Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMN8

Protein Details
Accession C5DMN8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
552-571APVFKQCKCGKNKKVRTLCFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lth:KLTH0G10406g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MTSGQDQIAEAEFDEGYVVVRADSETSEAFENVGEDLDEQDEQDEQDEQDELDEQGDTYDQPYYEKTIKEIAKGDRYPCMICTVEMDFTCHMYACPECYRVFDYECIREWAVKSTQKSVTKTWKCPNCYFEKKDVPLKNRPTCWCGKNIHPEPNPLNPNSCGQTCDAPICVHGCSSTCHLGPHPTCMRMVQTKCRCGKKSKDVFCSEARKHQELFRCGNPCGLTLPCGVHKCQRECHNGVCGECPETIAKEINCYCGLESLPSIKCQDVKIQSKSQDGSGKKWIGAFACSRIRTVEYSCREHSFAEPCKAPPSIAGRIPCPYSPKALKTCPCGETPLENMETPRTKCTDPIPTCDATCGKLLSCGRHRCPFKCHTGTCMEICTCSDKIKCSCNSRPFIVPCKFQGPPRCNTKCESLMSCRRHRCAERCCDGRSLAQVREKKVFLTRDKLDESLVEAQHICLKKCNLKLSCGRHFCQRKCHPGNCPPCLESDSNDLVCPCGKTVAPAPVRCGTVLPPCRNPCIKTLQGPLDCGHPPMPHACHSLDEPCPSCTAPVFKQCKCGKNKKVRTLCFQNNVSCGRVCGKQLVSCHHSCTKTCHREGECQSICKQVCGISRSNCSHICRFKCHTGSPCPDVPCNVTVEVKCGCGHRSSFATCAAHEGQDPADQRPLECTEDCAAARRRLELMEAFGMNTETVQPTEGIVDLAALAEKVTTFQELMLPFTEASLSIFAKQSNWCSQIEEHLNRLMSDISKPSLHFKPMKPPQRHFIHELAQAYKLYCESQDKEPKRSVYVKKTVDSRKPSLSLKEALPLYQSFKNAQKERKLKELERSTTTRILNYTSTGESSPPVAQINGLLIQKVFEGTDEKTIEACFADYLKHTLIKDPNYLKLDSGDVMVFAENYATASINVERDINRVVGHLDLIAKDSFLAEGVTVCRVEQVMAEETNRSDESSVAEAPEDPLFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.06
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.07
23 0.08
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.11
47 0.1
48 0.12
49 0.14
50 0.19
51 0.23
52 0.24
53 0.25
54 0.31
55 0.33
56 0.36
57 0.42
58 0.43
59 0.48
60 0.52
61 0.52
62 0.49
63 0.5
64 0.47
65 0.41
66 0.38
67 0.3
68 0.25
69 0.27
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.26
74 0.21
75 0.22
76 0.22
77 0.19
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.28
87 0.28
88 0.3
89 0.31
90 0.32
91 0.34
92 0.36
93 0.37
94 0.35
95 0.34
96 0.33
97 0.34
98 0.36
99 0.37
100 0.38
101 0.4
102 0.48
103 0.52
104 0.55
105 0.56
106 0.6
107 0.63
108 0.69
109 0.72
110 0.72
111 0.73
112 0.75
113 0.74
114 0.73
115 0.74
116 0.71
117 0.71
118 0.72
119 0.7
120 0.74
121 0.75
122 0.72
123 0.72
124 0.76
125 0.75
126 0.73
127 0.72
128 0.69
129 0.69
130 0.65
131 0.63
132 0.57
133 0.57
134 0.61
135 0.63
136 0.67
137 0.62
138 0.66
139 0.63
140 0.67
141 0.64
142 0.55
143 0.51
144 0.43
145 0.44
146 0.4
147 0.36
148 0.28
149 0.25
150 0.27
151 0.25
152 0.25
153 0.23
154 0.19
155 0.2
156 0.19
157 0.17
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.13
162 0.17
163 0.2
164 0.19
165 0.2
166 0.22
167 0.3
168 0.3
169 0.36
170 0.36
171 0.33
172 0.33
173 0.33
174 0.37
175 0.37
176 0.41
177 0.43
178 0.47
179 0.54
180 0.61
181 0.69
182 0.69
183 0.69
184 0.74
185 0.75
186 0.77
187 0.77
188 0.78
189 0.74
190 0.74
191 0.73
192 0.73
193 0.65
194 0.63
195 0.6
196 0.54
197 0.51
198 0.52
199 0.53
200 0.5
201 0.52
202 0.5
203 0.48
204 0.45
205 0.47
206 0.42
207 0.34
208 0.31
209 0.26
210 0.2
211 0.18
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.23
216 0.27
217 0.34
218 0.37
219 0.42
220 0.49
221 0.52
222 0.53
223 0.56
224 0.56
225 0.51
226 0.48
227 0.44
228 0.37
229 0.3
230 0.27
231 0.24
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.2
238 0.21
239 0.23
240 0.22
241 0.22
242 0.2
243 0.18
244 0.18
