Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNC4

Protein Details
Accession C5DNC4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-51KLTQRFAKSSRKPAKDNGKVITRNTHTKKRIVKPKRQTQSTRDEEKRNHydrophilic
713-738EKDVILAKNKFKKQNKQLGKVQLRSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-39KSSRKPAKDNGKVITRNTHTKKRIVKPKR
409-411MKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
KEGG lth:KLTH0G15840g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17946  DEADc_DDX24  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAGKLTQRFAKSSRKPAKDNGKVITRNTHTKKRIVKPKRQTQSTRDEEKRNLNVVGANELKWKSVEIPDTMDDFGGFYGLEEIDGVDVKVVNGKVQFITRNDSNIKGPEPEEPSSQGEVEPSDGQEMEELVEFKNFDDFEEGELSAASSNGEDNENYSDNELGQEESENAGEQKQEQNHEESEANASGAIMEDNAADGELETNIFGAELSIPDNVEPDLLPQWTETMNLSMTTLQGLAAQGFTKPTDIQSMTIPPALEGKDIMGKASTGSGKTLAYGIPILERLVADRTTDKTVGLIFTPTRELAHQVTQHLQKLACVIIKKSPYAIISLTGGLSIQKQERLLKYDGCARIVVATPGRFLEMLERDPKLIDRFSQTDCLVLDEVDRLLQDGHFEEFDKILKHLGKARNMKKKVKSEFAGTGWQTMVFSATFSVDLFNKLSTTSWKKVGGGKDDDEMELSLKHLMTKIHFRSKPVIIDADPDHKIHSKIKESLIECLPTERDLFAYYFLTVYPGSTLIFCNAIDSVKKLNAYLNFLQVSSFQIHSSMTQKNRLKNLEKFQQNVLANKGKGKATVLIASDVAARGLDIPGINHVVHYHLPRSADVYIHRSGRTARGDQEGVSVMICSPQEAMGPLRKLRKVLASKSATSYGKKWQKDVPVFPIEPSILSQLRERGSMANTLAEDQLATRSLSKDENWLKKAADDLGIELDSEDEEKDVILAKNKFKKQNKQLGKVQLRSLQHELKELLQNPIRKDLRKSYLTGGLTNLADDIVKNRGHSTIIGQDRLEALDLLKTKNRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.77
4 0.83
5 0.82
6 0.8
7 0.77
8 0.76
9 0.72
10 0.71
11 0.71
12 0.66
13 0.66
14 0.67
15 0.7
16 0.65
17 0.69
18 0.76
19 0.76
20 0.82
21 0.81
22 0.84
23 0.85
24 0.9
25 0.92
26 0.92
27 0.9
28 0.87
29 0.87
30 0.86
31 0.85
32 0.82
33 0.79
34 0.76
35 0.77
36 0.75
37 0.69
38 0.6
39 0.51
40 0.47
41 0.4
42 0.4
43 0.33
44 0.27
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.25
49 0.25
50 0.21
51 0.25
52 0.28
53 0.24
54 0.28
55 0.29
56 0.31
57 0.3
58 0.26
59 0.21
60 0.17
61 0.15
62 0.1
63 0.08
64 0.05
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.17
82 0.2
83 0.25
84 0.23
85 0.3
86 0.29
87 0.34
88 0.35
89 0.36
90 0.37
91 0.36
92 0.36
93 0.31
94 0.31
95 0.31
96 0.34
97 0.34
98 0.33
99 0.33
100 0.34
101 0.33
102 0.33
103 0.26
104 0.21
105 0.19
106 0.2
107 0.17
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.08
139 0.07
140 0.09
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.16
161 0.19
162 0.23
163 0.25
164 0.28
165 0.28
166 0.31
167 0.29
168 0.24
169 0.24
170 0.2
171 0.17
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.19
238 0.19
239 0.2
240 0.19
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.12
254 0.13
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.11
275 0.14
276 0.16
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.12
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.13
291 0.13
292 0.18
293 0.18
294 0.19
295 0.24
296 0.26
297 0.28
298 0.27
299 0.25
300 0.2
301 0.2
302 0.2
303 0.17
304 0.15
305 0.14
306 0.17
307 0.19
308 0.19
309 0.18
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.15
327 0.17
328 0.22
329 0.23
330 0.23
331 0.23
332 0.29
333 0.29
334 0.26
335 0.24
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.18
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.17
360 0.18
361 0.22
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.18
366 0.15
367 0.12
368 0.1
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.19
