Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBC4

Protein Details
Accession C5DBC4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-490SIHSKSSSDDHRKRKAKVRRRIGLDRPNEVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-480RKRKAKVRRR
Subcellular Location(s) plas 19, mito 3, E.R. 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014844  PalH  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG lth:KLTH0A01386g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08733  PalH  
Amino Acid Sequences MVKKTSWRYSQVPKEYQSCGGIDLGNGVLIWKNKWQPVAYFDSVRFTSYCDEGNPVYSSLKRNRLSFPYSKALQRDWHTFITSGNDRGPFKYSIYAIIMSFTTNFVITLFLTVIVFITIRQKPHRGASNLLKLGSTLASVNLAIFISKALKVLHQDHIYKGVVSTERVLDLLWMDLTFTCLDLLVVLICQLCQVQIIMRLFSRVKEKRTVFLVGVTLSIISQVLWAIPTLAQSINDNFSGLSYDADGLTLLSPFVYLFRIALAASYACIICFNMFNKRHLCFLYQRMMILTLLALIIVLLQPGFFVADVANIWVDDLSEIFNTTCYVGSAVIVWEWVDHILILERKVQAQSVLGRPVYEDDQEDYHFAKYALKVQDAISRDSETGEIGSRNDTANSGTEEQRVRWQYGDDTPPRDTNKVEFNEPQPLKNVILEKCSRIWDGMIYYTDHFIVKGLVIKTLSIHSKSSSDDHRKRKAKVRRRIGLDRPNEVYVYATRDVVFDSDEDEAESNQGSSVDEERDFP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.66
3 0.63
4 0.55
5 0.45
6 0.36
7 0.31
8 0.25
9 0.2
10 0.18
11 0.14
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.12
17 0.14
18 0.19
19 0.25
20 0.28
21 0.33
22 0.35
23 0.35
24 0.39
25 0.46
26 0.43
27 0.41
28 0.39
29 0.4
30 0.38
31 0.37
32 0.31
33 0.25
34 0.24
35 0.21
36 0.22
37 0.17
38 0.21
39 0.2
40 0.23
41 0.22
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.3
46 0.35
47 0.43
48 0.44
49 0.46
50 0.51
51 0.55
52 0.59
53 0.58
54 0.57
55 0.55
56 0.55
57 0.56
58 0.54
59 0.51
60 0.51
61 0.5
62 0.5
63 0.47
64 0.46
65 0.43
66 0.39
67 0.37
68 0.37
69 0.35
70 0.3
71 0.29
72 0.31
73 0.3
74 0.32
75 0.34
76 0.28
77 0.27
78 0.28
79 0.25
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.15
87 0.15
88 0.12
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.13
105 0.15
106 0.19
107 0.23
108 0.28
109 0.31
110 0.38
111 0.46
112 0.42
113 0.47
114 0.52
115 0.58
116 0.55
117 0.52
118 0.45
119 0.36
120 0.34
121 0.27
122 0.19
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.08
137 0.1
138 0.15
139 0.19
140 0.25
141 0.29
142 0.3
143 0.29
144 0.34
145 0.32
146 0.28
147 0.24
148 0.21
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.26
190 0.25
191 0.28
192 0.36
193 0.37
194 0.38
195 0.41
196 0.42
197 0.32
198 0.29
199 0.27
200 0.18
201 0.17
202 0.13
203 0.1
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.06
259 0.07
260 0.16
261 0.18
262 0.21
263 0.24
264 0.25
265 0.27
266 0.27
267 0.29
268 0.24
269 0.28
270 0.31
271 0.28
272 0.27
273 0.25
274 0.25
275 0.21
276 0.17
277 0.12
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.02
283 0.03
284 0.02
285 0.02
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.03
291 0.02
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.04
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.12
336 0.14
337 0.18
338 0.18
339 0.22
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.22
344 0.21
345 0.17
346 0.15
347 0.12
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.2
358 0.22
359 0.21
360 0.22
361 0.23
362 0.28
363 0.27
364 0.28
365 0.23
366 0.22
367 0.21
368 0.2
369 0.19
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.16
383 0.17
384 0.18
385 0.22
386 0.23
387 0.24
388 0.31
389 0.32
390 0.29
391 0.27
392 0.27
393 0.27
394 0.32
395 0.39
396 0.36
397 0.37
398 0.39
399 0.44
400 0.45
401 0.43
402 0.38
403 0.33
404 0.37
405 0.37
406 0.39
407 0.37
408 0.37
409 0.46
410 0.45
411 0.43
412 0.38
413 0.37
414 0.33
415 0.33
416 0.36
417 0.27
418 0.33
419 0.34
420 0.34
421 0.34
422 0.36
423 0.33
424 0.28
425 0.27
426 0.22
427 0.22
428 0.22
429 0.21
430 0.2
431 0.2
432 0.2
433 0.2
434 0.17
435 0.15
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.15
440 0.14
441 0.16
442 0.17
443 0.17
444 0.18
445 0.22
446 0.26
447 0.22
448 0.23
449 0.23
450 0.25
451 0.27
452 0.31
453 0.37
454 0.43
455 0.5
456 0.58
457 0.67
458 0.73
459 0.78
460 0.83
461 0.84
462 0.83
463 0.85
464 0.86
465 0.85
466 0.86
467 0.88
468 0.89
469 0.87
470 0.84
471 0.8
472 0.73
473 0.66
474 0.57
475 0.47
476 0.39
477 0.31
478 0.3
479 0.24
480 0.21
481 0.19
482 0.19
483 0.2
484 0.18
485 0.17
486 0.11
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.09
499 0.11
500 0.14
501 0.16