Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNI9

Protein Details
Accession C5DNI9    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-89IKCINCSQRGHRKRNCPHVICHydrophilic
116-140GHYRSQCPHKWKRVKCVHCNSKNHSHydrophilic
252-278EESSGARSKKSKKRKRDSDKNYSSSPHHydrophilic
295-315KPSSRGNVLPTKKNKKSELRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-267RSKKSKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG lth:KLTH0G17424g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MASLLSESETQDTLPFFEDTAPSFESNERILAPSIDEVDSNPEDLRTLRGSGRYFGVEDPSDAVQKAEIKCINCSQRGHRKRNCPHVICSYCGLMDDHYSQQCPKAIKCANCNGEGHYRSQCPHKWKRVKCVHCNSKNHSRDRCPSIWRSYYLLDSNVRRVLPVHKIFCYNCGGKGHFGDDCWEYRSSRVPNEDGSAFSGENLPQELKADYFRHLDNAGTEYRDSFSLYPEQKKNSHQASGGRRFNEAYYDEESSGARSKKSKKRKRDSDKNYSSSPHNSNFYPPPYQRSKSVPKPSSRGNVLPTKKNKKSELRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.12
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.19
8 0.2
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.17
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.18
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.23
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.26
41 0.25
42 0.23
43 0.26
44 0.2
45 0.19
46 0.2
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.13
52 0.18
53 0.18
54 0.22
55 0.25
56 0.25
57 0.28
58 0.35
59 0.39
60 0.39
61 0.41
62 0.44
63 0.52
64 0.61
65 0.68
66 0.69
67 0.74
68 0.78
69 0.86
70 0.87
71 0.8
72 0.75
73 0.76
74 0.7
75 0.62
76 0.55
77 0.44
78 0.34
79 0.3
80 0.25
81 0.15
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.19
89 0.22
90 0.22
91 0.19
92 0.25
93 0.3
94 0.34
95 0.39
96 0.45
97 0.45
98 0.45
99 0.45
100 0.39
101 0.41
102 0.38
103 0.36
104 0.3
105 0.29
106 0.28
107 0.34
108 0.35
109 0.37
110 0.45
111 0.53
112 0.59
113 0.63
114 0.72
115 0.76
116 0.8
117 0.81
118 0.83
119 0.83
120 0.82
121 0.83
122 0.79
123 0.79
124 0.78
125 0.75
126 0.71
127 0.66
128 0.64
129 0.64
130 0.62
131 0.56
132 0.54
133 0.53
134 0.49
135 0.44
136 0.4
137 0.34
138 0.32
139 0.28
140 0.25
141 0.22
142 0.2
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.23
150 0.28
151 0.27
152 0.26
153 0.3
154 0.3
155 0.32
156 0.32
157 0.25
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.2
162 0.21
163 0.2
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.13
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.21
174 0.21
175 0.23
176 0.25
177 0.24
178 0.24
179 0.27
180 0.26
181 0.21
182 0.2
183 0.18
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.15
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.11
213 0.12
214 0.19
215 0.24
216 0.31
217 0.34
218 0.38
219 0.4
220 0.45
221 0.51
222 0.48
223 0.47
224 0.43
225 0.46
226 0.52
227 0.58
228 0.59
229 0.52
230 0.49
231 0.46
232 0.43
233 0.39
234 0.3
235 0.24
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.23
240 0.22
241 0.2
242 0.25
243 0.23
244 0.21
245 0.26
246 0.36
247 0.45
248 0.57
249 0.64
250 0.7
251 0.79
252 0.88
253 0.92
254 0.94
255 0.94
256 0.94
257 0.94
258 0.88
259 0.81
260 0.74
261 0.67
262 0.64
263 0.6
264 0.54
265 0.47
266 0.43
267 0.45
268 0.48
269 0.47
270 0.48
271 0.44
272 0.47
273 0.51
274 0.53
275 0.52
276 0.55
277 0.61
278 0.62
279 0.71
280 0.71
281 0.71
282 0.74
283 0.78
284 0.78
285 0.74
286 0.69
287 0.65
288 0.67
289 0.65
290 0.69
291 0.71
292 0.73
293 0.75
294 0.78
295 0.8