245 0.13
246 0.14
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.2
253 0.2
254 0.27
255 0.3
256 0.37
257 0.41
258 0.46
259 0.48
260 0.51
261 0.5
262 0.47
263 0.46
264 0.4
265 0.39
266 0.41
267 0.39
268 0.35
269 0.35
270 0.32
271 0.26
272 0.27
273 0.24
274 0.22
275 0.27
276 0.27
277 0.26
278 0.25
279 0.26
280 0.25
281 0.28
282 0.31
283 0.3
284 0.35
285 0.37
286 0.38
287 0.37
288 0.36
289 0.36
290 0.34
291 0.34
292 0.34
293 0.33
294 0.31
295 0.33
296 0.33
297 0.29
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.28
302 0.28
303 0.27
304 0.29
305 0.31
306 0.28
307 0.27
308 0.24
309 0.27
310 0.29
311 0.34
312 0.37
313 0.43
314 0.45
315 0.46
316 0.51
317 0.46
318 0.43
319 0.4
320 0.35
321 0.31
322 0.3
323 0.27
324 0.23
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.26
329 0.24
330 0.25
331 0.24
332 0.22
333 0.24
334 0.28
335 0.34
336 0.31
337 0.36
338 0.38
339 0.36
340 0.35
341 0.36
342 0.32
343 0.23
344 0.22
345 0.17
346 0.12
347 0.17
348 0.18
349 0.22
350 0.3
351 0.36
352 0.39
353 0.46
354 0.51
355 0.48
356 0.54
357 0.54
358 0.55
359 0.55
360 0.52
361 0.48
362 0.47
363 0.47
364 0.41
365 0.38
366 0.28
367 0.2
368 0.2
369 0.2
370 0.16
371 0.17
372 0.17
373 0.19
374 0.22
375 0.28
376 0.33
377 0.37
378 0.45
379 0.5
380 0.52
381 0.51
382 0.54
383 0.51
384 0.54
385 0.5
386 0.44
387 0.38
388 0.39
389 0.38
390 0.37
391 0.42
392 0.38
393 0.4
394 0.48
395 0.49
396 0.46
397 0.47
398 0.49
399 0.44
400 0.42
401 0.4
402 0.38
403 0.43
404 0.48
405 0.54
406 0.53
407 0.51
408 0.54
409 0.57
410 0.57
411 0.57
412 0.59
413 0.59
414 0.58
415 0.58
416 0.53
417 0.49
418 0.42
419 0.39
420 0.34
421 0.3
422 0.32
423 0.34
424 0.34
425 0.37
426 0.36
427 0.31
428 0.32
429 0.35
430 0.31
431 0.35
432 0.34
433 0.35
434 0.36
435 0.35
436 0.3
437 0.23
438 0.23
439 0.2
440 0.18
441 0.15
442 0.13
443 0.13
444 0.17
445 0.18
446 0.15
447 0.13
448 0.16
449 0.21
450 0.25
451 0.33
452 0.3
453 0.34
454 0.42
455 0.46
456 0.53
457 0.52
458 0.49
459 0.5
460 0.58
461 0.55
462 0.58
463 0.58
464 0.6
465 0.62
466 0.65
467 0.64
468 0.64
469 0.7
470 0.63
471 0.58
472 0.48
473 0.42
474 0.41
475 0.34
476 0.26
477 0.23
478 0.22
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.15
483 0.15
484 0.13
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.08
489 0.1
490 0.18
491 0.22
492 0.22
493 0.25
494 0.27
495 0.28
496 0.26
497 0.24
498 0.18
499 0.23
500 0.29
501 0.29
502 0.33
503 0.34
504 0.38
505 0.4
506 0.39
507 0.34
508 0.35
509 0.34
510 0.31
511 0.35
512 0.38
513 0.36
514 0.36
515 0.33
516 0.3
517 0.27
518 0.24
519 0.21
520 0.14
521 0.14
522 0.16
523 0.18
524 0.16
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.19
529 0.21
530 0.2
531 0.2
532 0.2
533 0.17
534 0.18
535 0.17
536 0.16
537 0.13
538 0.16
539 0.16
540 0.24
541 0.3
542 0.29
543 0.39
544 0.44
545 0.51
546 0.56
547 0.63
548 0.63
549 0.69
550 0.78
551 0.78
552 0.82
553 0.79
554 0.79
555 0.78
556 0.75
557 0.71
558 0.65
559 0.57
560 0.51
561 0.49
562 0.42
563 0.32
564 0.26
565 0.21
566 0.2
567 0.18
568 0.19
569 0.18
570 0.2
571 0.22
572 0.27
573 0.3
574 0.29
575 0.32
576 0.33
577 0.34
578 0.32
579 0.37
580 0.42
581 0.45
582 0.46
583 0.5
584 0.48
585 0.55
586 0.58
587 0.61
588 0.53
589 0.47
590 0.46
591 0.46
