FuNGI

C5DCJ6

Protein Details

Accession

C5DCJ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-44	QLRRDFLRSRLKKNGTPRPYVKKEDP	Hydrophilic
257-276	DGGGRFRRGNTKRKTRQLKL	Basic
516-542	QENGKSSRKGSPKKKSSRGSPSGPRIY	Hydrophilic
623-642	IKELKEKVAKHPSNKDRMKY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
268-269	KR
520-536	KSSRKGSPKKKSSRGSP

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	lth:KLTH0B03586g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPNPLKSSNSASPFIKREQLRRDFLRSRLKKNGTPRPYVKKEDPEAYDERTRQLLSGGQSHSGIKREEGSQYNEFPLRAVSHEQLENIRTHILKFQSKKKVDPQRDMHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKMKADSERNGGEQSQAGSSATNLQSDSNVASSAAQTPVETPGDTPADTPVKQESVKEEHGSSSMAIKKEGADLPATKLEEAGVAEDPTKVGMVKYDGKEKPLETESKEDPFADVAPDGGGRFRRGNTKRKTRQLKLLDENAKRLRFEEFYPWVLEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVENDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMEKNGKGIPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTQRKLRAVDARQGEEDDRNDNSEVELDFDEEFADDEEAPIIDGDEKENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDDEEADDDLFGEKKIDDEGERVMKALQKSDMAALYESDDESKSNPYLSESEGENTEEAKAKDENQENGKSSRKGSPKKKSSRGSPSGPRIYVKSIKDFQLVLRADKSVLRNFPEGNWNPHAKDEKSRTPGAASSPSSPPIKIEDDIENPDLLTERDIIDVVTGRQMTLKQLIKELKEKVAKHPSNKDRMKYLVKRLVRLNNGYLELNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.48
4	0.52
5	0.58
6	0.64
7	0.66
8	0.68
9	0.73
10	0.71
11	0.74
12	0.77
13	0.74
14	0.74
15	0.76
16	0.77
17	0.74
18	0.78
19	0.8
20	0.77
21	0.79
22	0.79
23	0.79
24	0.8
25	0.82
26	0.79
27	0.78
28	0.77
29	0.75
30	0.7
31	0.65
32	0.61
33	0.59
34	0.58
35	0.5
36	0.46
37	0.41
38	0.38
39	0.31
40	0.29
41	0.27
42	0.23
43	0.29
44	0.28
45	0.26
46	0.27
47	0.3
48	0.31
49	0.31
50	0.28
51	0.23
52	0.24
53	0.25
54	0.3
55	0.32
56	0.36
57	0.36
58	0.38
59	0.41
60	0.4
61	0.37
62	0.31
63	0.29
64	0.23
65	0.22
66	0.24
67	0.22
68	0.24
69	0.25
70	0.27
71	0.28
72	0.29
73	0.26
74	0.23
75	0.24
76	0.2
77	0.2
78	0.24
79	0.27
80	0.33
81	0.39
82	0.47
83	0.55
84	0.58
85	0.64
86	0.68
87	0.73
88	0.73
89	0.77
90	0.74
91	0.73
92	0.76
93	0.75
94	0.69
95	0.65
96	0.58
97	0.55
98	0.59
99	0.52
100	0.51
101	0.53
102	0.55
103	0.57
104	0.66
105	0.69
106	0.67
107	0.67
108	0.68
109	0.63
110	0.58
111	0.56
112	0.47
113	0.38
114	0.29
115	0.32
116	0.3
117	0.34
118	0.38
119	0.33
120	0.32
121	0.31
122	0.35
123	0.33
124	0.33
125	0.34
126	0.3
127	0.31
128	0.35
129	0.35
130	0.33
131	0.34
132	0.33
133	0.32
134	0.33
135	0.32
136	0.29
137	0.28
138	0.28
139	0.25
140	0.22
141	0.15
142	0.13
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.15
147	0.14
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.15
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.11
168	0.14
169	0.15
170	0.15
171	0.15
172	0.16
173	0.19
174	0.19
175	0.2
176	0.19
177	0.2
178	0.21
179	0.22
180	0.22
181	0.25
182	0.28
183	0.29
184	0.27
185	0.25
186	0.25
187	0.24
188	0.2
189	0.19
190	0.2
191	0.18
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.2
196	0.21
197	0.17
198	0.15
199	0.15
200	0.18
201	0.21
202	0.21
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.09
220	0.16
221	0.18
222	0.27
223	0.27
224	0.29
225	0.31
226	0.3
227	0.31
228	0.28
229	0.3
230	0.23
231	0.28
232	0.29
233	0.29
234	0.29
235	0.25
236	0.21
237	0.19
238	0.17
239	0.12
240	0.09
