Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBF6

Protein Details
Accession C5DBF6    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-87EGDRSESKTKKAKRDDLPEKRKRKKKDKPFDFSKYDTRBasic
422-443ESVNQKFREKKAAKKRNRMTTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-77RSESKTKKAKRDDLPEKRKRKKKDK
429-438REKKAAKKRN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG lth:KLTH0A02222g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MSLISKLLRFGRNASKSLPEQCEYAKWSKEDLVRKVMELEAENKRKAEDEGDRSESKTKKAKRDDLPEKRKRKKKDKPFDFSKYDTRFVAFKFAYLGWNYNGLAIQKEPTPLPTVEGTILEAMNACKLVPSMVPQDYNFSRCGRTDKGVSAMNQVISLHVRSNLTREEQQDEENDGREIDYIHILNQLLPDDIRISAVCLRPPTNFDARFSCQYRHYRYLFHKDGLDIKKMEEAARMYEGEHDFRNFCKLDGSKQINNYKRNIERSRIISLSEDIYCLDLIGSAFLWHQVRCMMANLFLIGQGLEDTTLLKDLMDVARVKQKPIYDMASDIPLILFDCKFPEMEWKTVDSNNFKSLQSDRRVYALSLDYNLKSTVANIFRETLCVTTSEIQGRTRINLGDGKGKVVAVYQKMLERGVMESVESVNQKFREKKAAKKRNRMTTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.49
4 0.56
5 0.55
6 0.46
7 0.43
8 0.43
9 0.45
10 0.44
11 0.45
12 0.42
13 0.37
14 0.39
15 0.43
16 0.48
17 0.51
18 0.51
19 0.53
20 0.49
21 0.48
22 0.47
23 0.42
24 0.37
25 0.31
26 0.32
27 0.33
28 0.39
29 0.4
30 0.38
31 0.37
32 0.36
33 0.35
34 0.36
35 0.34
36 0.36
37 0.41
38 0.47
39 0.47
40 0.48
41 0.54
42 0.49
43 0.48
44 0.49
45 0.51
46 0.55
47 0.64
48 0.71
49 0.73
50 0.81
51 0.85
52 0.87
53 0.9
54 0.9
55 0.91
56 0.92
57 0.91
58 0.91
59 0.91
60 0.91
61 0.91
62 0.92
63 0.92
64 0.92
65 0.93
66 0.91
67 0.86
68 0.8
69 0.79
70 0.73
71 0.65
72 0.55
73 0.47
74 0.41
75 0.35
76 0.38
77 0.28
78 0.23
79 0.23
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.25
84 0.17
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.18
98 0.16
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.12
106 0.12
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.1
118 0.14
119 0.16
120 0.19
121 0.18
122 0.24
123 0.25
124 0.27
125 0.25
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.26
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.27
134 0.29
135 0.31
136 0.3
137 0.29
138 0.27
139 0.24
140 0.21
141 0.19
142 0.16
143 0.14
144 0.14
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.21
153 0.22
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.24
158 0.25
159 0.23
160 0.2
161 0.18
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.19
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.28
195 0.3
196 0.35
197 0.35
198 0.33
199 0.32
200 0.38
201 0.42
202 0.44
203 0.42
204 0.43
205 0.46
206 0.54
207 0.5
208 0.45
209 0.39
210 0.33
211 0.4
212 0.36
213 0.34
214 0.25
215 0.22
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.16
220 0.14
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.11
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.18
233 0.14
234 0.13
235 0.17
236 0.17
237 0.2
238 0.29
239 0.34
240 0.33
241 0.4
242 0.49
243 0.5
244 0.53
245 0.52
246 0.51
247 0.5
248 0.56
249 0.53
250 0.49
251 0.47
252 0.48
253 0.49
254 0.42
255 0.38
256 0.3
257 0.27
258 0.24
259 0.19
260 0.16
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.06
288 0.06
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.08
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.21
305 0.22
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.25
310 0.28
311 0.3
312 0.22
313 0.24
314 0.24
315 0.23
316 0.21
317 0.18
318 0.14
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.2
329 0.22
330 0.25
331 0.27
332 0.28
333 0.3
334 0.33
335 0.38
336 0.33
337 0.33
338 0.34
339 0.35
340 0.32
341 0.32
342 0.35
343 0.38
344 0.39
345 0.4
346 0.37
347 0.38
348 0.39
349 0.36
350 0.35
351 0.31
352 0.25
353 0.24
354 0.26
355 0.23
356 0.24
357 0.24
358 0.19
359 0.15
360 0.15
361 0.2
362 0.2
363 0.22
364 0.22
365 0.25
366 0.25
367 0.27
368 0.27
369 0.2
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.2
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.3
379 0.3
380 0.3
381 0.3
382 0.27
383 0.25
384 0.27
385 0.28
386 0.32
387 0.31
388 0.31
389 0.29
390 0.28
391 0.24
392 0.23
393 0.27
394 0.21
395 0.24
396 0.24
397 0.26
398 0.28
399 0.28
400 0.25
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.16
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.21
412 0.24
413 0.32
414 0.37
415 0.41
416 0.48
417 0.52
418 0.61
419 0.67
420 0.75
421 0.78
422 0.83
423 0.88