390 0.23
391 0.3
392 0.39
393 0.47
394 0.54
395 0.6
396 0.67
397 0.68
398 0.72
399 0.69
400 0.67
401 0.6
402 0.54
403 0.52
404 0.46
405 0.44
406 0.34
407 0.3
408 0.23
409 0.21
410 0.16
411 0.12
412 0.11
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.13
428 0.19
429 0.21
430 0.24
431 0.25
432 0.26
433 0.31
434 0.35
435 0.35
436 0.32
437 0.3
438 0.29
439 0.28
440 0.26
441 0.22
442 0.18
443 0.12
444 0.09
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.11
452 0.19
453 0.25
454 0.33
455 0.34
456 0.36
457 0.4
458 0.43
459 0.43
460 0.36
461 0.33
462 0.23
463 0.26
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.2
468 0.2
469 0.2
470 0.22
471 0.23
472 0.27
473 0.27
474 0.3
475 0.33
476 0.38
477 0.36
478 0.39
479 0.36
480 0.32
481 0.27
482 0.25
483 0.22
484 0.17
485 0.16
486 0.12
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.1
511 0.12
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.17
516 0.18
517 0.24
518 0.23
519 0.25
520 0.23
521 0.23
522 0.23
523 0.19
524 0.19
525 0.15
526 0.15
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.12
531 0.17
532 0.21
533 0.21
534 0.31
535 0.35
536 0.41
537 0.47
538 0.53
539 0.55
540 0.57
541 0.63
542 0.62
543 0.62
544 0.59
545 0.54
546 0.55
547 0.5
548 0.45
549 0.43
550 0.4
551 0.35
552 0.36
553 0.37
554 0.3
555 0.28
556 0.27
557 0.25
558 0.21
559 0.24
560 0.22
561 0.19
562 0.19
563 0.18
564 0.17
565 0.13
566 0.11
567 0.07
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.08
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.1
579 0.11
580 0.14
581 0.16
582 0.16
583 0.16
584 0.17
585 0.18
586 0.21
587 0.19
588 0.19
589 0.2
590 0.23
591 0.25
592 0.26
593 0.26
594 0.24
595 0.25
596 0.3
597 0.33
598 0.31
599 0.3
600 0.33
601 0.34
602 0.32
603 0.33
604 0.27
605 0.21
606 0.18
607 0.15
608 0.09
609 0.11
610 0.1
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.09
616 0.13
617 0.17
618 0.21
619 0.25
620 0.32
621 0.33
622 0.34
623 0.36
624 0.42
625 0.44
626 0.46
627 0.52
628 0.5
629 0.5
630 0.52
631 0.56
632 0.49
633 0.44
634 0.41
635 0.42
636 0.46
637 0.45
638 0.45
639 0.45
640 0.52
641 0.57
642 0.6
643 0.57
644 0.57
645 0.55
646 0.52
647 0.49
648 0.39
649 0.32
650 0.27
651 0.25
652 0.18
653 0.19
654 0.21
655 0.23
656 0.24
657 0.24
658 0.24
659 0.22
660 0.22
661 0.25
662 0.23
663 0.21
664 0.2
665 0.2
666 0.19
667 0.16
668 0.14
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.12
675 0.15
676 0.17
677 0.18
678 0.26
679 0.34
680 0.42
681 0.43
682 0.45
683 0.43
684 0.41
685 0.43
686 0.36
687 0.31
688 0.22
689 0.21
690 0.21
691 0.2
692 0.19
693 0.16
694 0.14
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.1
703 0.12
704 0.19
705 0.24
706 0.33
707 0.42
708 0.5
709 0.6
710 0.66
711 0.75
712 0.78
713 0.84
714 0.86
715 0.85
716 0.86
717 0.87
718 0.88
719 0.82
720 0.77
721 0.73
722 0.66
723 0.64
724 0.62
725 0.58
726 0.49
727 0.49
728 0.44
729 0.42
730 0.47
731 0.42
732 0.43
733 0.42
734 0.46
735 0.43
736 0.52
737 0.52
738 0.49
739 0.54
740 0.56
741 0.59
742 0.58
743 0.59
744 0.54
745 0.57
746 0.55
747 0.49
748 0.42
749 0.37
750 0.33
751 0.29
752 0.24
753 0.15
754 0.13
755 0.12
756 0.12
757 0.14
758 0.15
759 0.16
760 0.17
761 0.19
762 0.2
763 0.21
764 0.24
765 0.28
766 0.32
767 0.34
768 0.33
769 0.33
770 0.33
771 0.32
772 0.28
773 0.19
774 0.14
775 0.16
776 0.19
777 0.21