Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DL71

Protein Details
Accession C5DL71    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-376ISAQRRSSATRRRRSSQKGRRPSMNESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-369ATRRRRSSQKGRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 12, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG lth:KLTH0F10538g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MIHAEARQRSQTPHSPPMSDAYAETLGQMICLLQEYKPGLVTLENITRLCKTLKLESFTDNIDNETIRLSTASKIIVIDMDFHKSDKQVKDVKLVLASNFDNFNYYNDGDNGNILFNSLSCFPNLQTFYYNLRFLTTLDTHSNIETEPGIAAKREKLDLFKYFTELPEYLRAYFKDISIDLDIKTNVDNRFGVYLTHNDKAVAQVGIEECQDHDHRFYEFGYRSSGWINESPDNVTTGVILTLQFYDINMHIPKEAIPHDLLLDWDAQRPYTIVNHCRSTPVSNDFTSTLVPATKFNISNENIELLGELLQWAGWWQQILHPVLQIIKCPAPAPGNETKRRSSSNSTTISAQRRSSATRRRRSSQKGRRPSMNESSMVKDGVVPEFSLSEVMSQPVLEDEDPSEPVDLALNEEYIQLGPGSRCDIHMGVHEWQEFLTKLKGCVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.54
3 0.53
4 0.53
5 0.48
6 0.4
7 0.32
8 0.27
9 0.25
10 0.23
11 0.21
12 0.18
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.08
17 0.06
18 0.09
19 0.1
20 0.08
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.18
30 0.21
31 0.23
32 0.23
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.24
39 0.3
40 0.36
41 0.39
42 0.41
43 0.42
44 0.42
45 0.41
46 0.4
47 0.3
48 0.25
49 0.22
50 0.2
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.1
55 0.11
56 0.1
57 0.11
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.15
66 0.14
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.28
73 0.27
74 0.33
75 0.37
76 0.39
77 0.45
78 0.46
79 0.46
80 0.43
81 0.41
82 0.34
83 0.3
84 0.29
85 0.24
86 0.21
87 0.19
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.21
115 0.26
116 0.29
117 0.29
118 0.23
119 0.23
120 0.21
121 0.2
122 0.23
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.14
131 0.14
132 0.1
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.22
145 0.25
146 0.29
147 0.27
148 0.28
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.22
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.2
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.21
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.11
181 0.16
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.11
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.18
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.14
214 0.15
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.12
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.08
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.14
259 0.19
260 0.22
261 0.27
262 0.29
263 0.29
264 0.32
265 0.32
266 0.29
267 0.28
268 0.28
269 0.27
270 0.25
271 0.27
272 0.25
273 0.24
274 0.22
275 0.18
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.23
285 0.23
286 0.24
287 0.24
288 0.23
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.1
293 0.09
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.08
305 0.14
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.23
321 0.29
322 0.37
323 0.44
324 0.48
325 0.49
326 0.51
327 0.54
328 0.53
329 0.52
330 0.52
331 0.53
332 0.53
333 0.51
334 0.51
335 0.53
336 0.55
337 0.51
338 0.44
339 0.39
340 0.37
341 0.41
342 0.47
343 0.5
344 0.54
345 0.6
346 0.66
347 0.7
348 0.78
349 0.82
350 0.84
351 0.85
352 0.86
353 0.86
354 0.86
355 0.88
356 0.84
357 0.81
358 0.79
359 0.73
360 0.66
361 0.58
362 0.56
363 0.48
364 0.42
365 0.34
366 0.26
367 0.22
368 0.21
369 0.18
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.13
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.12
392 0.13
393 0.14
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.13
401 0.1
402 0.11
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.2
411 0.21
412 0.2
413 0.25
414 0.28
415 0.27
416 0.32
417 0.31
418 0.28
419 0.27
420 0.29
421 0.24
422 0.22
423 0.25
424 0.22