Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E226

Protein Details
Accession C5E226    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-77KNEAGAKDERKPKKKAAKQRVVKKEPKPEKVPTRRSRRLMGESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-72AKDERKPKKKAAKQRVVKKEPKPEKVPTRRSRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG lth:KLTH0H01628g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MGELSEFQKRRLENIKRNNDLLKKLNLSGVSNQIKNEAGAKDERKPKKKAAKQRVVKKEPKPEKVPTRRSRRLMGESADGKEVPHVSDYELLKGSRSNDPELLDNLKSTALVGDVKLSDLLKSEDENELLARFQNYNSKGFSSGDFFKELQKHQKVSEDIQELQQEFNLELYEIFQPNEIKIVQDRISALFFHPSVDQKLVVGGDTTGHVGLWNVIDEEPNDDLAEPDITTVQLFSKNVAKIDVYPTDPGKLLTASYDGMIRSIQLDSLKSEELLSLKNEYDESLGVSDFQFSYENPNEIFLTTLSGEFTTFDTRTKPTSINLRRLADKKIGSFSINPKRPYEIATGSLDRTLKIWDLRKTVKNPEWSAFDDYSSHEVVSTYDSRLSVSAVSYSPLDGSLVCNGYDDTLRIFDVKDVPPQDLQPKLTLKHNCQTGRWTSILKARFKANMDVFAIANMSRAIDIYHSSGQQLAHLKTATVPAVVSWHPLKNWIVGGNSSGKVFLFQSPNKDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.73
3 0.73
4 0.77
5 0.79
6 0.75
7 0.72
8 0.67
9 0.65
10 0.58
11 0.54
12 0.54
13 0.47
14 0.44
15 0.4
16 0.44
17 0.42
18 0.4
19 0.38
20 0.37
21 0.35
22 0.32
23 0.33
24 0.24
25 0.21
26 0.27
27 0.31
28 0.37
29 0.47
30 0.56
31 0.59
32 0.65
33 0.72
34 0.75
35 0.81
36 0.83
37 0.85
38 0.86
39 0.88
40 0.92
41 0.93
42 0.92
43 0.91
44 0.89
45 0.89
46 0.88
47 0.87
48 0.83
49 0.82
50 0.83
51 0.85
52 0.87
53 0.86
54 0.86
55 0.87
56 0.85
57 0.83
58 0.8
59 0.77
60 0.73
61 0.66
62 0.64
63 0.58
64 0.54
65 0.49
66 0.4
67 0.32
68 0.28
69 0.26
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.22
79 0.21
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.27
84 0.28
85 0.28
86 0.29
87 0.31
88 0.32
89 0.32
90 0.26
91 0.23
92 0.2
93 0.17
94 0.16
95 0.13
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.25
127 0.25
128 0.25
129 0.22
130 0.23
131 0.22
132 0.24
133 0.23
134 0.26
135 0.3
136 0.33
137 0.38
138 0.4
139 0.41
140 0.4
141 0.46
142 0.44
143 0.42
144 0.45
145 0.39
146 0.34
147 0.35
148 0.37
149 0.3
150 0.27
151 0.25
152 0.18
153 0.14
154 0.13
155 0.1
156 0.07
157 0.06
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.11
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.17
230 0.18
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.15
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.14
302 0.17
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.29
307 0.35
308 0.42
309 0.47
310 0.47
311 0.5
312 0.52
313 0.52
314 0.48
315 0.44
316 0.37
317 0.34
318 0.32
319 0.28
320 0.3
321 0.35
322 0.4
323 0.44
324 0.44
325 0.41
326 0.44
327 0.42
328 0.42
329 0.38
330 0.3
331 0.27
332 0.29
333 0.29
334 0.26
335 0.28
336 0.25
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.14
341 0.18
342 0.24
343 0.26
344 0.32
345 0.39
346 0.46
347 0.49
348 0.56
349 0.56
350 0.59
351 0.57
352 0.54
353 0.52
354 0.48
355 0.49
356 0.4
357 0.35
358 0.27
359 0.26
360 0.26
361 0.22
362 0.18
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.15
367 0.15
368 0.13
369 0.14
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.08
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.18
401 0.19
402 0.24
403 0.24
404 0.26
405 0.27
406 0.3
407 0.33
408 0.32
409 0.32
410 0.31
411 0.34
412 0.34
413 0.41
414 0.46
415 0.47
416 0.49
417 0.56
418 0.53
419 0.5
420 0.55
421 0.52
422 0.5
423 0.46
424 0.41
425 0.36
426 0.41
427 0.46
428 0.44
429 0.42
430 0.41
431 0.44
432 0.45
433 0.5
434 0.46
435 0.45
436 0.41
437 0.4
438 0.35
439 0.3
440 0.28
441 0.19
442 0.16
443 0.11
444 0.09
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.1
450 0.14
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.2
455 0.2
456 0.23
457 0.28
458 0.24
459 0.26
460 0.25
461 0.25
462 0.24
463 0.28
464 0.24
465 0.18
466 0.17
467 0.13
468 0.17
469 0.17
470 0.2
471 0.2
472 0.22
473 0.22
474 0.27
475 0.28
476 0.28
477 0.3
478 0.29
479 0.28
480 0.25
481 0.28
482 0.29
483 0.29
484 0.25
485 0.23
486 0.19
487 0.19
488 0.2
489 0.23
490 0.26
491 0.28