592 0.43
593 0.34
594 0.3
595 0.24
596 0.26
597 0.27
598 0.3
599 0.27
600 0.34
601 0.36
602 0.39
603 0.39
604 0.39
605 0.42
606 0.46
607 0.45
608 0.45
609 0.48
610 0.52
611 0.51
612 0.53
613 0.52
614 0.53
615 0.55
616 0.53
617 0.52
618 0.47
619 0.43
620 0.4
621 0.36
622 0.28
623 0.25
624 0.21
625 0.19
626 0.17
627 0.19
628 0.19
629 0.17
630 0.17
631 0.16
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.17
636 0.2
637 0.2
638 0.21
639 0.24
640 0.23
641 0.2
642 0.24
643 0.22
644 0.2
645 0.18
646 0.17
647 0.14
648 0.17
649 0.19
650 0.16
651 0.19
652 0.18
653 0.18
654 0.21
655 0.23
656 0.22
657 0.2
658 0.22
659 0.19
660 0.22
661 0.22
662 0.25
663 0.26
664 0.27
665 0.28
666 0.26
667 0.26
668 0.24
669 0.26
670 0.2
671 0.19
672 0.17
673 0.17
674 0.15
675 0.14
676 0.14
677 0.12
678 0.11
679 0.09
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.08
686 0.08
687 0.07
688 0.06
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.04
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.1
703 0.11
704 0.12
705 0.12
706 0.13
707 0.12
708 0.12
709 0.12
710 0.08
711 0.09
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.14
718 0.16
719 0.2
720 0.24
721 0.26
722 0.25
723 0.27
724 0.27
725 0.33
726 0.39
727 0.37
728 0.33
729 0.34
730 0.34
731 0.31
732 0.31
733 0.25
734 0.17
735 0.17
736 0.17
737 0.16
738 0.17
739 0.18
740 0.23
741 0.26
742 0.31
743 0.36
744 0.36
745 0.45
746 0.53
747 0.62
748 0.65
749 0.66
750 0.69
751 0.7
752 0.72
753 0.66
754 0.61
755 0.57
756 0.54
757 0.52
758 0.45
759 0.39
760 0.35
761 0.3
762 0.25
763 0.2
764 0.16
765 0.15
766 0.19
767 0.2
768 0.29
769 0.4
770 0.43
771 0.49
772 0.54
773 0.54
774 0.55
775 0.6
776 0.6
777 0.59
778 0.65
779 0.64
780 0.63
781 0.69
782 0.72
783 0.72
784 0.71
785 0.66
786 0.63
787 0.62
788 0.62
789 0.58
790 0.54
791 0.49
792 0.42
793 0.43
794 0.38
795 0.33
796 0.32
797 0.27
798 0.27
799 0.26
800 0.27
801 0.25
802 0.32
803 0.41
804 0.45
805 0.52
806 0.58
807 0.64
808 0.66
809 0.72
810 0.73
811 0.68
812 0.72
813 0.73
814 0.69
815 0.67
816 0.67
817 0.63
818 0.61
819 0.57
820 0.49
821 0.41
822 0.38
823 0.33
824 0.3
825 0.28
826 0.22
827 0.23
828 0.21
829 0.2
830 0.17
831 0.19
832 0.17
833 0.16
834 0.16
835 0.14
836 0.13
837 0.13
838 0.15
839 0.17
840 0.16
841 0.15
842 0.13
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.11
847 0.08
848 0.11
849 0.12
850 0.19
851 0.19
852 0.2
853 0.2
854 0.2
855 0.2
856 0.17
857 0.16
858 0.1
859 0.09
860 0.11
861 0.12
862 0.15
863 0.17
864 0.2
865 0.2
866 0.27
867 0.33
868 0.36
869 0.43
870 0.43
871 0.49
872 0.48
873 0.48
874 0.42
875 0.37
876 0.35
877 0.27
878 0.25
879 0.17
880 0.13
881 0.13
882 0.13
883 0.11
884 0.08
885 0.08
886 0.06
887 0.06
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.09
892 0.11
893 0.13
894 0.14
895 0.16
896 0.16
897 0.18
898 0.2
899 0.19
900 0.17
901 0.16
902 0.17
903 0.14
904 0.14
905 0.13
906 0.13
907 0.12
908 0.15
909 0.14
910 0.13
911 0.12
912 0.12
913 0.1
914 0.09
915 0.09
916 0.06
917 0.08
918 0.09
919 0.11
920 0.11
921 0.11
922 0.12
923 0.12
924 0.12
925 0.12
926 0.15
927 0.17
928 0.19
929 0.2
930 0.2
931 0.21
932 0.25
933 0.24
934 0.21
935 0.17
936 0.16
937 0.18
938 0.2
939 0.21
940 0.17
941 0.17
942 0.17
943 0.18