FuNGI

C5DEN0

Protein Details

Accession

C5DEN0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-28	ELPLVRNTKRVRTVRKLRYQYINTLY	Hydrophilic
58-85	GDHNSADATSRRRRRKRRLLSVLGHAET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-75	RRRRRKRR

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
KEGG	lth:KLTH0C10582g -
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MFELPLVRNTKRVRTVRKLRYQYINTLYQEYRKVQSFANANSTLPTPENSAAEEASDGDHNSADATSRRRRRKRRLLSVLGHAETDTELSDMEAEEGSHEADQADSEKEFFTRHEKPQETFEVWNTDRQKAVPMNTATLSYDTCKQIEKHAQKRVSAGMAHISKNANFHFQAMKDGYETVAETPESHHLVHIAQLNELLHTNIMKGKWDTAYRCFSLLIRLPGIDIRSVWGPGARILRELASNDKGLGTSEEFLGWLSGIFSSRSNFNQTMNFLMDPVFRCGSKTHAAKFVVAWLWELLFASCPDGTEHPSAEDASNRKLSHLLERLSEMVLIPPYMEDPEVWFIFAVCHLVSADQLSQRFISTKLRTSELERDISRNQVTQHITNAHMCIRTCEAKKEEFSFPRRIIEEQLACFEKRLYQNSGESTASDLGSGFELDNSPENLDTQNVLGPGMSPMIDEEENFFGSAEQVHFGFDSDSST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.79
3	0.82
4	0.88
5	0.88
6	0.86
7	0.87
8	0.82
9	0.8
10	0.76
11	0.73
12	0.64
13	0.62
14	0.56
15	0.5
16	0.51
17	0.45
18	0.44
19	0.4
20	0.39
21	0.35
22	0.4
23	0.42
24	0.4
25	0.44
26	0.4
27	0.36
28	0.36
29	0.35
30	0.31
31	0.25
32	0.22
33	0.19
34	0.2
35	0.21
36	0.21
37	0.21
38	0.19
39	0.18
40	0.17
41	0.13
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.1
51	0.13
52	0.2
53	0.29
54	0.39
55	0.5
56	0.6
57	0.71
58	0.8
59	0.87
60	0.92
61	0.93
62	0.94
63	0.93
64	0.89
65	0.87
66	0.84
67	0.73
68	0.62
69	0.5
70	0.39
71	0.29
72	0.24
73	0.15
74	0.07
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.05
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.06
89	0.07
90	0.08
91	0.09
92	0.08
93	0.09
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.12
98	0.18
99	0.23
100	0.3
101	0.39
102	0.42
103	0.44
104	0.49
105	0.53
106	0.49
107	0.44
108	0.4
109	0.38
110	0.35
111	0.41
112	0.38
113	0.34
114	0.32
115	0.3
116	0.34
117	0.29
118	0.32
119	0.32
120	0.3
121	0.31
122	0.3
123	0.3
124	0.25
125	0.22
126	0.2
127	0.14
128	0.18
129	0.17
130	0.17
131	0.19
132	0.19
133	0.26
134	0.35
135	0.43
136	0.47
137	0.55
138	0.58
139	0.56
140	0.58
141	0.53
142	0.46
143	0.36
144	0.28
145	0.27
146	0.26
147	0.25
148	0.25
149	0.24
150	0.22
151	0.24
152	0.24
153	0.21
154	0.18
155	0.19
156	0.2
157	0.19
158	0.23
159	0.21
160	0.2
161	0.17
162	0.17
163	0.15
164	0.12
165	0.13
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.08
171	0.11
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.11
177	0.14
178	0.17
179	0.14
180	0.13
181	0.14
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.11
186	0.07
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.1
192	0.1
193	0.12
194	0.14
195	0.18
196	0.2
197	0.23
198	0.27
199	0.26
200	0.26
201	0.25
202	0.22
203	0.23
204	0.24
205	0.21
206	0.17
207	0.16
208	0.15
209	0.16
210	0.17
211	0.12
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.1
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.13
225	0.13
226	0.13
227	0.14
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.1
234	0.11
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.05
243	0.04
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.09
251	0.1
252	0.15
253	0.16
254	0.17
255	0.18
256	0.19
257	0.2
258	0.2
259	0.18
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.16
265	0.14
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.17
270	0.23
271	0.25
272	0.24
273	0.3
274	0.31
275	0.31
276	0.3
277	0.3
278	0.24
279	0.2
280	0.18
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.1
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.13
294	0.13
295	0.14
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.13
300	0.16
301	0.15
302	0.18
303	0.23
304	0.22
305	0.22
306	0.23
307	0.24
308	0.28
309	0.32
310	0.3
311	0.25
312	0.27
313	0.27
314	0.25
315	0.24
316	0.16
317	0.11
318	0.1
319	0.09
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.06
326	0.08
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.1
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.15
349	0.22
350	0.23
351	0.3
352	0.31
353	0.34
354	0.35
355	0.39
356	0.46
357	0.42
358	0.44
359	0.38
360	0.4
361	0.39
362	0.43
363	0.39
364	0.33
365	0.29
366	0.3
367	0.33
368	0.3
369	0.34
370	0.31
371	0.32
372	0.32
373	0.32
374	0.28
375	0.27
376	0.26
377	0.24
378	0.26
379	0.31
380	0.31
381	0.36
382	0.37
383	0.4
384	0.44
385	0.46
386	0.5
387	0.5
388	0.54
389	0.55
390	0.53
391	0.53
392	0.51
393	0.47
394	0.43
395	0.44
396	0.43
397	0.36
398	0.4
399	0.37
400	0.35
401	0.34
402	0.3
403	0.29
404	0.3
405	0.33
406	0.33
407	0.34
408	0.39
409	0.42
410	0.45
411	0.38
412	0.33
413	0.31
414	0.28
415	0.23
416	0.18
417	0.15
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.1
425	0.13
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.15
432	0.15
433	0.13
434	0.14
435	0.13
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.1
442	0.07
443	0.08
444	0.12
445	0.13
446	0.13
447	0.15
448	0.16
449	0.17
450	0.17
451	0.16
452	0.12
453	0.13
454	0.15
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.13
461	0.13

C5DEN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer