FuNGI

C5DCS0

Protein Details

Accession

C5DCS0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-298	EKEAEFKKLKKNSRKRKNENATNVGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-291	KKLKKNSRKRKNE

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	lth:KLTH0B05324g -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MCVDTFSKALLNPEEKPTGIEDNVDVGEISSDEEAENVTHSAEATAAVEESERTSSGESSMLNGAHEVSKSQVSEELPSLDAGEGSSSSEDEDSDDSSSSSSKEEGFLIDGLDEEDEEGDTVHGPIKSKNELNEEPIFEIPEDFELGPDTPIREIGFIKSAFDYNIIVQSVSSAEQRVLKENSLLCLEDRQILGPLCEVFGPLQSPFYRVLLPKSKNEQFEALRSKAGAKVFYVAPEAHWLDTFELKRMRGTDASNGFDEELPEDEQEFSDDEKEAEFKKLKKNSRKRKNENATNVGPIPSKKSVNSAHSKPKPRQVASAAFEYASSSSSYKPRNERQHETSRSTSAISQSQGSYPQQQHVPTPQPQYASQQTFGYPQQVYASHQMYSPPPQPAVQQFGNPFTHPYSQYPQMLPPQHLMPHPQHLPQHPQGQFPGSYPYTQAQSPPQQPVAAQTQNMDQVLQLQQILMNQQRQHQNQSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.35
3	0.35
4	0.34
5	0.32
6	0.28
7	0.26
8	0.21
9	0.21
10	0.21
11	0.2
12	0.16
13	0.11
14	0.11
15	0.09
16	0.1
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.07
25	0.08
26	0.07
27	0.08
28	0.08
29	0.07
30	0.08
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.09
38	0.1
39	0.09
40	0.1
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.14
45	0.12
46	0.14
47	0.16
48	0.16
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.12
55	0.11
56	0.14
57	0.14
58	0.15
59	0.17
60	0.17
61	0.2
62	0.21
63	0.2
64	0.18
65	0.18
66	0.18
67	0.14
68	0.13
69	0.1
70	0.09
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.08
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.09
90	0.1
91	0.11
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.11
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.05
102	0.05
103	0.04
104	0.04
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.05
109	0.08
110	0.09
111	0.1
112	0.13
113	0.18
114	0.22
115	0.25
116	0.29
117	0.34
118	0.34
119	0.39
120	0.4
121	0.37
122	0.34
123	0.31
124	0.28
125	0.2
126	0.19
127	0.13
128	0.1
129	0.11
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.08
138	0.09
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.11
143	0.15
144	0.14
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.09
152	0.12
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.07
161	0.08
162	0.12
163	0.13
164	0.18
165	0.19
166	0.18
167	0.21
168	0.21
169	0.22
170	0.19
171	0.19
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.14
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.11
182	0.11
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.09
191	0.09
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.14
196	0.14
197	0.2
198	0.26
199	0.28
200	0.32
201	0.38
202	0.42
203	0.41
204	0.42
205	0.41
206	0.34
207	0.38
208	0.39
209	0.32
210	0.28
211	0.26
212	0.25
213	0.24
214	0.23
215	0.17
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.14
221	0.11
222	0.1
223	0.13
224	0.13
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.14
230	0.14
231	0.14
232	0.16
233	0.16
234	0.17
235	0.18
236	0.19
237	0.17
238	0.18
239	0.22
240	0.23
241	0.25
242	0.24
243	0.23
244	0.21
245	0.19
246	0.18
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.09
262	0.09
263	0.13
264	0.16
265	0.19
266	0.28
267	0.36
268	0.45
269	0.54
270	0.64
271	0.71
272	0.79
273	0.86
274	0.87
275	0.9
276	0.91
277	0.9
278	0.88
279	0.84
280	0.75
281	0.67
282	0.59
283	0.49
284	0.4
285	0.31
286	0.27
287	0.23
288	0.23
289	0.2
290	0.25
291	0.29
292	0.35
293	0.42
294	0.43
295	0.5
296	0.56
297	0.64
298	0.63
299	0.66
300	0.67
301	0.62
302	0.61
303	0.57
304	0.57
305	0.51
306	0.5
307	0.42
308	0.33
309	0.31
310	0.26
311	0.2
312	0.13
313	0.11
314	0.09
315	0.11
316	0.16
317	0.21
318	0.27
319	0.35
320	0.43
321	0.53
322	0.6
323	0.66
324	0.68
325	0.74
326	0.75
327	0.73
328	0.67
329	0.59
330	0.51
331	0.45
332	0.38
333	0.31
334	0.28
335	0.23
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.22
340	0.23
341	0.27
342	0.25
343	0.28
344	0.29
345	0.3
346	0.32
347	0.35
348	0.4
349	0.38
350	0.42
351	0.4
352	0.39
353	0.4
354	0.43
355	0.44
356	0.41
357	0.37
358	0.33
359	0.32
360	0.32
361	0.32
362	0.3
363	0.22
364	0.19
365	0.2
366	0.2
367	0.22
368	0.25
369	0.26
370	0.21
371	0.22
372	0.23
373	0.24
374	0.29
375	0.3
376	0.27
377	0.27
378	0.27
379	0.31
380	0.33
381	0.37
382	0.32
383	0.33
384	0.32
385	0.36
386	0.37
387	0.34
388	0.32
389	0.28
390	0.32
391	0.3
392	0.32
393	0.33
394	0.37
395	0.4
396	0.4
397	0.4
398	0.44
399	0.46
400	0.43
401	0.4
402	0.38
403	0.37
404	0.37
405	0.38
406	0.34
407	0.38
408	0.39
409	0.41
410	0.43
411	0.45
412	0.52
413	0.53
414	0.59
415	0.52
416	0.53
417	0.5
418	0.48
419	0.44
420	0.36
421	0.37
422	0.29
423	0.28
424	0.27
425	0.27
426	0.26
427	0.26
428	0.28
429	0.28
430	0.36
431	0.41
432	0.44
433	0.44
434	0.42
435	0.41
436	0.43
437	0.44
438	0.38
439	0.34
440	0.29
441	0.3
442	0.34
443	0.34
444	0.28
445	0.2
446	0.2
447	0.22
448	0.22
449	0.18
450	0.14
451	0.15
452	0.17
453	0.23
454	0.24
455	0.28
456	0.29
457	0.36
458	0.46
459	0.49

C5DCS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer