15
658 0.19
659 0.21
660 0.28
661 0.27
662 0.26
663 0.26
664 0.27
665 0.3
666 0.33
667 0.34
668 0.34
669 0.36
670 0.37
671 0.35
672 0.33
673 0.29
674 0.26
675 0.27
676 0.24
677 0.3
678 0.34
679 0.35
680 0.36
681 0.37
682 0.35
683 0.39
684 0.44
685 0.44
686 0.48
687 0.49
688 0.53
689 0.58
690 0.55
691 0.52
692 0.48
693 0.43
694 0.41
695 0.44
696 0.46
697 0.46
698 0.51
699 0.55
700 0.55
701 0.58
702 0.51
703 0.46
704 0.43
705 0.39
706 0.39
707 0.33
708 0.32
709 0.29
710 0.31
711 0.32
712 0.28
713 0.27
714 0.28
715 0.27
716 0.25
717 0.24
718 0.25
719 0.28
720 0.31
721 0.32
722 0.29
723 0.28
724 0.36
725 0.36
726 0.38
727 0.38
728 0.35
729 0.31
730 0.3
731 0.28
732 0.26
733 0.31
734 0.29
735 0.28
736 0.33
737 0.37
738 0.39
739 0.38
740 0.39
741 0.38
742 0.35
743 0.36
744 0.39
745 0.44
746 0.43
747 0.44
748 0.42
749 0.38
750 0.38
751 0.39
752 0.34
753 0.27
754 0.34
755 0.37
756 0.39
757 0.41
758 0.4
759 0.44
760 0.4
761 0.4
762 0.38
763 0.35
764 0.37
765 0.4
766 0.43
767 0.4
768 0.41
769 0.43
770 0.39
771 0.37
772 0.33
773 0.3
774 0.26
775 0.25
776 0.26
777 0.23
778 0.25
779 0.24
780 0.22
781 0.19
782 0.19
783 0.16
784 0.16
785 0.21
786 0.2
787 0.22
788 0.22
789 0.22
790 0.24
791 0.26
792 0.28
793 0.32
794 0.4
795 0.45
796 0.46
797 0.48
798 0.52
799 0.56
800 0.58
801 0.53
802 0.53
803 0.55
804 0.54
805 0.53
806 0.46
807 0.4
808 0.36
809 0.32
810 0.21
811 0.14
812 0.13
813 0.14
814 0.14
815 0.14
816 0.15
817 0.17
818 0.18
819 0.19
820 0.2
821 0.25
822 0.3
823 0.39
824 0.48
825 0.56
826 0.63
827 0.71
828 0.8
829 0.8
830 0.82
831 0.78
832 0.71
833 0.63
834 0.59
835 0.55
836 0.51
837 0.52
838 0.54
839 0.51
840 0.54
841 0.53
842 0.52
843 0.48
844 0.48
845 0.47
846 0.44
847 0.48
848 0.48
849 0.47
850 0.49
851 0.51
852 0.46
853 0.42
854 0.4
855 0.42
856 0.41
857 0.44
858 0.4
859 0.39
860 0.38
861 0.38
862 0.36
863 0.28
864 0.25
865 0.23
866 0.26
867 0.21
868 0.23
869 0.23
870 0.21
871 0.22
872 0.19
873 0.22
874 0.23
875 0.23
876 0.27
877 0.28
878 0.33
879 0.38
880 0.4
881 0.37
882 0.33
883 0.36
884 0.36
885 0.36
886 0.36
887 0.32
888 0.3
889 0.33
890 0.33
891 0.31
892 0.24
893 0.21
894 0.18
895 0.2
896 0.21
897 0.17
898 0.21
899 0.25
900 0.26
901 0.31
902 0.32
903 0.32
904 0.31
905 0.35
906 0.33
907 0.34
908 0.34
909 0.28
910 0.29
911 0.26
912 0.29
913 0.27
914 0.3
915 0.28
916 0.29
917 0.3
918 0.28
919 0.3
920 0.28
921 0.25
922 0.22
923 0.25
924 0.24
925 0.27
926 0.25
927 0.25
928 0.24
929 0.24
930 0.22
931 0.17
932 0.16
933 0.11
934 0.1
935 0.07
936 0.07
937 0.08
938 0.07
939 0.06
940 0.06
941 0.08
942 0.08
943 0.08
944 0.09
945 0.12
946 0.17
947 0.17
948 0.21
949 0.25
950 0.27
951 0.35
952 0.43