FuNGI

A0A545VDM0

Protein Details

Accession

A0A545VDM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-123	EPVDIAAPRKERKRKRKDENEDLEGKY	Basic
392-415	FPPMLPRKLRVTRAKDPRKTNQAV	Hydrophilic
501-532	ASSRDALPKDLKKKVKTKRARPTTRSARRGAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-113	PRKERKRKRK
399-411	KLRVTRAKDPRKT
418-419	AK
431-442	KGNERGAGNRKA
499-539	RRASSRDALPKDLKKKVKTKRARPTTRSARRGADWKKKPGK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5.5, cyto_mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12394 RRM1_RBM34

Amino Acid Sequences

MGKKTSLLASSKAVDPHLEALFASSSGPVSAPPSSRYQSLRNNKAKSAAGNDESGDDDVLSETSEQLDYEDDEENDNGSGEDDSETSAEEESSAAEEPVDIAAPRKERKRKRKDENEDLEGKYLASLSKDDDDKPSGKRVKSEDTKKGTDSDDSDSDDDADKEDLPTHESLSKEAQAAETNKAARTVFLANVSAEAVSSKAAKKQLLAHLSAALDKDDYPIQKIESIRFRSVAFSTGSMPKRAAYITKSVMEATTHSTNAYVVFSTDAAARRVCQQLNGSEVLGRHIRVDSVAHPSPTDHRRCIFVGNLGFVDDETVLNNAGKDGEKESKKRNKVPSDVEEGLWRTFSKHGKVENVRVVRDPKTRVGKGFAYVQFYDANTVEEALLLDGKSFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTNQAVERAKSKFNNNSGSGSKGNERGAGNRKASQKRAANYVPKMTPDQQAAAGRAGKLFGRARAAGAQGNGVALPNGVKAPERIVFEGRRASSRDALPKDLKKKVKTKRARPTTRSARRGADWKKKPGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.26
3	0.27
4	0.24
5	0.21
6	0.17
7	0.17
8	0.17
9	0.15
10	0.14
11	0.09
12	0.09
13	0.09
14	0.09
15	0.08
16	0.11
17	0.14
18	0.16
19	0.19
20	0.25
21	0.27
22	0.32
23	0.36
24	0.41
25	0.48
26	0.56
27	0.64
28	0.67
29	0.7
30	0.67
31	0.69
32	0.65
33	0.58
34	0.55
35	0.52
36	0.45
37	0.41
38	0.39
39	0.34
40	0.32
41	0.28
42	0.21
43	0.13
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.09
55	0.09
56	0.11
57	0.13
58	0.12
59	0.14
60	0.14
61	0.15
62	0.14
63	0.13
64	0.11
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.08
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.08
80	0.08
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.08
89	0.12
90	0.18
91	0.24
92	0.33
93	0.43
94	0.54
95	0.65
96	0.74
97	0.81
98	0.87
99	0.92
100	0.93
101	0.94
102	0.92
103	0.88
104	0.83
105	0.73
106	0.63
107	0.52
108	0.41
109	0.3
110	0.22
111	0.15
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.14
116	0.16
117	0.17
118	0.21
119	0.24
120	0.26
121	0.28
122	0.35
123	0.38
124	0.37
125	0.41
126	0.43
127	0.49
128	0.56
129	0.62
130	0.63
131	0.63
132	0.65
133	0.61
134	0.59
135	0.5
136	0.44
137	0.37
138	0.32
139	0.28
140	0.27
141	0.26
142	0.23
143	0.23
144	0.2
145	0.18
146	0.14
147	0.12
148	0.1
149	0.09
150	0.12
151	0.11
152	0.12
153	0.13
154	0.13
155	0.16
156	0.16
157	0.17
158	0.18
159	0.19
160	0.17
161	0.17
162	0.16
163	0.18
164	0.2
165	0.2
166	0.2
167	0.2
168	0.19
169	0.21
170	0.2
171	0.15
172	0.16
173	0.15
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.1
181	0.08
182	0.07
183	0.05
184	0.05
185	0.07
186	0.07
187	0.11
188	0.14
189	0.15
190	0.17
191	0.23
192	0.29
193	0.31
194	0.32
195	0.29
196	0.27
197	0.27
198	0.26
199	0.2
