Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DN84

Protein Details
Accession C5DN84    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
601-626ASDVSRRKKLLVKQKEGKKQMKSVGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
591-593RRK
604-619VSRRKKLLVKQKEGKK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11.333, cyto_nucl 6.333, cyto 6, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006297  EF-4  
IPR035647  EFG_III/V  
IPR000640  EFG_V-like  
IPR031157  G_TR_CS  
IPR038363  LepA_C_sf  
IPR013842  LepA_CTD  
IPR035654  LepA_IV  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR000795  T_Tr_GTP-bd_dom  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
GO:0006412  P:translation  
KEGG lth:KLTH0G14938g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00679  EFG_C  
PF00009  GTP_EFTU  
PF06421  LepA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00301  G_TR_1  
PS51722  G_TR_2  
CDD cd03699  EF4_II  
cd16260  EF4_III  
cd01890  LepA  
cd03709  lepA_C  
Amino Acid Sequences MRRLRSLYLQSSICFRRFNHYSAKDTEALQRRLEQIPIENYRNFSIVAHVDHGKSTLSDRLLEFTGVIKAGDSNRQVLDKLEVERERGITIKAQTCTMFYYDKRRNKDYLLHLVDTPGHVDFRAEVSRSYASCGGALLLVDASQGVQAQTVANFYLAYSMNLKLIPVINKIDLDSANIPQAEAQIESTFELPRAEIIRVSAKTGINVKEDLLPAIIDRIPPPTGVGKKPFRALLVDSWYDSYLGVVLLVNIVDGVVKKGDRVVSAQTGKKYEIKELGIMYPDKVSMGCLRTGQVGYIVPGMKESKDAKIGDTIMHVGKESVTEVLDGFEDPKPMVFVGAFPADGTEFKSLDEDITRLVLNDRSVSLQRESSNALGQGWRLGFLGSLHASVFKDRLEKEYGSKLIITQPTVPYVIKFTNGEEKIITNPDDFPDLSLRKTRIDSLQEPYVEAIITLPQEYLGAVIKLCENNRGIQKEITYLNVTGQVLLKYEMPLAHLVDDFFGKLKSVSRGYGSLDYEDIGYKASDIVKLELVLNGKSVDALAQVMHRSQVERVGRKWAKKFKEYVKSQLYEVVIQARANNKVIARETIKARRKDVLAKLHASDVSRRKKLLVKQKEGKKQMKSVGNIQINQEAYQAFLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.4
4 0.42
5 0.45
6 0.48
7 0.49
8 0.52
9 0.53
10 0.57
11 0.5
12 0.48
13 0.53
14 0.52
15 0.49
16 0.45
17 0.45
18 0.44
19 0.44
20 0.44
21 0.38
22 0.35
23 0.4
24 0.45
25 0.46
26 0.44
27 0.44
28 0.43
29 0.41
30 0.35
31 0.26
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.24
39 0.24
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.2
46 0.21
47 0.23
48 0.24
49 0.23
50 0.21
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.12
57 0.14
58 0.2
59 0.21
60 0.22
61 0.23
62 0.25
63 0.25
64 0.24
65 0.27
66 0.24
67 0.25
68 0.3
69 0.3
70 0.31
71 0.33
72 0.33
73 0.29
74 0.26
75 0.25
76 0.22
77 0.27
78 0.3
79 0.29
80 0.3
81 0.3
82 0.29
83 0.3
84 0.28
85 0.26
86 0.22
87 0.32
88 0.39
89 0.47
90 0.53
91 0.55
92 0.56
93 0.57
94 0.63
95 0.61
96 0.62
97 0.59
98 0.54
99 0.5
100 0.47
101 0.43
102 0.35
103 0.28
104 0.18
105 0.13
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.13
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.21
116 0.24
117 0.22
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.13
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.12
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.22
188 0.2
189 0.22
190 0.27
191 0.27
192 0.23
193 0.23
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.19
198 0.15
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.17
210 0.2
211 0.24
212 0.31
213 0.34
214 0.36
215 0.39
216 0.39
217 0.34
218 0.32
219 0.3
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.22
224 0.22
225 0.21
226 0.19
227 0.16
228 0.11
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.13
250 0.18
251 0.23
252 0.26
253 0.26
254 0.27
255 0.28
256 0.31
257 0.29
258 0.26
259 0.25
260 0.23
261 0.23
262 0.22
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.13
268 0.12
269 0.1
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.08
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.17
293 0.18
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.05
323 0.04
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.16
354 0.16
355 0.16
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.12
380 0.13
381 0.16
382 0.19
383 0.2
384 0.22
385 0.27
386 0.27
387 0.24
388 0.24
389 0.21
390 0.23
391 0.23
392 0.22
393 0.19
394 0.18
395 0.19
396 0.21
397 0.2
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.14
402 0.14
403 0.14
404 0.22
405 0.22
406 0.23
407 0.2
408 0.21
409 0.21
410 0.23
411 0.22
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.18
419 0.18
420 0.19
421 0.23
422 0.24
423 0.24
424 0.25
425 0.27
426 0.26
427 0.32
428 0.34
429 0.34
430 0.38
431 0.36
432 0.35
433 0.32
434 0.26
435 0.19
436 0.16
437 0.11
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.09
451 0.12
452 0.12
453 0.16
454 0.16
455 0.2
456 0.27
457 0.3
458 0.3
459 0.29
460 0.3
461 0.29
462 0.29
463 0.27
464 0.23
465 0.2
466 0.19
467 0.21
468 0.2
469 0.17
470 0.17
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.11
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.12
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.11
492 0.16
493 0.18
494 0.2
495 0.21
496 0.23
497 0.27
498 0.31
499 0.29
500 0.25
501 0.23
502 0.21
503 0.19
504 0.18
505 0.14
506 0.1
507 0.08
508 0.07
509 0.09
510 0.1
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.14
520 0.14
521 0.13
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.14
536 0.22
537 0.28
538 0.33
539 0.34
540 0.43
541 0.49
542 0.55
543 0.64
544 0.66
545 0.66
546 0.68
547 0.75
548 0.74
549 0.79
550 0.77
551 0.77
552 0.76
553 0.7
554 0.63
555 0.6
556 0.51
557 0.42
558 0.38
559 0.33
560 0.25
561 0.24
562 0.26
563 0.25
564 0.27
565 0.27
566 0.29
567 0.25
568 0.29
569 0.31
570 0.34
571 0.34
572 0.36
573 0.42
574 0.5
575 0.57
576 0.57
577 0.58
578 0.58
579 0.59
580 0.63
581 0.63
582 0.64
583 0.62
584 0.61
585 0.59
586 0.56
587 0.54
588 0.47
589 0.47
590 0.46
591 0.49
592 0.5
593 0.49
594 0.49
595 0.55
596 0.62
597 0.64
598 0.65
599 0.66
600 0.71
601 0.8
602 0.86
603 0.89
604 0.88
605 0.85
606 0.82
607 0.81
608 0.79
609 0.74
610 0.72
611 0.72
612 0.71
613 0.65
614 0.6
615 0.57
616 0.5
617 0.45
618 0.39
619 0.28
620 0.23