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.11
249	0.13
250	0.23
251	0.29
252	0.39
253	0.47
254	0.57
255	0.64
256	0.72
257	0.81
258	0.76
259	0.8
260	0.78
261	0.77
262	0.72
263	0.72
264	0.71
265	0.63
266	0.65
267	0.6
268	0.53
269	0.44
270	0.39
271	0.32
272	0.25
273	0.26
274	0.26
275	0.24
276	0.24
277	0.24
278	0.24
279	0.21
280	0.2
281	0.17
282	0.11
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.08
319	0.08
320	0.1
321	0.12
322	0.15
323	0.19
324	0.26
325	0.35
326	0.37
327	0.39
328	0.38
329	0.38
330	0.36
331	0.34
332	0.28
333	0.2
334	0.16
335	0.18
336	0.17
337	0.16
338	0.14
339	0.14
340	0.12
341	0.15
342	0.19
343	0.16
344	0.22
345	0.27
346	0.32
347	0.31
348	0.34
349	0.35
350	0.37
351	0.38
352	0.36
353	0.35
354	0.3
355	0.33
356	0.32
357	0.27
358	0.21
359	0.2
360	0.19
361	0.15
362	0.15
363	0.11
364	0.11
365	0.12
366	0.13
367	0.2
368	0.26
369	0.34
370	0.43
371	0.49
372	0.55
373	0.57
374	0.61
375	0.63
376	0.58
377	0.57
378	0.51
379	0.47
380	0.4
381	0.38
382	0.33
383	0.26
384	0.24
385	0.19
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.11
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.07
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.15
417	0.15
418	0.18
419	0.23
420	0.3
421	0.35
422	0.37
423	0.4
424	0.42
425	0.45
426	0.5
427	0.5
428	0.44
429	0.37
430	0.34
431	0.32
432	0.32
433	0.28
434	0.19
435	0.14
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.09
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.1
456	0.14
457	0.17
458	0.17
459	0.17
460	0.17
461	0.2
462	0.2
463	0.21
464	0.18
465	0.16
466	0.16
467	0.18
468	0.18
469	0.16
470	0.15
471	0.13
472	0.12
473	0.12
474	0.11
475	0.11
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.12
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.13
484	0.15
485	0.16
486	0.18
487	0.16
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.16
492	0.15
493	0.14
494	0.16
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.18
499	0.26
500	0.3
501	0.34
502	0.36
503	0.41
504	0.41
505	0.44
506	0.48
507	0.42
508	0.41
509	0.44
510	0.48
511	0.53
512	0.6
513	0.67
514	0.72
515	0.8
516	0.87
517	0.87
518	0.87
519	0.88
520	0.85
521	0.82
522	0.81
523	0.81
524	0.78
525	0.72
526	0.64
527	0.56
528	0.56
529	0.54
530	0.48
531	0.46
532	0.43
533	0.44
534	0.45
535	0.42
536	0.36
537	0.38
538	0.36
539	0.31
540	0.28
541	0.26
542	0.25
543	0.28
544	0.32
545	0.29
546	0.32
547	0.33
548	0.34
549	0.35
550	0.37
551	0.43
552	0.42
553	0.42
554	0.43
555	0.43
556	0.41
557	0.47
558	0.5
559	0.42
560	0.48
561	0.5
562	0.53
563	0.55
564	0.57
565	0.52
566	0.48
567	0.48
568	0.44
569	0.43
570	0.36
571	0.34
572	0.35
573	0.38
574	0.37
575	0.34
576	0.31
577	0.28
578	0.29
579	0.26
580	0.27
581	0.28
582	0.3
583	0.35
584	0.35
585	0.3
586	0.26
587	0.25
588	0.22
589	0.17
590	0.14
591	0.11
592	0.1
593	0.11
594	0.11
595	0.1
596	0.11
597	0.13
598	0.12
599	0.15
600	0.15
601	0.14
602	0.16
603	0.17
604	0.2
605	0.26
606	0.31
607	0.28
608	0.36
609	0.42
610	0.44
611	0.51
612	0.51
613	0.52
614	0.54
615	0.54
616	0.57
617	0.62
618	0.64
619	0.66
620	0.73
621	0.73
622	0.76
623	0.82
624	0.78
625	0.73
626	0.74
627	0.76
628	0.74
629	0.75
630	0.74
631	0.72
632	0.72
633	0.74
634	0.75
635	0.72
636	0.69
637	0.64
638	0.59
639	0.57

C5DCJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer