Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DCR3

Protein Details
Accession C5DCR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-76ANKKEPESESKSSKKKKKTKKKAPGPSYPVNEKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-67KKEPESESKSSKKKKKTKKKAPG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, nucl 10, cyto 9.5, mito_nucl 6.833, mito 2.5, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG lth:KLTH0B05170g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSSDNSFGQFVARNKTAIVASVAAGATAVGAYYYYQQLQRQPANKKEPESESKSSKKKKKTKKKAPGPSYPVNEKGEPDLSNLAELSDEQKDKYAMGLKDKGNEFFKNKKYDEAIQYYSWAIEVKEDPVFYSNRSACYVSLGQQEKVVEDTTAALKLKPDYSKCLLRRASANESLGNFADAMFDLSAVSLYGDFSGASIEPLLERNMNKQSMLVLKEKLEKQQEYKLPSNTSLASFFGIFQPETTFENYDDNSEADKYLLEGLTNLYKRTADGYETADLSFAKARDAFKVLLEQNPEDADLKRKAAIALEHVGIFKFLKNDPISAHEDLKKAVEYFPRPNTYIYMALIMADKGQATEYFDNFEKALKLDPSCAAVYYHRGQMYFITQQFEQAGKDFEKAKELSESNIFPYIQLACLTYREGKFDDSETLFSEARRKFPTAPEVPNFYAETLSDKGDLAGARKQYDIAAKLEDALDGIHVGVSPLIGKATLLSREPSVENFVEATQLFEKACQNDPRSEQAKIGLAQLKLQQEDIDEAIALFEEAADLARSFDEKLQATTFAEATKIQKKIRADPVVSAKIEETLAAYRAQGMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.29
4 0.25
5 0.24
6 0.17
7 0.15
8 0.18
9 0.17
10 0.14
11 0.13
12 0.11
13 0.08
14 0.06
15 0.06
16 0.03
17 0.03
18 0.04
19 0.07
20 0.09
21 0.12
22 0.16
23 0.2
24 0.26
25 0.35
26 0.42
27 0.48
28 0.55
29 0.63
30 0.7
31 0.71
32 0.7
33 0.69
34 0.69
35 0.7
36 0.69
37 0.66
38 0.65
39 0.69
40 0.74
41 0.77
42 0.79
43 0.8
44 0.83
45 0.87
46 0.9
47 0.92
48 0.93
49 0.94
50 0.96
51 0.96
52 0.95
53 0.94
54 0.91
55 0.89
56 0.85
57 0.8
58 0.75
59 0.69
60 0.61
61 0.51
62 0.47
63 0.42
64 0.35
65 0.32
66 0.29
67 0.24
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.21
81 0.26
82 0.23
83 0.29
84 0.36
85 0.36
86 0.43
87 0.45
88 0.46
89 0.43
90 0.46
91 0.45
92 0.47
93 0.52
94 0.54
95 0.53
96 0.53
97 0.53
98 0.55
99 0.57
100 0.55
101 0.51
102 0.43
103 0.44
104 0.38
105 0.33
106 0.26
107 0.19
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.16
118 0.23
119 0.23
120 0.23
121 0.26
122 0.26
123 0.23
124 0.28
125 0.28
126 0.23
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.24
133 0.24
134 0.21
135 0.13
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.15
144 0.19
145 0.23
146 0.24
147 0.28
148 0.33
149 0.42
150 0.43
151 0.5
152 0.47
153 0.45
154 0.48
155 0.49
156 0.5
157 0.46
158 0.45
159 0.39
160 0.37
161 0.36
162 0.3
163 0.24
164 0.17
165 0.12
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.14
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.21
198 0.23
199 0.25
200 0.24
201 0.2
202 0.22
203 0.28
204 0.3
205 0.33
206 0.34
207 0.33
208 0.34
209 0.41
210 0.43
211 0.43
212 0.47
213 0.45
214 0.41
215 0.4
216 0.38
217 0.31
218 0.28
219 0.22
220 0.17
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.14
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.2
310 0.24
311 0.24
312 0.27
313 0.24
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.2
318 0.16
319 0.17
320 0.19
321 0.2
322 0.25
323 0.3
324 0.32
325 0.33
326 0.33
327 0.31
328 0.29
329 0.26
330 0.21
331 0.16
332 0.13
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.13
346 0.14
347 0.15
348 0.14
349 0.15
350 0.12
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.14
361 0.13
362 0.17
363 0.18
364 0.21
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.19
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.19
374 0.2
375 0.22
376 0.21
377 0.17
378 0.13
379 0.15
380 0.13
381 0.15
382 0.18
383 0.17
384 0.21
385 0.21
386 0.21
387 0.23
388 0.23
389 0.23
390 0.23
391 0.24
392 0.21
393 0.24
394 0.22
395 0.17
396 0.18
397 0.16
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.09
402 0.1
403 0.13
404 0.17
405 0.17
406 0.19
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.21
411 0.23
412 0.19
413 0.2
414 0.19
415 0.21
416 0.2
417 0.19
418 0.26
419 0.23
420 0.27
421 0.29
422 0.3
423 0.3
424 0.35
425 0.44
426 0.43
427 0.48
428 0.47
429 0.5
430 0.48
431 0.48
432 0.43
433 0.33
434 0.27
435 0.2
436 0.2
437 0.15
438 0.15
439 0.13
440 0.13
441 0.12
442 0.14
443 0.15
444 0.13
445 0.16
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.19
450 0.19
451 0.23
452 0.23
453 0.21
454 0.2
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.17
459 0.12
460 0.1
461 0.08
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.09
476 0.12
477 0.13
478 0.15
479 0.15
480 0.18
481 0.2
482 0.2
483 0.22
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.16
490 0.18
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.15
495 0.19
496 0.2
497 0.27
498 0.32
499 0.34
500 0.39
501 0.43
502 0.49
503 0.49
504 0.47
505 0.42
506 0.38
507 0.4
508 0.34
509 0.37
510 0.34
511 0.3
512 0.32
513 0.36
514 0.36
515 0.31
516 0.31
517 0.25
518 0.21
519 0.23
520 0.2
521 0.16
522 0.12
523 0.11
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.05
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.1
538 0.13
539 0.18
540 0.18
541 0.21
542 0.22
543 0.24
544 0.24
545 0.25
546 0.23
547 0.18
548 0.18
549 0.18
550 0.22
551 0.28
552 0.33
553 0.33
554 0.38
555 0.43
556 0.51
557 0.59
558 0.61
559 0.56
560 0.58
561 0.65
562 0.66
563 0.62
564 0.53
565 0.43
566 0.36
567 0.34
568 0.26
569 0.19
570 0.14
571 0.15
572 0.14
573 0.14