200	0.13
201	0.1
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.15
210	0.16
211	0.2
212	0.25
213	0.29
214	0.29
215	0.29
216	0.29
217	0.27
218	0.27
219	0.25
220	0.17
221	0.14
222	0.15
223	0.21
224	0.22
225	0.21
226	0.2
227	0.18
228	0.18
229	0.18
230	0.18
231	0.13
232	0.16
233	0.18
234	0.19
235	0.19
236	0.18
237	0.18
238	0.16
239	0.15
240	0.15
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.12
247	0.11
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.13
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.16
263	0.17
264	0.19
265	0.19
266	0.16
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.1
277	0.09
278	0.15
279	0.16
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.22
284	0.28
285	0.3
286	0.26
287	0.26
288	0.29
289	0.29
290	0.31
291	0.26
292	0.24
293	0.21
294	0.19
295	0.18
296	0.15
297	0.14
298	0.12
299	0.11
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.1
312	0.17
313	0.22
314	0.26
315	0.36
316	0.44
317	0.51
318	0.59
319	0.65
320	0.65
321	0.68
322	0.71
323	0.66
324	0.65
325	0.6
326	0.52
327	0.45
328	0.39
329	0.32
330	0.25
331	0.2
332	0.14
333	0.17
334	0.21
335	0.22
336	0.25
337	0.28
338	0.36
339	0.41
340	0.46
341	0.49
342	0.49
343	0.45
344	0.45
345	0.45
346	0.42
347	0.43
348	0.4
349	0.39
350	0.45
351	0.46
352	0.44
353	0.46
354	0.41
355	0.38
356	0.42
357	0.37
358	0.34
359	0.31
360	0.31
361	0.27
362	0.25
363	0.25
364	0.17
365	0.16
366	0.11
367	0.11
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.06
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.15
381	0.21
382	0.28
383	0.35
384	0.4
385	0.48
386	0.55
387	0.64
388	0.65
389	0.68
390	0.71
391	0.74
392	0.81
393	0.8
394	0.81
395	0.81
396	0.82
397	0.77
398	0.74
399	0.72
400	0.71
401	0.7
402	0.65
403	0.64
404	0.57
405	0.59
406	0.57
407	0.55
408	0.54
409	0.54
410	0.57
411	0.51
412	0.53
413	0.49
414	0.49
415	0.43
416	0.37
417	0.35
418	0.32
419	0.3
420	0.3
421	0.29
422	0.32
423	0.39
424	0.44
425	0.43
426	0.45
427	0.53
428	0.56
429	0.6
430	0.62
431	0.61
432	0.57
433	0.62
434	0.63
435	0.63
436	0.61
437	0.63
438	0.56
439	0.52
440	0.54
441	0.49
442	0.46
443	0.4
444	0.37
445	0.34
446	0.35
447	0.34
448	0.33
449	0.31
450	0.27
451	0.24
452	0.24
453	0.19
454	0.22
455	0.23
456	0.22
457	0.25
458	0.25
459	0.27
460	0.29
461	0.31
462	0.27
463	0.25
464	0.23
465	0.17
466	0.17
467	0.15
468	0.12
469	0.1
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.09
476	0.1
477	0.14
478	0.18
479	0.22
480	0.24
481	0.3
482	0.31
483	0.35
484	0.42
485	0.4
486	0.4
487	0.4
488	0.42
489	0.42
490	0.46
491	0.51
492	0.48
493	0.54
494	0.58
495	0.63
496	0.67
497	0.7
498	0.72
499	0.72
500	0.77
501	0.8
502	0.82
503	0.84
504	0.87
505	0.89
506	0.91
507	0.93
508	0.9
509	0.9
510	0.91
511	0.9
512	0.87
513	0.82
514	0.78
515	0.73
516	0.76
517	0.76
518	0.76
519	0.74

A0A545VDM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer