Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VYS8

Protein Details
Accession A0A545VYS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-398GCKFTHVKTKCRFKPCLNPHCAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 5, cyto 4, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040366  Nab2/ZC3H14  
IPR043094  Nab2/ZC3H14_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:1900364  P:negative regulation of mRNA polyadenylation  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
Amino Acid Sequences MPVEVAFDSPLATAINTAIQPKLQEVGWASESDASSLAELIVLMLANGKSEEEIATEMAGDLLHLEPGDATAREFSKWLFQQIDELNAQLNGATAAPGEGDVDMDTDSLNAPTGPRAMRNGQRGGRGGRVLGNVNRAMDRTDVLHRVRQNGSERINTHSRQGQRGRGGRMNPRNLQAGLAAGPQQWMMNPNGPQSQADILSMLEHQNQMMFQLSQMMHGVPNGGGYARGQGGKSLFDRVQDPNRRQRKQQNGHQDNAGGGDNAEGGEDMDMSSREPPNPDETICKYNLRCTNKECKFAHQSPAAPPGASVDVNDPCSFGAACKNRKCVGRHPSPATKLAHQSEQDCKFFPNCQNAHCPFKHPSMPLCRNGAGCTTEGCKFTHVKTKCRFKPCLNPHCAFSHEEGQQGGFKDKVWTAGGEHVSDRRFVDDAGAEELVKPDDEMKNDTNQAVEAEAQEDVIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.12
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.18
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.22
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.19
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.04
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.05
52 0.06
53 0.05
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.2
64 0.22
65 0.26
66 0.25
67 0.24
68 0.3
69 0.31
70 0.35
71 0.27
72 0.25
73 0.21
74 0.19
75 0.18
76 0.11
77 0.1
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.17
104 0.23
105 0.3
106 0.36
107 0.42
108 0.42
109 0.46
110 0.48
111 0.47
112 0.45
113 0.39
114 0.33
115 0.29
116 0.28
117 0.27
118 0.25
119 0.27
120 0.24
121 0.24
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.16
129 0.21
130 0.22
131 0.27
132 0.28
133 0.32
134 0.33
135 0.36
136 0.38
137 0.39
138 0.4
139 0.41
140 0.4
141 0.41
142 0.45
143 0.4
144 0.38
145 0.37
146 0.37
147 0.4
148 0.44
149 0.45
150 0.47
151 0.52
152 0.54
153 0.53
154 0.55
155 0.56
156 0.6
157 0.6
158 0.55
159 0.52
160 0.5
161 0.45
162 0.4
163 0.3
164 0.22
165 0.16
166 0.13
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.13
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.18
226 0.27
227 0.33
228 0.37
229 0.44
230 0.53
231 0.55
232 0.59
233 0.65
234 0.67
235 0.69
236 0.72
237 0.73
238 0.69
239 0.68
240 0.62
241 0.53
242 0.42
243 0.34
244 0.26
245 0.14
246 0.09
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.18
266 0.19
267 0.21
268 0.24
269 0.27
270 0.27
271 0.3
272 0.26
273 0.32
274 0.39
275 0.41
276 0.41
277 0.43
278 0.52
279 0.53
280 0.62
281 0.55
282 0.55
283 0.57
284 0.57
285 0.58
286 0.51
287 0.49
288 0.43
289 0.49
290 0.42
291 0.33
292 0.29
293 0.24
294 0.22
295 0.19
296 0.16
297 0.13
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.1
306 0.17
307 0.22
308 0.31
309 0.35
310 0.41
311 0.45
312 0.51
313 0.55
314 0.56
315 0.58
316 0.6
317 0.64
318 0.66
319 0.69
320 0.67
321 0.69
322 0.63
323 0.57
324 0.54
325 0.49
326 0.46
327 0.4
328 0.4
329 0.43
330 0.45
331 0.43
332 0.36
333 0.35
334 0.32
335 0.36
336 0.38
337 0.39
338 0.35
339 0.37
340 0.45
341 0.48
342 0.54
343 0.49
344 0.49
345 0.43
346 0.48
347 0.5
348 0.44
349 0.47
350 0.5
351 0.55
352 0.55
353 0.55
354 0.51
355 0.46
356 0.45
357 0.4
358 0.31
359 0.25
360 0.22
361 0.2
362 0.22
363 0.22
364 0.21
365 0.21
366 0.22
367 0.25
368 0.33
369 0.35
370 0.41
371 0.5
372 0.6
373 0.66
374 0.72
375 0.76
376 0.74
377 0.8
378 0.82
379 0.83
380 0.8
381 0.73
382 0.68
383 0.64
384 0.59
385 0.5
386 0.44
387 0.41
388 0.34
389 0.34
390 0.31
391 0.29
392 0.29
393 0.28
394 0.26
395 0.19
396 0.18
397 0.2
398 0.2
399 0.23
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.27
404 0.28
405 0.26
406 0.27
407 0.28
408 0.27
409 0.28
410 0.27
411 0.22
412 0.21
413 0.19
414 0.21
415 0.19
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.19
420 0.18
421 0.2
422 0.17
423 0.14
424 0.12
425 0.14
426 0.17
427 0.2
428 0.26
429 0.27
430 0.33
431 0.36
432 0.36
433 0.31
434 0.28
435 0.26
436 0.21
437 0.2
438 0.14
439 0.13
440 0.12